Covid-19 肺部 X 射线分类和 CT 检测演示 关键字:COVID-19,医学影像,深度学习,PACS Viewer 和 HealthShare。

目的

在这场史无前例的新冠疫情笼罩之下, 我们竭尽所能为客户提供支援,同时利用先进的 AI 技术观察着不同的疫情战线。

去年,我简单提及了一个深度学习演示环境。 在这个漫长的复活节周末,我们就来看一看现实世界的图像,在 Covid-19 肺部 X 射线数据集上测试运行一些深度学习模型以进行快速分类,并见证这类用于 X 射线甚至 CT 的工具如何通过 docker 等方式快速部署到云端,实现及时的“AI 分诊”并协助放射科医生。

这只是一个 10 分钟的快速笔记,希望通过简单的方法帮助各位上手实践。

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提到临床医生与信息系统的交互,除外“病历书写”,恐怕最常见的临床场景就是“医嘱开具”了。医嘱是临床医生根据患者病史、体征、检验检查结果下达的医学指令,是医疗过程的重要环节和医疗质量的决定因素。在传统纸质医嘱时代,医生每天花费在医嘱开具、修改和确认等环节上的时间甚至接近于其与患者沟通的时间;且尽管上级医生、药剂师、护士等角色都会在不同阶段参与医嘱审核,依然难以避免医嘱差错的发生。因此,医学信息系统被广泛应用后,提升医嘱开具的便捷性和准确性成为其首当其冲的职责。那么,哪些系统功能是临床医生眼中的医嘱“助力神器”呢?

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· 九月 29, 2021 阅读大约需 9 分钟
第二十九章 SQL命令 DISTINCT

第二十九章 SQL命令 DISTINCT

指定仅返回不同值的SELECT子句。

大纲

SELECT [DISTINCT [BY (item {,item2})] ]  |  [ALL]
  select-item {,select-item2}

参数

  • DISTINCT - 可选-返回组合选择项值唯一的行。
  • DISTINCT BY (item {,item2}) - 可选-返回按(项)值唯一的行的选择项值。
  • ALL - 可选-返回结果集中的所有行。默认设置。

描述

可选DISTINCT子句出现在SELECT关键字之后、可选TOP子句和第一个SELECT-ITEM之前。

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“过敏”是生活中常见的病理表现,大众所熟知的荨麻疹、过敏性鼻炎、花粉症等都是常见的过敏性疾病。“过敏”在医学上归类为变态反应,是机体对外界有害物质(过敏原)的免疫应答,通常发挥保护作用。当变态反应过于激烈,以至于正常身体组织连同被攻击和损害时,则会对健康造成不利。本文将针对临床最为关心的医学信息系统如何支持“药物过敏”的识别、记录和管理进行探讨。

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· 三月 25, 2021 阅读大约需 2 分钟
使用DBeaver连接IRIS数据库

在Caché时代, 比较受欢迎的IRIS数据库客户端是Sqldbx和Winsql, 这两者的共同点是提供ODBC兼容的连接,而且免费。限制也差不多:只能用于Windows环境,只能用ODBC连接。

DBeaver是我最近使用的免费SQL客户端, 推荐给各位。它有几个好处:

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· 九月 22, 2021 阅读大约需 22 分钟
IRIS 2021 技术文档 First Look 3 - 连接一个IDE

InterSystems IRIS 基础:连接一个 IDE

本文档告诉您如何快速连接您的集成开发环境(IDE),用于 ObjectScript、Java、.NET、Python 或 JavaScript/Node.js 的集成开发环境连接到 InterSystems IRIS® 的一个实例,并使用从 GitHub 下载的模板文件验证您是否已经成功连接。
此外,接下来的两节还包括以下内容:
• 部署 InterSystems IRIS
列出用于部署 InterSystems IRIS 的已授权和免费评估实例的选项。如果您还没有一个可以使用的实例,请查看本节。
• InterSystems IRIS 连接信息
详细介绍了将 IDE 连接到已授权或免费的 InterSystems IRIS 实例,以及以其他方式与之进行交互所需的信息 ,并解释了如何获得实例的信息。无论您想用哪个 IDE 连接到 InterSystems IRIS,都要查看涉及您所使用的实例类型的部分。

1 部署 InterSystems IRIS
本节涵盖了已授权的实例和免费的评估实例。

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本帖概述了通过为 InterSystems 数据平台(InterSystems IRIS、Caché 和 Ensemble)上的数据库磁盘创建 LVM 物理盘区 (PE) 条带来实现低延迟存储 IO 的最佳实践配置,并提供了有用链接。

一致的低延迟存储是获得最佳数据库应用程序性能的关键。 例如,对于在 Linux 上运行的应用程序,经常在数据库磁盘中使用逻辑卷管理器 (LVM) ,因为它能够扩展卷和文件系统,或者为在线备份创建快照。 对于数据库应用程序,在使用 LVM PE 条带化逻辑卷的情况下,并行写入还可提高数据 I/O 的效率,从而有助于提高大规模连续读取和写入的性能。

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Caché Shadow

上次介绍了使用InterSystems IRIS/Caché的Reporting类型的异步镜像成员获取数据变更。但早期的Caché并不支持镜像,例如Caché 2008,它只支持Shadow。

在这些早期版本上是否也可以实利用Journal实现类似CDC的功能呢?答案是肯定的,就是利用Shadow服务器的Dejournaling filter routine (Dejournaling过滤器routine)。

Dejournaling filter routine

InterSystems Caché的 Dejournaling过滤器routine是一个用户自定义的routine,用于在Shadow服务器上过滤Journal记录。当配置了Dejournaling 过滤器后,Shadow服务器在redo journal前会自动调用Dejournaling过滤器routine。该routine传入参数以下:

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FHIR是快速医疗互操作资源(Fast Healthcare Interoperability Resources)的缩写,所以FHIR的核心是资源模型。它的颗粒度和结构都优于之前的V2 、V3、CDA标准,而且能够灵活扩展。另外一个优势就是它的API,它不仅提供了针对于资源模型本身的原子化的CRUD(创建、读取、更新、删除的这样一些原子化操作),而且提供了查询这种更复杂操作的能力,同样API是可以扩展的。

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· 八月 13, 2021 阅读大约需 1 分钟
FAQ 常见问题系列--Object Script篇 字符串%String长度限制

众所周知,Object Script是一个弱类型开发语言,%String是我们非常常用的一个类型,时不时有客户在初次接触Object Script编写程序时遇到%String长度限制的问题,在这里做一个简单总结,以便于相关开发人员作为参考。

1. MAXLEN设置字符串的长度。
Property Name As %String(MAXLEN = 50);
a) 如果不设置MAXLEN, 默认长度限制为50
b) MAXLEN = "", 没有限制长度,也就是字符串本身的长度限制。

如果超限,您将会看到如下报错,
错误 #7201: 数据类型值'abcdefghijklmnopqrstuvwxyzabcdefghijklmnopqrstuvwxyz'的长度超过50允许的MAXLEN

2. 字符串本身的长度限制。
在没有开启长字符串的情况下,%String类型的长度限制是32,767个字符。

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如果看了前一篇InterSystems IRIS医疗行业版创建FHIR服务器,应该您已经搭建好了FHIR服务器和FHIR资源仓库。除了使用FHIR REST API来操作这个FHIR服务器,您还可以更直观地看看它的价值 - 使用SMART on FHIR应用。这次,基于上次建好的FHIR服务器,我们用10分钟把一个SMART on FHIR运行起来。

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假设你想了解 InterSystems 在数据分析方面能提供什么。 你研究了理论,现在想要进行一些实践。 幸运的是,InterSystems 提供了一个项目:Samples BI,其中包含了一些很好的示例。 从 README 文件开始,跳过任何与 Docker 相关的内容,直接进行分步安装。 启动虚拟实例 安装 IRIS,按照说明安装 Samples BI,然后用漂亮的图表和表格让老板眼前一亮。 到目前为止还不错。

但是不可避免地,你需要进行更改。

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· 六月 1, 2021 阅读大约需 4 分钟
使用 InterSystems IRIS 实现 Data Fabric 架构

什么是 Data Fabric?

“这是一套用于在公司中实施、管控、管理和执行数据操作的硬件基础架构、软件、工具和资源,功能包括跨所有数据存储平台的数据采集、转换、存储、分发、整合、复制、可用性、安全性、保护、灾难恢复、演示、分析、保存、保留、备份、恢复、归档、召回、删除、监视和容量规划,并可使应用程序的使用满足公司的数据需求”。 
(Alan McSweeney)
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· 三月 26, 2021 阅读大约需 4 分钟
使用 IRIS 和 Python 创建聊天机器人

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使用 IRIS 和 Python 创建聊天机器人

本文将展示如何把 InterSystems IRIS 数据库与 Python 集成,以服务于自然语言处理 (NLP) 的机器学习模型。

为什么选择 Python?

随着在世界范围内的广泛采用和使用,Python 拥有了出色的社区,以及许多加速器 | 库用于部署任何类型的应用。 如果您感兴趣,请访问 https://www.python.org/about/apps/

Iris Globals

我接触到 ^globals 后很快就熟悉了,它们可以用作快速获取现成数据模型中数据的方法。 因此,首先,我将使用 ^globals 存储训练数据和对话以记录聊天机器人的行为。

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回过头来,业务场景都是千人千面的, FHIR怎么能够用一个标准涵盖尽可能多的用例?HL7吸收了V3的教训,在V3里面不成功的、或者说采纳度比较低的一个原因就V3试图穷举所有用例,由HL7组织自己来规范这些用例。这个是蛮沉重的教训,这也是V3的方法论虽然好,但是这套实施的路线在国际上有很大障碍的原因。

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