嗨社区,

这篇文章公开介绍我的 iris-fhir-client 客户端应用。

 iris-fhir-client 可以可以借助嵌入式 python 连接到任何开放的 FHIR 服务器 fhirpy 图书馆.

通过终端和使用 CSP Web 应用程序获取资源信息。

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嗨,开发者们!欢迎加入第二届InterSystems技术写作大赛!

🐍 InterSystems技术写作大赛:Python 🐍

6月20日至七月20日 延长至7月31日,在社区撰写一篇利用InterSystems技术使用Python的文章,主题自定。

🎁 撰文即得奖  我们为每一位参与此次写作大赛的作者准备了一份特殊礼品!

🏆 优秀文章大奖  AirPods Max; Apple Watch SE; Apple HomePod mini / Apple Pencil 

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IRIS Interoperability互操作性/HealthConnect(前身是Ensemble)有许多内置的适配器。但是没有一个接收邮件的服务或适配器。我洗的了一个电子邮件服务,通过SMTP接收邮件,这些邮件可以被传递到电子邮件操作。

现在我想对一个使用电子邮件操作向外部邮件服务器发送邮件的Production进行负载测试。邮件服务器团队不希望我向他们发送成千上万的信息。

我创建了iris-mail应用程序来替代邮件服务器。我更新了电子邮件操作中的服务器和端口设置。外发的邮件被发送到替代的邮件服务器,我能够计算出iris-mail中收到的邮件数量,并将其与邮件操作发送的邮件数量进行比较。

应用程序的源代码:https://openexchange.intersystems.com/package/iris-mail

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InterSystems Production 监控是管理门户中的一个页面,用于显示当前运行的Production监控信息。我喜欢这个页面的样子,但这并不适合所有人。

2022年5月13日,我在开发者社区上看到这个帖子。

https://community.intersystems.com/post/creating-custom-monitoring-page

我同意马克的观点,Production监控很复杂。我想创建一个更漂亮干净的监控页面。

我开始着手制作一个利用类方法提供Production数据的 CSP(Cache Server Page)页面。

我与马克分享了我的第一次尝试。他根据自己的想法定制了这个页面。我喜欢他对页面的布局,使其在视觉上更有吸引力。我把他的设计整合到我的应用程序Production监控中。

我看到马克对业务服务的显示进行了过滤,只显示需要注意的服务。他在页面的底部添加了服务器的名称和它的镜像状态。

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我的团队在在红帽OpenShift容器平台上运行IRIS互操作性解决方案。我想在数据被存储在Mirror的数据pods中的情况下,测试运行中的webgateway pods和计算节点 pods能处理多少消息。

为了增加测试难度,我部署了多个feeder容器,并在每个feeder上安排了任务,以在同一时间发送大量的消息。为了进入下一阶段的测试,我希望有多种类型的测试文件可以按需使用。我创建了test-data应用程序,能够请求生成大量的多种类型的文件。

我早期的一些测试依赖于复制一个样本文件和处理它。这在一次只复制一份的情况下效果不错。为了获得同一样本文件的许多副本,MakeFile函数获取一个样本文件、保存其副本、并以唯一的时间戳进行重命名。MakeFiles函数有一个参数,用于确定要制作的文件数量。

我找到了一个样本文件,它的输入和输出都是带分隔符和固定符的。我把它包含在我的应用程序中,并添加了一个转换来操作测试数据文件。在这种情况下,我把测试文件中的识别ID号替换成在一个类方法中生成的识别ID号,并且是随着文件而递增的。

我想在处理后审查测试文件中的数据,我喜欢看到一系列有顺序的数字,而不是一系列随机数字。

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这篇文章是对我的  iris-globals-graphDB 应用的介绍。
在这篇文章中,我将演示如何在Python Flask Web 框架和PYVIS交互式网络可视化库的帮助下,将图形数据保存和抽取到InterSystems Globals中。

建议

 

第一步 : 通过使用Python 原生SDK建立与IRIS Globals的链接

 #create and establish connection
  if not self.iris_connection:
         self.iris_connection = irisnative.createConnection("localhost", 1972, "USER", "superuser", "SYS")
                                     
  # Create an iris object
  self.iris_native = irisnative.createIris(self.iris_connection)
  return self.iris_native

 

第二步 : 使用 iris_native.set( ) 功能把数据保存到Globals 里     

#import nodes data from csv file
isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1nodes")
if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1nodes.csv", newline='') as csvfile:

 reader = csv.DictReader(csvfile)
 for row in reader:
    self.iris_native.set(row["name"], "^g1nodes", row["id"])

 #import edges data from csv file
 isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1edges")
 if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1edges.csv", newline='') as csvfile:
 reader = csv.DictReader(csvfile)
 counter = 0                
 for row in reader:
    counter = counter + 1
    #Save data to globals
    self.iris_native.set(row["source"]+'-'+row["target"], "^g1edges", counter)  

 

第三步: 使用iris_native.get() 功能把节点和边缘数据从Globals传递给PYVIS

 #Get nodes data for basic graph    
  def get_g1nodes(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1nodes")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1nodes",level1_subscript)
            element = {"id": level1_subscript, "label": val, "shape":"circle"}
            result.append(element)            
        return result

    #Get edges data for basic graph  
    def get_g1edges(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1edges")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1edges",level1_subscript)
            element = {"from": int(val.rpartition('-')[0]), "to": int(val.rpartition('-')[2])}
            result.append(element)            
        return result

 

Step4: Use PYVIS Javascript to generate graph data

<script type="text/javascript">
    // initialize global variables.
    var edges;
    var nodes;
    var network;
    var container;
    var options, data;
  
    // This method is responsible for drawing the graph, returns the drawn network
    function drawGraph() {
        var container = document.getElementById('mynetwork');
        let node = JSON.parse('{{ nodes | tojson }}');
        let edge = JSON.parse('{{ edges | tojson }}');
     
        // parsing and collecting nodes and edges from the python
        nodes = new vis.DataSet(node);
        edges = new vis.DataSet(edge);

        // adding nodes and edges to the graph
        data = {nodes: nodes, edges: edges};

        var options = {
            "configure": {
                "enabled": true,
                "filter": [
                "physics","nodes"
            ]
            },
            "nodes": {
                "color": {
                  "border": "rgba(233,180,56,1)",
                  "background": "rgba(252,175,41,1)",
                  "highlight": {
                    "border": "rgba(38,137,233,1)",
                    "background": "rgba(40,138,255,1)"
                  },
                  "hover": {
                    "border": "rgba(42,127,233,1)",
                    "background": "rgba(42,126,255,1)"
                 }
                },

                "font": {
                  "color": "rgba(255,255,255,1)"
                }
              },
            "edges": {
                "color": {
                    "inherit": true
                },
                "smooth": {
                    "enabled": false,
                    "type": "continuous"
                }
            },
            "interaction": {
                "dragNodes": true,
                "hideEdgesOnDrag": false,
                "hideNodesOnDrag": false,
                "navigationButtons": true,
                "hover": true
            },

            "physics": {
                "barnesHut": {
                    "avoidOverlap": 0,
                    "centralGravity": 0.3,
                    "damping": 0.09,
                    "gravitationalConstant": -80000,
                    "springConstant": 0.001,
                    "springLength": 250
                },

                "enabled": true,
                "stabilization": {
                    "enabled": true,
                    "fit": true,
                    "iterations": 1000,
                    "onlyDynamicEdges": false,
                    "updateInterval": 50
                }
            }
        }
        // if this network requires displaying the configure window,
        // put it in its div
        options.configure["container"] = document.getElementById("config");
        network = new vis.Network(container, data, options);
        return network;
    }
    drawGraph();
</script>

 

第五步: 从app.py 主文件调用上面的代码

#Mian route. (index)
@app.route("/")
def index():
    #Establish connection and import data to globals
    irisglobal = IRISGLOBAL()
    irisglobal.import_g1_nodes_edges()
    irisglobal.import_g2_nodes_edges()

    #getting nodes data from globals
    nodes = irisglobal.get_g1nodes()
    #getting edges data from globals
    edges = irisglobal.get_g1edges()

    #To display graph with configuration
    pyvis = True
    return render_template('index.html', nodes = nodes,edges=edges,pyvis=pyvis)    

下面是关于此项目的 介绍视频:

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亲爱的社区开发者们,大家好!

欢迎积极参与新一轮InterSystems开发者竞赛!

随着 InterSystems IRIS 2021.2 预览版 的发布和全新的 LOAD DATA 功能,我们希望将其与最新的竞赛(数据集)结合起来! 

🏆 InterSystems 数据集竞赛🏆

竞赛时间: 2021年12月27日-2022年1月16日

奖金总额: $9,450


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亲爱的社区开发者们,大家好!

我们欢迎您来参加 2021年欧洲医疗编程马拉松 ,这一赛事时间为2021年11月19日-21日,免费参赛,线上赛道(On-line Track)的申请截止日期延长至11月15日。

我们将有一个InterSystems的挑战:“用FHIR创新”。InterSystems赛道的奖金设置如下:

🥇第一名: 1500 EUR
🥈第二名: 1000 EUR
🥉第三名: 500 EUR
我们为所有参加InterSystems挑战的人准备了奖品!

参考下图,了解我们的挑战细节:)你愿意参加吗?请在下面的投票中告诉我们!

 

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亲爱的社区开发者们,大家好!

我们诚挚地邀请您参加与InterSystems开发者竞赛(InterSystems IRIS Analytics)竞赛优胜者交流 online meetup!

日期 & 时间: 美国东部时间2021年9月17日(周五)12:00;北京时间2021年9月18日(周六)0:00-1:00

在此次线上交流会上,您将了解到: 

  • 优胜者简介
  • 优胜者提交项目的简短demo
  • 关于项目中使用到的技术的开放探讨、问答,以及下一场开发者竞赛的安排。

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亲爱的社区开发者们,大家好!

我们真诚邀请您参加 Online Meetup:InterSystems 开发者竞赛(人工智能与机器学习)!

时间: 2021年7月30日(周五) 11:00 AM (美东时间)23:00 (北京时间)

在这场在线Meetup,您将了解到:

  • 此次优胜者的个人履历;
  • 获奖Application的简短Demo;
  • 有关应用技术的开放探讨、问答,以及下次竞赛的一些计划。

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嗨,开发者们, 

你准备好迎接新的挑战了吗? 我们很高兴地宣布第一届InterSystems技术文章写作比赛:

🏆 InterSystems技术文章写作大赛 🏆

从2021年7月15日至8月15日,写一篇与InterSystems技术有关的任何主题的文章!

每个人都有奖品: 在此期间,每个在DC上发表文章的人都将获得一个特别的奖品包!

大奖: Apple iPad

参加我们的新比赛,你的内容将被超过55K的月度读者看到! 详情如下。

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文章
Michael Lei · 五月 13, 2021 阅读大约需 2 分钟
使用 IRIS 跟踪全球疫苗接种情况

2020 年席卷全球的新冠疫情使每个人都在关注与 COVID-19 有关的新闻和数字。

为什么不趁这个机会去创造一些简单直观的东西,来帮助关注全球的疫苗接种数量呢?

为了应对这一挑战,我使用了 Our World in Data 提供的数据,他们的使命是提供解决全球最大问题所需的研究和数据。

他们在 Github 上有一个专门的 COVID-19 数据仓库,我采用了疫苗接种数据来完善我的跟踪器。

如果你不了解他们,去调查一下吧,这值得你花上一些时间。 Github 仓库

应用程序 iris-vaccine-tracker 有三个不同页面。

  1. 主仪表板
  2. 数据表,其中包含仪表板中呈现的数据的详细信息。
  3. 热图

仪表板

主仪表板提供全球疫苗接种情况的快速概览。

第一个小组件提供以下信息:

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亲爱的社区开发者们,大家好!

欢迎积极参与新一轮InterSystems开发者竞赛!

🏆 InterSystems 编程大赛:FHIR 加速器 🏆

提交在AWS上使用InterSystems的IRIS FHIR-as-a-service的应用程序,或帮助使用InterSystems IRIS FHIR加速器开发的解决方案。点击这篇文章,了解如何在AWS上申请应用InterSystems IRIS FHIR 加速器服务 (FHIRaaS) 。

    时间:2021年5月10日-6月6日

    奖金总额: $8,750 

    👉  点击登录活动页面 👈


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    亲爱的社区开发者们,大家好!

    我们很高兴地宣布,新一轮InterSystems开发者竞赛开启了!

    🏆 InterSystems 编程大赛:开发者工具 🏆

    请提交具有如下特性的应用程序——能够加速开发、贡献更多高质量代码、帮助用户测试、部署、支持或监控基于InterSystems IRIS的解决方案。

    间: 2021年3月29日- 4月25日

    Total prize: $8,500 

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