#InterSystems IRIS for Health

0 关注者 · 909 帖子

InterSystems IRIS for Health™ 是全球第一个也是唯一一个专门为医疗应用程序的快速开发而设计的数据平台,用于管理全世界最重要的数据。它包括强大的开箱即用的功能:事务处理和分析、可扩展的医疗保健数据模型、基于 FHIR 的解决方案开发、对医疗保健互操作性标准的支持等等。所有这些将使开发者能够快速实现价值并构建具有突破性的应用程序。了解更多信息

文章 Qiao Peng · 六月 11, 2023 7m read

数据平台一直在进化:从数据中心到数据中台,离散的数据资产得到进一步梳理和整合、按业务封装数据和操作数据的方法,并逐步提供了企业统一的访问、更新、检索、查询等数据服务。

然而市场上不乏听到数据平台的成功案例,却鲜见这些案例得到大规模推广。原因是什么呢?

一. 传统数据平台建设的挑战

传统数据平台的数据模型基于各自厂商的理解,缺乏统一行业数据模型和行业语义。可供参考的国内卫生信息数据元、数据集标准并非完整的行业语义,例如没有业务实体模型和数据元关系定义。传统的数据平台建设通常根据业务域,围绕数据应用需求组织数据。经常看到按业务域划分为CDR(临床数据中心)、ODR(运营数据中心)、RDR(科研数据中心)......

这造成了几个挑战:

1. 按业务域、而非业务实体来划分数据,虽然方便相应的业务域数据分析,但跨业务域重叠的业务实体数据,例如患者,需要跨数据中心同步。这些同步由于数据模型上的差异,往往非全息拷贝。随着同步次数越多,跨数据中心的数据越失真,造成数据资产多源不统一、数据资产一致性问题和时效性问题。

2. 数据平台产品语义表达上参差不齐,业务用户依赖数据工程师对数据理解和操作,无论是统计分析还是机器学习,海量的实施工作无法满足业务敏捷性要求;

3. 数据平台及数据应用建设依赖单一厂商的能力,而建设成果,包括数据工具、分析指标和应用都无法跨数据平台复用。

0
3 1123
文章 姚 鑫 · 六月 9, 2023 2m read

第三十章 开发Productions - ObjectScript Productions - 定义业务操作 - 调用适配器方法

调用适配器方法

最常见的是,业务操作不包含用于与外部系统通信的逻辑。相反,业务操作使用处理此逻辑的出站适配器。一旦业务操作与出站适配器相关联,它就会调用适配器的方法来发送和接收数据。有关调用适配器方法的详细信息,请参阅从业务主机访问属性和方法。

向生产中的目标发送请求

尽管业务操作主要负责向特定的外部应用程序传递请求,但它也可以根据需要向其他业务操作或业务流程发送消息。要将消息发送到生产中的目标,请调用 SendRequestSync()SendRequestAsync()SendDeferredResponse()

Ens.BusinessOperation 定义了一个可以使用的附加方法:DeferResponse()

DeferResponse() 方法

此方法中返回一个 %Status,指示成功或失败。它提供了一个引用参数 token,它返回稍后调用 SendDeferredResponse() 所需的延迟响应传递令牌。例如:

   Set sc=.DeferResponse(.
0
0 123
文章 Michael Lei · 六月 9, 2023 2m read

我们想介绍一些在 FHIR 相关培训期间我们从几个人那里收到的问题。


IRIS for Health FHIR 存储库会自动在存储库中分配一个唯一的逻辑 ID (id) 作为资源 POST 期间的默认行为。

例如,如果您发布一个 Patient 资源,例如

{ "resourceType" : "Patient" , "address" : [ { "postalCode" : "1600023" , "text" : "東京都新宿区西新宿6丁目" } ], "birthDate" : "1970-01-01" , "gender" : "male" , "identifier" : [ { "value" : "P101001" } ], "name" : [ { "extension" : [ { "url" : "http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/iso21090-EN-representation" , "valueCode" : "IDE" } ], "use" : "official" , "text" : "山田 太郎" , "family" : "山田" , "given" : [ "太郎" ] }, { "extension" : [ { "url" : "http://hl7.
0
0 244
文章 Jingwei Wang · 六月 8, 2023 2m read

数据分集 (测试数据可以在网上下载 https://catalog.data.gov/dataset/)

1. 创建训练集,80%用于训练集。

CREATE TABLE DataMining.DiabetesTraining AS SELECT top 641 Pregnancies, Glucose, BloodPressure, SkinThickness, Insulin,BMI, Age, Outcome from DataMining.DSTable order by ID

2. 创建测试集,20%用于测试集。

CREATE TABLE DataMining.DiabetesTest AS SELECT top 127 Pregnancies, Glucose, BloodPressure, SkinThickness, Insulin, BMI,Age, Outcome from DataMining.DSTable order by ID DESC

Integrated ML

1. 创建ML配置

此步骤用来配置Provider 及不同Provider所使用的配置参数。

InterSystems IRIS提供三种Provider,AutoMLH2ODataRobot,本实验使用默认Provider - AutoML ,所以可以忽略创建ML配置步骤。

0
0 249
文章 Claire Zheng · 六月 8, 2023 1m read

医院管理者、信息中心、业务骨干,每个角色都有独特的业务诉求,InterSystems IRIS医疗版互联互通套件专为国内用户设计,可助力医院用户释放数据价值,推动应用创新!截至目前,InterSystems技术已助力150余家医院通过四级及以上医院信息互联互通标准化成熟度评测,其中,五级乙等用户近30家。

0
0 206
文章 Jingwei Wang · 六月 8, 2023 1m read

在InterSystems IRIS中重新加载更新后的Python模块的方式和直接使用Python 重新加载模块的方式是一样的。

Python3.4 之后到版本中,直接使用Python 重新加载模块的方式如下:

import importlib
​
importlib.reload(module)

同样,在在InterSystems IRIS中重新加载Python模块的方式与其没有区别,示例如下:

ClassMethod Hello() As %Status
{
 Set sc = $$$OK
 Set sm = ##class(%SYS.Python).Import("sample")
 Set importlib = ##class(%SYS.Python).Import("importlib")
 do importlib.reload(sm)
 write sm.hello()
 Return sc
}
​
0
0 159
文章 Claire Zheng · 六月 6, 2023 1m read

当数据资产已经成为医院的核心资产,如何有效利用数据核心资产,持续挖掘互联互通平台和各种数据中心的价值,成为医疗信息化工作的重中之重。欢迎扫码注册(或点击链接注册)观看多位大咖针对这一话题的解读。

0
0 151
文章 Michael Lei · 五月 29, 2023 2m read

开发者们可以让轻松让全世界了解他们如何与Epic软件进行连接

2022年12月,全球排名第一的电子病历厂商Epic宣布发布Connection Hub供应商服务平台,供全球供应商来分享他们与Epic软件实现互操作能力的平台。

这个新网站于2023年1月9日开放,将允许所有与Epic有连接的供应商列出他们的应用,并自我报告他们是否已经实现了成功的数据交换。网站访问者,包括Epic客户,可以看到供应商提供的信息,如应用描述和网站链接。

Connection Hub将对所有供应商开放,目的是使供应商更容易加入其在线产品目录。希望被列入名录的供应商可以通过提供他们的信息和完成一个可选填的问卷来加入。除了Connection Hub,Epic还将推出供应商服务--提供Epic的新闻通讯、详细的教程、扩大的测试沙盒和技术支持的访问。

EPIC现有应用市场将进行更新并计划在今年晚些时候重新启动。 目前在应用市场的供应商将自动迁移到Connection Hub供应商服务平台。所有连接将不会受到影响,在应用市场中接受服务、API和测试工具的供应商将继续通过Connection Hub进行。对于那些目前在应用市场中列有实时连接的供应商,EPIC将为他们提供一个简单的方法,将其现有信息转移到Connection Hub。

Connection Hub代表了Epic对开放标准持续支持的又一步骤。

0
0 240
文章 Claire Zheng · 五月 23, 2023 1m read

实现医疗系统之间的互操作性是一项艰巨的挑战。随着FHIR日渐普及,对FHIR标准的兼容如今已成为许多国家医疗信息系统的全国性强制性要求。FHIR标准最有价值的一方面就是所有内容可被机器读取,使得FHIR应用跨机构使用成为可能,帮助您距离“语义互操作性”更近一步。

0
0 254
文章 Claire Zheng · 五月 23, 2023 1m read

不同系统在“对话”时候,如何让它们明白“带黑色条纹的白马”和“带白色条纹的黑马”是同一种动物(斑马)呢?FHIR是HL7国际(HL7 International)为满足当前医疗数据环境中的互操作性需求而创建的医疗数据标准,如今已成为许多国家医疗信息系统的全国性强制性要求。本视频介绍了FHIR的设计理念和关键构成,包括FHIR资源、FHIR Profile、FHIR扩展等。

0
0 200
文章 Meng Cao · 五月 10, 2023 1m read

今天从官网下载了IRISHealth-2023.1.0.229.0-lnxrh9x64版本的数据库安装包,在RHEL9.0上进行安装配置测试,遇到一个问题,趁热记录下来。

测试环境及软件版本:

操作系统——Red Hat Enterprise Linux release 9.0 (Plow)

数据库——IRISHealth-2023.1.0.229.0-lnxrh9x64

测试创建镜像时,配置好虚拟IP,点击保存。

保存后发现数据库没有变成主成员状态,一直是等待的状态,如下图所示:

这时查看控制台日志发现有大量报错,如下图所示:

从控制台日志看出,此时矛头指向了virtualIP.sh,经过查找发现这个脚本位置在安装目录下的bin目录中。

这里只是创建了MIRROR的配置,然后出现了问题,大概可以猜到可能是添加VIP的方法有什么问题,开启脚本的DEBUG,测试运行添加VIP的方法。

果然,发现了一处报错,如下图所示:

打开脚本文件,查看第588行代码。

研究发现RHEL9.0中,ID=`id | grep uid= | awk -F"=" '{print $2}' | awk -F"(" '{print $1}'`,$ID返回是空,不是数字,所以报错了,修改脚本,注释掉其中六行代码,并关闭DEBUG,如下:

保存脚本后,再次执行添加IP方法测试,IP可以正常添加。PS:不要忘记把测试添加的IP移除掉。

0
1 421
文章 Nicky Zhu · 五月 9, 2023 5m read

在上一篇文章中,我们看到了如何捕获位于我们服务器上一个文件夹中的DICOM类型的文件,以及如何将它们发送到PACS软件(在我们的案例中是ORTHANC开源解决方案)进行存储和咨询。那么,在这篇文章中,我们要处理的是相反的动作。

在我们的例子中,我们将配置我们的IRIS for Health Prodcution,以接收从我们的PACS通过TCP/IP发送的图像。要做到这一点,我们必须包括一个标准EnsLib.DICOM.Service.TCP类的业务服务,它将允许我们配置接收端。让我们来看看这个配置:

如您所见,我们已经声明了将监听的端口,通过该端口将接收从 PACS 发送的图像。我们还配置了本地 AET (Application Entity Title,应用实体名称)(IRIS) 和将向我们发送 DICOM (ORTHANC) 的 PACS,请记住这些字段是强制性的,并且将用于检查发送和接收 DICOM 消息的有效性。不要忘记必须从 DICOM 设置菜单配置和关联两个 AET:

正如你所看到的,我们已经配置了从IRIS到ORTHANC(前一篇文章的案例)和从ORTHANC到IRIS(本文中的案例)的信息发送。确认你已经为这两个关联上下文配置了你在两个系统中发送和接收的DICOM图像类型的演示上下文。

1
0 335
文章 Michael Lei · 五月 5, 2023 5m read

虽然在一项研究中,与医生的回答相比,一些专业人士确实更喜欢ChatGPT的回答,但凯洛格Kellog研究人员表示,现在判断人工智能是否真的能与医生的专业知识和对待病人的态度相媲美还为时过早。

根据本周发表在《美国医学会杂志》(JAMA Internal Medicine)上的一项研究,人工智能聊天机器人助手可以为患者的健康问题提供可以与医生回复相提并论的同等质量而且富有同情心的答复。

一组有执照的医护人员比较了医生和聊天机器人2022年10月在社交媒体论坛Reddit的r/AskDocs上公开提出的病人问题的回答,到了12月下旬他们被ChatGPT的答复征服了。

研究作者称:"聊天机器人的回答比医生的回答更受欢迎,而且在质量和同情心方面的评价都明显更高。“

加州大学圣地亚哥分校高通研究所的约翰-艾尔斯(John Ayers)撰写的《比较医生和人工智能聊天机器人对发布在公共社交媒体论坛上的患者问题的回应》的研究新闻很快被大量报道,其中充满了决定性的动词,如 "超越"、"击败 "或 "战胜",医生们上了头条,而ChatGPT成为了胜利者。

但其他生成型人工智能学者并不确定ChatGPT的同理心是否能取代医生的同理心。

医生是如何对待回答社交媒体上的问题的?

ChatGPT已经显示出对一系列医疗行业使用场景的潜在价值。

0
0 151
文章 Weiwei Gu · 五月 4, 2023 11m read

我们客户的一个共同需求是配置 HealthShare HealthConnect 和 IRIS的高可用性模式。

市场上的其他集成引擎通常被宣传为具有“高可用性”配置,但事实并非如此。通常,这些解决方案与外部数据库一起使用,因此,如果这些数据库未配置为高可用性,当发生数据库崩溃或与它的连接丢失时,整个集成工具将变得不可用。

对于 InterSystems 解决方案,这个问题不存在,因为数据库是工具本身的一部分和核心。 InterSystems 如何解决高可用性问题?深奥的配置会把我们拖入异化和疯狂的漩涡?不!在 InterSystems,我们倾听并处理了您的投诉(正如我们一直努力做的那样 ;)),并且我们已将镜像功能提供给所有用户和开发人员。

镜像

镜像如何工作?这个概念本身非常简单。如您所知,IRIS 和 HealthShare 都使用一个日志系统,该系统记录每个实例的数据库上的所有更新操作。这个日志系统是后来帮助我们在崩溃后恢复实例而不会丢失数据的系统。好吧,这些日志文件在镜像中配置的实例之间发送,允许并保持镜像中配置的实例永久更新。

架构

让我们简要解释一下在 Mirror 中配置的系统架构是什么样的:

  • 在故障转移模式下配置的两个实例:
    • 主动节点——接收所有常规的读/写操作。
    • 被动节点:在读取模式下,它同步接收主动节点产生的任何变化。
0
0 517
文章 Lilian Huang · 四月 28, 2023 8m read

嗨社区,
在本文中,我将演示 InterSystems Embedded Python 的用法,我们将涵盖以下主题:

  • 1-嵌入式Python概述
  • 2-嵌入式Python的使用
    • 2.1- 从 ObjectScript 使用 Python 库
    • 2.2- 从 Python 调用 InterSystems API
    • 2.3- 一起使用 ObjectScript 和 Python
  • 3-使用python内置函数
  • 4-Python 模块/库
  • 5 个嵌入式 Python 用例

  • 6-总结

我们从概述开始

1-嵌入式Python概述

嵌入式 Python 是 InterSystems IRIS 数据平台的一项功能,它允许 Python 开发人员完全直接地访问 InterSystems IRIS 中的数据和功能。

0
0 370
InterSystems 官方 Claire Zheng · 四月 27, 2023

InterSystems 已修复了一个缺陷,该缺陷可能会导致使用 IBM POWER8 或更高版本的 POWER 处理器的 AIX 系统上的数据库和Journal日志文件损坏。只有在使用数据库或Journal日志加密时才会触发此缺陷。

当满足以下条件时,会触发此缺陷:

如果环境满足所有这些条件,则用于数据库或Journal日志加密的密钥计划可能会被损坏。

该缺陷存在于以下产品和基于这些产品的任何 InterSystems 产品中:

  • InterSystems IRIS ® 除 2022.1.3 和 2023.1 之外的所有版本
  • InterSystems IRIS for Health ——除 2022.1.3 和 2023.1 之外的所有版本
  • HealthShare ® Health Connect 除 2022.1.3 和 2023.1 之外的所有版本
  • HealthShare ®解决方案——所有版本

请注意,此缺陷不会直接影响 HealthShare 解决方案,因为它们不使用数据元素加密功能。但是,如果 HealthShare 环境有一个使用上述数据元素加密功能的客户化定制,则它们必须遵循此警报中提供的补救措施。

0
0 218
InterSystems 官方 Claire Zheng · 四月 10, 2023

InterSystems已修复一个缺陷,该缺陷在罕见情况下会导致ECP客户端不稳定。

该缺陷存在于以下产品和基于这些产品的任何InterSystems产品中。

受影响的版本是2022.1.x、2022.2和2022.3:

InterSystems IRIS®

InterSystems IRIS for Health™

HealthShare® Health Connect

受影响的版本是2022.2(只针对部署ECP的客户):

InterSystems HealthShare®

这个问题只发生在ECP客户端系统中。当这个问题被触发时,进程可能遇到<SYSTEM>或<DATABASE>错误。出错后,ECP客户端会出现不稳定;在某些情况下,实例可能会挂起。对数据没有影响,ECP数据库服务器不受影响。

要清除不稳定性,必须重新启动ECP客户端实例。

如果您的 IRIS、IRIS for Health 或 Health Connect 实例受到影响,补救措施是升级到版本 2023.1 或 2022.1.3,这两个版本都将很快发布。

如果您有受影响的 HealthShare 实例,一组单独的警报文档和补救建议将很快发布

0
0 260
公告 Claire Zheng · 四月 10, 2023

2023年4月14日-16日,2023 CHITEC将在安徽省合肥市合肥滨湖国际会展中心(安徽省合肥市锦绣大道3899号)盛大召开。点击查看CHITEC 2023完整日程。InterSystems将亮相CHITEC,通过展位展示、主题研讨会、分论坛演讲等方式,全方位多角度展示InterSystems加速评测,助力公立医院高效建设互联互通平台和数据中心的能力。

0
0 486
文章 姚 鑫 · 四月 8, 2023 3m read

第二十二章 配置镜像 - 镜像配置指导原则

为了提供强大、经济的HA解决方案,镜像设计为可适应各种系统配置和体系结构。但是,建议遵循以下一般配置准则:

  • IRIS实例和平台兼容性-在确定要添加到镜像的系统之前,请务必查看IRIS实例兼容性和成员字符顺序注意事项中描述的要求。
  • 故障转移成员相等-假定镜像中的两个故障转移成员相等。无法将首选项配置为主角色,并且根据情况需要将主角色和备份角色互换。因此,最佳做法是使故障转移系统主机彼此尽可能相似,特别是使用相似的计算资源进行配置;即,两个系统上的CPU和内存配置以及磁盘配置应具有可比性。
  • 主实例配置和安全设置-主故障转移成员上的用户、角色、命名空间和映射(包括全局映射和包映射)等元素的配置不会被其他镜像成员上的镜像复制。因此,必须在备份故障切换成员或灾难恢复异步成员上手动复制所有设置,并根据需要进行更新,才能使备份故障切换成员或灾难恢复异步成员有效地从主成员接管。
  • 未镜像数据-仅在主故障转移成员上的镜像数据库中的数据在备份故障转移成员和异步成员上复制和同步。因此,使备份或灾难恢复异步有效地接管主服务器所需的任何文件(例如,包括与SQL网关和Web服务器配置相关的文件)都必须手动复制到这些成员,并根据需要进行更新。

注:镜像数据库的文件流(默认情况下位于数据库目录的Stream子目录中)不会被镜像。

0
0 122
InterSystems 官方 Claire Zheng · 四月 6, 2023

InterSystems 已修复一个导致SQL查询返回不正确结果的缺陷。

该缺陷存在于以下产品和基于这些产品的任何InterSystems产品中。

受影响的版本是 2021.2、2022.1.x、2022.2 和 2022.3:

  • InterSystems IRIS®
  • InterSystems IRIS for Health™(医疗版)
  • HealthShare®Health Connect

受影响的版本是 2022.2:

  • InterSystems HealthShare®

当启用 SQL 运行时计划选择 (RTPC) 被启用(默认),并且查询包含一个“truth value”“WHERE ?=? 时,该缺陷会被触发,当被触发时,一些判断可能不会被正确评估;这导致了不正确的查询结果。

注意:通过查看SQL语句,无法完全评估一个查询的脆弱性。这是因为InterSystems SQL查询优化可以在查询的内部表示中增加“truth value”。

如果你的环境使用 InterSystems SQL,那么你可以通过禁用RTPC 功能来补救这个问题

注意:关于 InterSystems HealthShare® 缓解措施的其他信息将很快发布。

0
0 215
文章 Kelly Huang · 三月 28, 2023 1m read

嗨大家好!

最近我需要使用 IRIS For Health 设置本地 FHIR 服务器,我认为我找到了有史以来最简单的方法!

只需在终端中运行以下两行:

 docker run --rm --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 intersystemsdc/irishealth-community

docker exec -it my-iris iris session iris -U "USER" '##class(%ZPM.PackageManager).Shell("install fhir-server")'

您将在 http://localhost:9092/fhir/r4 本地运行 FHIR 服务器。

就是这么简单!

FHIR 服务器将使用最新版本的 InterSystems IRIS for Health Community Edition,并将通过 FHIRSERVER 命名空间中的 IPM 包从该应用程序部署 FHIR 服务器

这是针对 Mac OS的,所以请在评论中添加它在 Windows 中的工作方式。

这是一篇非常短的文章,因为使用 InterSystems IRIS for Health 和IPM Package Manager 设置本地 FHIR 服务器真的很容易。

0
0 293
文章 姚 鑫 · 三月 23, 2023 24m read

简介

什么是Query

Query是一种查询方法,用于查找满足条件的数据,将结果以数据集的形式展现出来。

Query类别

  • SQL Query,使用类 %SQLQuerySQL SELECT 语句。
  • 自定义Query,使用类 %Query 和自定义逻辑生成查询数据。

说明:在讲通用Query解决方案之前,我们先了解一下Query的基础和基础使用,有助于理解实现原理。如果读者了解Query基本使用,可跳过此章节,直接阅读“现状”。

Query基本使用

SQL Query基本使用

Query QueryPersonByName(name As %String = "") As %SQLQuery(COMPILEMODE = "IMMEDIATE", CONTAINID = 1, ROWSPEC = "id:%Integer:ID,MT_Name:%String:name,age:%String,no:%String", SELECTMODE = "RUNTIME") [ SqlName = QueryPersonByName, SqlProc ]
{
	SELECT top 10 ID, MT_Age, MT_Name, MT_No
	FROM M_T.
0
0 343
文章 姚 鑫 · 三月 20, 2023 4m read

第三章 高可用性的故障转移策略

随着组织越来越依赖基于网络的应用程序,使数据库尽可能可用和可靠变得至关重要。本指南解释了 IRIS 数据平台如何提供高度可用和可靠的数据存储,并描述了从中断和故障中快速恢复并同时保持数据完整性的策略。

IRIS® 数据平台提供多种高可用性 (HA) 解决方案,并可轻松与操作系统供应商提供的所有常见 HA 配置集成。

维持系统高可用性的主要机制称为故障转移。在这种方法下,一个失败的主系统被一个备份系统取代;也就是说,处理故障转移到备份系统。许多 HA 配置还提供灾难恢复机制,即在故障转移机制无法保持系统可用时恢复系统可用性。

IRIS 实例故障转移有五种通用方法以实现 HA(包括不实施 HA 策略)。本章概述了这些方法,而本指南的其余部分提供了实施这些方法的过程。

重要的是要记住,在除镜像之外的所有这些方法中,单个存储故障都可能是灾难性的。因此,磁盘冗余、数据完整性指南“日志记录”一章中描述的数据库日志记录以及数据完整性指南“备份和还原”一章中描述的良好备份过程必须始终是您的一部分方法,因为它们对于减轻磁盘故障的后果至关重要。

如果需要详细信息来帮助制定适合环境的故障转移和灾难恢复策略。

无故障转移策略

IRIS 数据库的完整性始终受到数据完整性指南中描述的功能的保护,免受生产系统故障的影响。

0
0 246
文章 Kate Lau · 三月 17, 2023 1m read


添加凭据以登录 FHIR REST 接口 - 在这例子仅考虑基本身份验证

添加服务注册表 - 在这例子仅考虑基本身份验证

- 设置 HTTP 服务

- 输入 FHIR 服务器的路径

- 输入 FHIR 服务的 URL

- 使用配置的凭证


添加 "HS.FHIRServer.Interop.HTTPOperation"

选择服务名称

测试 FHIR 客户端

跟踪测试结果

1
0 178