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⏯ Understanding the Structure of HL7 FHIR Resources

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· 四月 1 阅读大约需 1 分钟
加快临床试验,扩大全球市场推广

此视频帮助大家了解InterSystems如何帮助CRO来加快临床数据采集和更快地推广市场。

演讲嘉宾:

Jim Coutcher, Senior Director/Principal, Global Head of Enriched Studies, Real World Solutions, IQVIA
Qi Li, Physician Executive, InterSystems
Matt Stannard, life Sciences Advisor, InterSystems

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2024年3月29日-3月31日,由国家卫生健康委医院管理研究所主办、《中国数字医学》杂志社有限公司承办的“2024中华医院信息网络大会(CHINC)”将在青岛国际会展中心(红岛馆)举办。InterSystems诚邀您莅临展会,我们带来了内容丰富的Demo演示,包括:InterSystems IRIS 2024.1新特性、 InterSystems IRIS矢量存储和矢量查询、InterSystems FHIR数据资产化解决方案,以及InterSystems IRIS医疗版互联互通套件解决方案。

2024 CHINC期间,InterSystems在合作伙伴东华医为展位(B3馆-A02)设立Demo演示区,即日起即可预约现场Demo咨询,欢迎点击【此处】注册预约。

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· 三月 21 阅读大约需 2 分钟
IRIS 向量搜索

这是在 IRIS 中完全运行向量搜索演示的尝试。
没有外部工具,您需要的只是终端/控制台和管理门户。
特别感谢Alvin Ryanputra作为他的软件包iris-vector-search的基础
灵感和测试数据的来源。
我的软件包基于 IRIS 2024.1 版本,需要注意您的处理器功能。

我尝试用纯 ObjectScript 编写演示。
仅描述向量的计算是在嵌入式Python中完成的

计算 2247 个记录的 384 维向量需要时间。
在我的 Docker 容器中,它正在运行 01:53:14 来完全生成它们。

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· 三月 17 阅读大约需 12 分钟
生成式大语言模型和检索增强生成

近来生成式大语言模型掀起了革命性的AI浪潮。生成式大语言模型是什么原理?我们怎么在业务中利用它?

一. 大语言模型的工作原理

生成式大语言模型是生成式人工智能底层的机器学习模型,是一种用于自然语言处理的深度学习模型。

人工智能、机器学习与大语言模型的关系如下图:

1.1 为什么我们称之为大语言模型?

大语言模型的“大”体现在多个方面:

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· 三月 16 阅读大约需 10 分钟
IRIS 2024.1新特性 - JSON_TABLE

IRIS 2024.1已经发布,它引入了诸多新特性,其中之一是JSON_TABLE。

数据表达和交换中,JSON已经是日益主流的存在。在之前的IRIS版本中,可以轻易将JSON数据以对象解析并保存到IRIS,也可以将IRIS数据使用SQL、对象等多种方式输出为JSON。对于得到的JSON序列化的数据,如果我们想通过SQL去解析,甚至进行检索和查询,就可以利用JSON_TABLE这个新特性。

对于一些大规模的JSON序列化数据,例如从FHIR服务器查询获得的FHIR资源Bundle,里面包含了大量数据。例如下面的FHIR查询结果,后面的示例以这个的复杂的JSON作为用例:

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· 三月 14 阅读大约需 3 分钟
Fhir-肝炎预测

使用 FHIR SQL BUILDER 处理 FHIR 资源以预测患丙型肝炎疾病的概率

随着科技的发展,医疗行业也在不断的进步,人类也往往更加关注自身的健康,
通过计算机学习和处理数据集,可以预测疾病。

前提条件:使用 FHIR 和 ML的能力
首先,我们的数据集从kaggle获得,并根据患者性别、年龄、ALP或ALT转化为FHIR资源,并导入到FHIR资源库中

要导入FHIR资源库,我们可以使用以下命令:

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在上一篇文章中,我们了解了如何恢复存储在特定 HIS 数据库中的资源,因此今天我们将了解如何在 HIS 中添加新记录,其来源是我们在系统中收到的 FHIR 资源。

FHIR 的 CRUD 操作

FHIR 的主要功能之一是通过 Rest API 支持 CRUD 操作,这意味着任何使用 FHIR 的系统都必须提供对 GET、POST、PUT 和 DELETE 类型的 HTTP 调用的支持。在今天的文章中,我们将了解如何管理对安装 FHIR 适配器时自动配置的端点的 POST 调用。

如果我们回顾资源存储调用的 FHIR 规范,我们会发现它告诉我们,用于调用的 URL 必须遵循以下格式:

http(s)://server_url/{endpoint}/{Resource}

在我们的示例中,我们将不使用安全调用,因此我们的 URL 将如下所示:

http://localhost:52774/Adapter/r4/Patient

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02/21/24-18:32:48:515 (7568) 3 InterSystems IRIS Internal Failure

Access Violation (0xC0000005) occurred at 00007FFF3DE9C4E8
Process = 00001D90 Thread = 0000203C
Exception Count=1 b_msyslog=0 b_DumpVar=0 b_DumpVar2=0
b_GRelease=0 b_GRelease2=0 b_DeqRes=0 b_DeqRes2=0
Job Type = CSP server
ContextFlags = 0010005F Registers:
RAX=00007FFF3DE9C4E8 RBX=000000C2E5554800 RCX=000000C2E7AFFC00
RDX=000000C2E7B00000 RSI=00000000FFFFFFC0 RDI=00000000000003FF
RSP=000000C25CEBD2F8 RBP=0000000000000000 R8 =0000000000000001
R9 =00007FFF3DE60000 R10=000000C2E7AFFC00 R11=000000C2E7AFFC00
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· 二月 19 阅读大约需 4 分钟
FHIR在行动:InterSystems的真实国际案例

世界各地的医院和医疗系统、支付方、技术提供商和研究人员都使用InterSystems解决方案来打破互操作性障碍,简化FHIR应用程序的开发和交付工作。

SMART on FHIR 应用

纽约州健康信息网络Hixny使用InterSystems HealthShare Unified Care Record®,为美国最大的公共卫生信息交换机构Healthix开发了一个SMART on FHIR应用程序。每当临床医生查看患者记录时,该创新应用程序都会并排显示患者的社交和病史。该解决方案允许临床医生评估健康的社会决定因素,并直接从其现有的应用程序和工作流程中进行社会服务转介,从而简化互动并提高提供者的效率。HealthShare Unified Care Record 使 Hixny 能够轻松地以单一、一致的格式维护所有数据,无论其来源如何。

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FHIR 用例集: 打破数字医疗壁垒,实现高质量发展

--促进互联互通,改进工作流程,提高数据洞察

简介


HL7® FHIR®(快速医疗互操作性资源)是以电子方式访问、交换和管理医疗信息的国际标准。与以往的标准不同,FHIR 可让帮助行业从业者轻松构建创新应用程序,有效地收集、汇总和分析来自不同来源的各种医疗保健和管理数据。医疗机构、社保/保险公司、政府机构、生命科学公司、医疗设备制造商和医疗科技等多种主体利用 FHIR 来简化信息流、提高数据洞察力、改善临床效果和业务成果。

FHIR 基于 JSON、HTTP 和 REST 等流行的网络技术。有了 FHIR,没有医疗信息化背景的软件开发人员也能使用熟悉的开发工具和开源技术,快速、轻松地满足政府机构、临床医生、研究人员、医疗行业从业者以及各类市场主体的数据需求。

FHIR 是一种灵活、适应性强的医疗数据模型,可轻松定制,以实现各种用例的互操作性。FHIR 由称为 "资源 "的离散、可计算的数据对象组成,以实现最佳效率。通过 FHIR 资源,应用程序可以访问单个医疗记录元素,而无需检索摘要文档中包含的所有数据。

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本篇文章会介绍一个简单的示例:如何使用IRIS 2023版自带的EnsLib.SQL.Service.GenericServiceEnsLib.SQL.Operation.GenericOperationMySQL的数据库读取出来并灌入Oracle数据库,本示例以Windows环境为例。

1. 创建SQL网关连接,连到MySQL

1.1 在windows中创建MySQL ODBC连接

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医院目前即将使用iris2023.1;里面包含了%External.Messaging.KafkaClient 类,需要设置kafka的链接,发送kafka消息,然后断开链接,能否跟springboot 一样;自动配置,kafka的链接交给iris来管理,保持长链接,不要断开;直接使用%External.Messaging.KafkaClient 发送消息;

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· 一月 31 阅读大约需 21 分钟
用Java开发互操作产品 - PEX

InterSystems IRIS、Health Connect和上一代的Ensemble提供了优秀的互操作架构,但即便有低代码开发能力,很多开发者还是希望能用自己的技术栈语言在InterSystems的产品上开发互操作产品。

考虑到互操作产品本身的开放性要求和各个技术栈背后庞大的生态价值,InterSystems IRIS和Health Connect提供了Production EXtension (PEX)架构,让开发者使用自己的技术栈语言来开发互操作解决方案。目前PEX支持Java、.net、Python。

这里我们介绍使用Java利用PEX进行互操作产品的开发。

一 InterSystems IRIS上使用Java开发的基础

在进入PEX主题前,需要简单介绍一下Java在InterSystems IRIS上开发的各种技术选项,因为PEX也是以这些技术选项为基础的。

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InterSystems 常见问题解答

如果系统24小时没有停止,旧的日志文件将根据“日志文件删除设置”在0:30删除。

导致日志文件保留的时间早于“日志文件删除设置”的一个可能原因是存在仍处于开放状态的事务。

在这种情况下,您将能够通过搜索执行事务的进程并完成事务来删除日志文件。

下面的示例检查是否存在未完成的事务,如果存在,则输出目标文件名和日志记录信息。

(示例可以从这里下载

*注意*如果要检查的日志文件较大或日志文件较多,则执行需要时间,因此请联系我们的支持中心。

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· 一月 23 阅读大约需 3 分钟
第七章 使用 SQL Search - 同义词表

第七章 使用 SQL Search - 同义词表

同义词表

要实现同义词表,请将该表定义为扩展 iFind.Synonym 抽象类的持久类。

此类定义了两个属性:FromTermToTerm。一对 FromTermToTerm 属性将 ToTerm 定义为 FromTerm 的同义词。如果查询包含 FromTermSQL 搜索将使用 ToTerm 来扩展查询。

该查询使用此类的 GetMatch() 方法根据查询词在同义词表中搜索同义词。

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作为针对数据导入处理性能和错误(锁定表已满)的衡量标准,可能需要调整常规内存堆 (gmheap) 和锁定表大小 (locksiz) 参数。

事实上,您可以使用终端和管理门户来检查当前分配了多少通用内存堆。


★终端用

// 一般メモリヒープサマリUSER> w $system .Config.SharedMemoryHeap.GetUsageSummary() 4992226 , 6029312 , 59441152

通用内存堆摘要以使用量、分配量和配置量(字节)的形式显示返回值。

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Gartner魔力象限是业内知名的分析报告,针对特定市场进行严谨、基于事实的研究后发布的魔力象限报告,可为用户提供全面视图,以便其了解在高速增长、差异化明显的市场中供应商的相对位置。在魔力象限中,供应商被定位在四个象限中:领导者(Leader)、挑战者(Challenger)、远见者(Visionary)和利基玩家(Niche Player)。

2023年年底,在 Gartner 2023年最新发布的“云数据库管理系统(Cloud DBMS)魔力象限”中,InterSystems再次荣膺“挑战者”(Challenger)称号,这是InterSystems第三次入围这一报告并得到认可(2022年“远见者”2021年“挑战者”)。

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Hi 开发者们,

我们非常高兴地邀请大家参加新的 InterSystems 在线编程竞赛,此次编程大赛关注于“FHIR与数字医疗互操作性”这个主题。

🏆 InterSystems编程大赛:FHIR 与数字医疗互操作性🏆

时间: 2024年1月15日至2月5日(美国东部时间)

奖金池: 14,000 美元

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· 一月 5 阅读大约需 3 分钟
第十六章 调用Callout Library函数

第十六章 调用Callout Library函数

Callout 库是一个共享库(DLLSO 文件),其中包含 $ZF Callout 接口的挂钩,允许各种 $ZF 函数在运行时加载它并调用其函数。 $ZF Callout 接口提供了四种不同的接口,可用于在运行时加载 Callout 库并从该库调用函数。这些接口的主要区别在于如何识别库并将其加载到内存中:

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第十五章 创建Callout Library - 处理 UNIX 信号处理错误

处理 UNIX 信号处理错误

UNIX 及相关操作系统下运行时,如果进程收到信号,某些系统调用可能会失败,最常见的是打开、读取、写入、关闭、ioctl 和暂停。如果函数使用任何这些系统调用,代码必须能够区分真正的错误、Ctrl-C 和应重新启动的调用。

以下函数允许检查异步事件并在 $ZF 中设置新的警报处理程序。函数声明包含在 iris-cdzf.h 中:

sigrtclr()

int sigrtclr(); — 清除重试标志。应在使用 sigrtchk() 之前调用一次。

dzfalarm()

int dzfalarm(); — 建立新的 `SIGALRM 处理程序。

进入 $ZF 时,会自动保存先前的处理程序。退出时会自动恢复。用户程序不应改变任何其他信号的处理。

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第十一章 创建Callout Library - 使用 J 链接类型传递标准计数字符串

使用 J 链接类型传递标准计数字符串

iris-callin.h 头文件定义了计数字符串结构 IRIS_EXSTR,表示标准 IRIS 字符串。此结构包含一个字符元素数组(8 位、16Unicode32wchar t)和一个指定数组中元素数量的 int 值(最多字符串长度限制):

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· 十二月 29, 2023 阅读大约需 9 分钟
使用 FHIR 适配器在传统系统上提供 FHIR 服务 - 阅读资源

我们继续推出有关可供 HealthShare HealthConnect 和 InterSystems IRIS 用户使用的 FHIR 适配器工具的系列文章。

在前几篇文章中,我们介绍了小型应用程序,并在此基础上建立了我们的工作,并展示了安装 FHIR 适配器后在 IRIS 实例中部署的架构。在今天的文章中,我们将看到一个示例,说明如何执行最常见的 CRUD(创建 - 读取 - 更新 - 删除)操作之一,即读取操作,我们将通过恢复资源来完成此操作。

什么是资源?

FHIR 中的一个资源对应一种相关的临床信息,这种信息可以是病人(Patient)、对实验室的请求(ServiceRequest)或诊断(Condition)等。每种资源都定义了组成它的数据类型,以及对数据的限制和与其他类型资源的关系。每个资源都允许对其包含的信息进行扩展,从而满足 FHIR 80% 以外的需求(满足 80% 以上用户的需求)。

在本文的示例中,我们将使用最常见的资源 "Patient"。让我们来看看它的定义:

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· 十二月 27, 2023 阅读大约需 7 分钟
FHIR小百科 - 处方的表达

在医疗行业中,处方是个非常重要的临床工作数据概念。因此,在考察用FHIR能如何构造我国所需医疗行业数据模型时,就会需要考虑如何用FHIR表达处方。

在2019年,FHIR的工作组已否认需要使用特定的资源来表达处方(不是药嘱)这个概念,见:

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