当我和加州大学戴维斯分校健康中心的同事着手简化提供者对基因组数据报告的访问时,我们希望这些信息能帮助临床医生提供更好、更个性化的护理。 我们的基因组数据没有操作界面,既不可搜索,也不与患者图表相关联。 如果我们可以在 FHIR(快速医疗互操作性资源)连接器上利用SMART原则在平台之间实现单点登录,我们的护理团队就可以更早地获得数据,患者将能够更好地得到照顾,并在与癌症的斗争中取得积极成果。

而这也是正在实现的事情。 我们支持基因组数据报告的工作为临床医生带来了 50 个离散数据点,这意味着医生用于搜索报告的时间更少,也拥有了更多具有重要洞察力的离散数据,简化了对临床试验信息的访问,最终患者也得到了及时的护理。

但我们并没有停下脚步,这不过是迈向更广阔数字领域的第一步。在 InterSystems 的帮助下,我们拥有了规模越来越大、类型更多样的数据集。

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痴呆症是一个重大的全球性问题,困扰着5400万人,到2050年这个数字将上升到1.3亿。由英国剑桥大学的学者创立的Cognetivity Neurosciences公司设计了一个尖端的解决方案,以帮助缓解全球痴呆症的流行。

根植于先进神经科学的简单解决方案

在出现临床症状之前的早期检测,为专家干预和改变生活方式打开了大门,可以减缓痴呆症的发展,提高生活质量。生活方式的改变有可能将症状的出现推迟五年,进而将普通人群中的痴呆症发病率降低50%。

Cognetivity Neurosciences的综合认知评估测试(ICA)是基于人类对动物刺激的强烈反应,以及健康的大脑在不到200毫秒内处理动物图像的能力。

ICA将基于云的人工智能和神经科学的进展结合起来,进行快速的动物/非动物视觉分类测试,目的是在记忆症状出现之前发现疾病的迹象。它涉及在阿尔茨海默症的前症状阶段受到影响的大脑区域,并检测出信息处理速度的细微损伤。

ICA基于云的敏捷性使临床医生和用户能够在熟悉的硬件上进行ICA测试,如iPad和智能手机,并在任何有互联网连接的地方进行。

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此文章也是对问题 在不重建的情况下插入索引Inserting an index without reconstruction 的一种解释

在使用SQL语言对 InterSystems IRIS 中的表进行查询时,有时候会发现返回的结果与实际有出入,特别是使用count() 函数,或者select 查询时,返回的结果少于实际应返回的值。
这种情况往往是由于数据表格的索引值出了问题。

索引出问题的主要原因可能是:

  • 表中先有数据,后创建的索引定义,并且定义之后没有重新生成索引。
  • 对保存数据的global直接操作。如果是使用对象或者sql的方式操作数据,相应的索引都会自动更新,但是如果直接对global操作,则不会自动更新索引。
  • 对保存索引的global直接操作。

要解决或者要检查是不是索引引发的问题,可以使用%ValidateIndices()函数,它有两种方式使用

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临床研究必须与健康数据相连

就在不久以前,临床科研人员还需要依靠三联的纸质NCR表格,手工收集从堆积如山的手写电子病历中提炼出来的病人数据。从又大又重的《医师案头参考》(PDR)撕下几页,通过传真机发送给FDA,用于药物安全报告。业内专业人士接受了大量的培训,以确保数据经过源文件验证、双键处理,并在经过看似无休止的查询以纠正错误之后,保证其符合目的。

值得庆幸的是,随着电子健康档案的广泛采用,健康数据的数字化,这一过程得到了极大的改善。但是,鉴于临床研究进展缓慢,特别是精美的Excel表格仍由人工数据摘要完成,该领域早该有更多的技术变革,特别是围绕释放医疗互操作性的全部好处。如果我们能做到这一点,生命科学公司将有机会利用宝贵的健康数据来确保病人的安全,优化新药的疗效,并使临床开发过程更加高效,减少错误。

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在InterSystems IRIS数据平台管理门户中,有一些工具用于导入和导出数据。这些工具使用动态SQL,这意味着查询是在运行时准备和执行的。可以导入或导出的行的最大尺寸是3,641,144个字符。

你也可以使用%SQL.Import.Mgr类或LOAD DATA SQL命令导入数据,并使用%SQL.Export.Mgr类导出数据。

从文本文件中导入数据(.csv 和.txt)

你可以从一个文本文件中导入数据到一个合适的InterSystems IRIS类。当你这样做时,系统会在该类的表中创建并保存新的行。该类必须已经存在并且必须被编译。

步骤如下:

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姚 鑫 · 八月 19, 2022 阅读大约需 5 分钟
第六章 配置命名空间(一)

第六章 配置命名空间(一)

命名空间是虚拟工作空间中的数据和程序的集合。在命名空间中,可以定义各种组或人员需要的全局变量Global。例如,如果审计部门需要使用存在于不同系统或不同目录中的某些全局变量Global,可以设置一个单一的命名空间来引用网络上的所有会计全局变量和数据库。

IRIS 带有以下预定义的命名空间:

  • %SYS — 系统管理信息和实用程序。
    -USER — 安装时为空。通常用于应用程序开发。

可以在管理门户的命名空间页面上执行以下过程来配置命名空间,可以通过在主页上依次选择系统管理、配置、系统配置和命名空间来导航到该页面:

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这是InterSystems 2022年全球峰会上InterSystems 医疗行业负责人 Don Wooklock 的分享,他认为,在数字医疗发展如火如荼的当下,经济、消费主义和技术三股力量正在推动医疗行业快速变革。我们面临着压力,但更多的是机遇,利用好市场能量,在具备变革精神的医疗卫生行业中,全力以赴!

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姚 鑫 · 二月 4, 2021 阅读大约需 5 分钟
第二十四章 Caché 变量大全 $ZA 变量

# <center> 第二十四章 Caché 变量大全 $ZA 变量

包含当前设备上最后一次读取的状态。

# 大纲

```java
$ZA
```

# 描述

`$ZA`包含当前设备上最后一次读取的状态。

不能使用`SET`命令修改此特殊变量。尝试这样做会导致`<SYNTAX>`错误。

# 注意

## `$ZA`,带终端I / O

`$ZA`被实现为一系列位标志,每个位表示一条特定的信息。下表显示了可能的值、它们的含义,以及如何使用模(`#`)和整数除(`\`)运算符测试它们:

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姚 鑫 · 二月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
第四十二章 Caché 变量大全 $ZTIMESTAMP 变量

第四十二章 Caché 变量大全 $ZTIMESTAMP 变量

包含协调世界时间格式的当前日期和时间。

大纲

$ZTIMESTAMP
$ZTS

描述

$ZTIMESTAMP包含协调的通用时间值形式的当前日期和时间。这是世界范围内的时间和日期标准;此值很可能与当地的时间(和日期)值不同。

$ZTIMESTAMP将日期和时间表示为以下格式的字符串:

ddddd,sssss.fff

其中ddddd是一个整数,指定自1840年12月31日起的天数;sssss是一个整数,指定自当天午夜以来的秒数,fff是一个可变的数字,指定小数秒。这种格式类似于$HOROLOG,只是$HOROLOG不包含分数秒。

假设当前日期和时间(世界协调时)如下:

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姚 鑫 · 三月 20, 2021 阅读大约需 5 分钟
第十二章 使用嵌入式SQL(四)

第十二章 使用嵌入式SQL(四)

SQL游标

游标是指向数据的指针,该数据允许嵌入式SQL程序对所指向的记录执行操作。通过使用游标,Embedded SQL可以遍历结果集。嵌入式SQL可以使用游标执行查询,该查询从多个记录返回数据。嵌入式SQL还可以使用游标更新或删除多个记录。

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姚 鑫 · 四月 1, 2021 阅读大约需 7 分钟
第十四章 使用SQL Shell界面(三)

第十四章 使用SQL Shell界面(三)

SQL元数据、查询计划和性能指标

显示元数据

SQL Shell支持MMetadata命令以显示有关当前查询的元数据信息。

对于每个结果集项目,此命令列出以下元数据:列名称(SQL字段名称),键入(ODBC数据类型整数代码),PRE(精度或最大长度),比例(最大分数数字),NULL(BOOLEAN:1 = NULL允许,0 =不允许空值),标签(标题标签,请参阅列别名),表(SQL表名称),架构(架构名称),CTYPE(客户端数据类型,请参阅%SQL.statementColumn ClientType属性)。

SHOW STATEMENT

可以执行查询,然后发出show语句或显示st以显示准备好的SQL语句。默认情况下,必须执行查询。可以避免通过设置executemode =延迟执行查询,从而发出查询,然后发出show语句sql shell命令。

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姚 鑫 · 四月 17, 2021 阅读大约需 6 分钟
第二章 定义和构建索引(五)

第二章 定义和构建索引(五)

验证索引

可以使用以下任一方法验证索引
- $SYSTEM.OBJ.ValidateIndices()验证表的索引,还验证该表的集合子表中的任何索引。
- %Library.Storage.%ValidateIndices()验证表的索引。集合子表索引必须使用单独的%ValidateIndices()调用进行验证。

这两种方法都会检查指定表的一个或多个索引的数据完整性,并可以选择更正发现的任何索引完整性问题。他们分两步执行索引验证:
1. 确认为表(类)中的每一行(对象)正确定义了索引实体。
2. 遍历每个索引,对于索引的每个条目,确保表(类)中有一个值和匹配的条目。

如果这两种方法中的任何一种发现不一致,它都可以有选择地更正索引结构和/或内容。它可以验证标准索引、位图索引、位图范围索引和位片索引,并可选择对其进行校正。默认情况下,这两种方法都会验证索引,但不会更正索引。

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姚 鑫 · 五月 3, 2021 阅读大约需 6 分钟
第二章 全局变量结构(一)

第二章 全局变量结构(一)

本章描述全局变量的逻辑视图,并概述全局变量是如何在磁盘上物理存储的。

全局变量的逻辑结构

全局变量是存储在物理InterSystems IRIS®数据库中的命名多维数组。
在应用程序中,全局变量到物理数据库的映射基于当前名称空间——名称空间提供一个或多个物理数据库的逻辑统一视图。

全局命名约定和限制

全局名称指定其目标和用途。有两种类型的全局变量和一组单独的变量,称为“进程私有全局变量”:
- 全局变量 - 这就是所谓的标准全局变量;通常,这些变量被简称为全局变量。它是驻留在当前命名空间中的永久性多维数组。
- 扩展全局引用-这是位于当前命名空间以外的命名空间中的全局引用。
- 进程私有全局变量-这是一个数组变量,只有创建它的进程才能访问。

全局变量的命名约定如下:

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姚 鑫 · 五月 10, 2021 阅读大约需 5 分钟
第四章 多维存储的SQL和对象使用(二)

第四章 多维存储的SQL和对象使用(二)

索引

持久化类可以定义一个或多个索引;其他数据结构用于提高操作(如排序或条件搜索)的效率。InterSystems SQL在执行查询时使用这些索引。InterSystems IRIS对象和SQL在执行INSERTUPDATEDELETE操作时自动维护索引内的正确值。

标准索引的存储结构

标准索引将一个或多个属性值的有序集与包含属性的对象的对象ID值相关联。

例如,假设我们定义了一个简单的持久化MyApp.Person类,该类具有两个文本属性和一个关于其Name属性的索引:

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Michael Lei · 五月 24, 2021 阅读大约需 7 分钟
InterSystems 数据平台和性能 – 第 1 篇

您的应用程序已部署,一切运行正常。 很好,击个掌! 然后电话突然响个不停 – 用户投诉应用程序有时很“慢”。 这是什么意思? 有时? 您有哪些工具,查找和解决这个缓慢问题应查看哪些统计数据? 您的系统基础架构是否能承担用户负载的任务? 在投入生产之前,应该询问哪些基础架构设计问题? 如何自信地为新硬件规划容量,而不会过度规定? 如何停止电话铃声? 如何一开始就不让它响?

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姚 鑫 · 六月 3, 2021 阅读大约需 10 分钟
第十五章 Caché WebSocket

第十五章 Caché WebSocket

使用WebSockets (RFC 6455)

web是围绕请求/响应范例构建的:客户机向服务器发送请求,服务器通过向客户机发送响应进行响应。此范式和HTTP本身不允许此通信协议的反向形式,即服务器与客户机启动请求/响应周期。已经开发了许多技术来解决了这个问题,即服务器可以启动与客户机的对话。这些技术通常被称为基于推送或 comet-based的技术,它们都存在不适合在web基础设施上进行全面部署的问题。目前使用的三种主要技术如下所述。

Short Polling 短轮询

使用这种技术,客户端定期发送HTTP请求来检测服务器状态的变化,服务器被编程为立即响应。空响应表示没有变化。

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Louis Lu · 九月 22, 2021 阅读大约需 13 分钟
IRIS 2021 技术文档 First Look 5-- 技术概要:InterSystems SQL

技术概要(First Look)有助于您了解在InterSystems IRIS ®数据平台中如何使用SQL:标准的SQL功能、特有功能以及如何快速上手使用。

要体验技术概要(First Look)的所有内容 ,您可以在InterSystems IRIS的免费评估实例上执行相关操作 ,请参阅InterSystems First Looks(《InterSystems 技术概要》)。

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在这篇文章中,我将解释如何通过使用CSP Web应用程序以及启用/禁用和认证/取消认证任何Web应用程序的代码来进行认证、授权和审计。

应用层

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Jingwei Wang · 七月 25, 2022 阅读大约需 4 分钟
ESB和注册中心概述

本章介绍了使用InterSystems IRIS作为企业服务总线,描述了InterSystems IRIS ESB架构,并提供了部署ESB的概述。

企业服务总线的概念

企业服务总线(ESB)提供了一个单点来访问和管理具有SOAP、REST或其他网络API的应用程序。ESB提供了以下功能。

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Tete Zhang · 十月 26, 2022 阅读大约需 2 分钟
如何导出导入集成平台组件和production?

上线一个新的集成平台production或者组件是需要很多精力的,用户常常需要对每一个组件所满足的需求和所能提供的功能,使用到的协议,以及组件对系统资源的调用有深入细致的了解。在配置好一个production之后,您可能需要将这个production推送到测试或者正式环境,或者需要将一个写好的组件代码应用到不同的项目上。这些时候,production的导出功能可以方便您传输production或组件的配置和代码。

导出

需要导出production时,您可以移步到管理门户 - Interoperability - 相应的命名空间 - 列表 - Production 页面,选择您需要导出的production,再点击页面上的导出键进行导出。如下图1所示:

在弹出的对话框中,您可以选择在导出文件中您想包括的内容。如下图2所示:

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姚 鑫 · 二月 5, 2021 阅读大约需 4 分钟
第二十五章 Caché 变量大全 $ZB 变量

第二十五章 Caché 变量大全 $ZB 变量

包含当前I / O设备的状态信息。

大纲

$ZB

描述

$ZB包含读取操作后特定于当前I / O设备的状态信息

  • 从终端,顺序文件或其他基于字符的I / O设备读取时,$ZB包含读取操作的终止字符。它可以是终止符(例如),如果读取操作不需要终止符,则可以是输入数据的最后一个字符;如果需要终止符但未收到终止符,则可以是空字符串(例如,如果读取操作超时)。
  • 从磁带等基于块的I / O设备读取数据时,$ZB包含I / O缓冲区中剩余的字节数。写入磁带时,$ZB还包含I / O缓冲区中的字节数。

不能使用SET命令修改此特殊变量。尝试这样做会导致<SYNTAX>错误。

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姚 鑫 · 二月 21, 2021 阅读大约需 7 分钟
第四十三章 Caché 变量大全 $ZTIMEZONE 变量

第四十三章 Caché 变量大全 $ZTIMEZONE 变量

包含格林威治子午线的时区偏移量。

大纲

$ZTIMEZONE
$ZTZ

描述

$ZTIMEZONE可以通过两种方式使用:

  • 返回计算机的本地时区偏移量。
  • 为当前进程设置本地时区偏移量。

$ZTIMEZONE包含从格林威治子午线偏移的时区(以分钟为单位)。 (格林威治子午线包括整个英国和爱尔兰。)此偏移量表示为-1440到1440范围内的有符号整数。格林威治以西的时区指定为正数;格林威治东部的时区指定为负数。 (时区必须以分钟为单位,因为并非所有时区都以小时为单位。)默认情况下,$ZTIMEZONE初始化为计算机操作系统设置的时区。

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姚 鑫 · 三月 7, 2021 阅读大约需 17 分钟
第五章 SQL定义表(二)

第五章 SQL定义表(二)

主键

InterSystems IRIS提供了两种方法来唯一标识表中的行:RowID和主键。

可选的主键是一个有意义的值,应用程序可以使用该值唯一地标识表中的行(例如,联接中的行)。主键可以是用户指定的数据字段,也可以是多个数据字段的组合。主键值必须是唯一的,但不必是整数值。 RowID是一个内部用于标识表中行的整数值。通常,主键是由应用程序生成的值,而RowID是由InterSystems IRIS生成的唯一整数值。

系统会自动创建一个主map,以使用RowID字段访问数据行。如果定义主键字段,系统将自动创建并维护主键索引。

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姚 鑫 · 三月 21, 2021 阅读大约需 9 分钟
第十二章 使用嵌入式SQL(五)

第十二章 使用嵌入式SQL(五)

嵌入式SQL变量

以下局部变量在嵌入式SQL中具有特殊用途。这些局部变量名称区分大小写。在过程启动时,这些变量是不确定的。它们由嵌入式SQL操作设置。也可以使用SET命令直接设置它们,或使用NEW命令将其重置为未定义。像任何局部变量一样,值将在过程持续期间或直到设置为另一个值或使用NEW进行定义之前一直存在。例如,某些成功的嵌入式SQL操作未设置%ROWID。执行这些操作后,%ROWID是未定义的或保持设置为其先前值。

  • %msg
  • %ROWCOUNT
  • %ROWID
  • SQLCODE

这些局部变量不是由Dynamic SQL设置的。 (请注意,SQL Shell和Management Portal SQL接口执行Dynamic SQL。)相反,Dynamic SQL设置相应的对象属性。

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