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· 八月 19, 2022 阅读大约需 2 分钟
IRIS 医疗版docker 容器初体验

我很高兴与大家分享我第一次使用docker容器版本的IRIS for Health的经验,以探索你对使用或试用的兴趣,利用docker容器的优势,它是轻量级的,易于部署。本文将通过使用Renan Lourenco编写的名为ENSDEMO的GitHub仓库的实施步骤。

设置IRIS for Health社区版docker容器环境的步骤:

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· 十一月 14, 2022 阅读大约需 7 分钟
ZPM介绍(1)

ZPM介绍

有Developer听闻了InterSystems的包管理器ZPM, 希望我能介绍一下。正好刚刚看到一个开发者论坛的新闻: Open Exchange ZPM is now InterSystems Package Manager , 觉得更有必要了。

zpm是什么

简单说:zpm, 全称InterSystems ObjectScript Package Manager, 是一个包管理器, 开发者是Nikolay Soloviev和Dmitry Maslennikov。它先是在开发者社区里得到认可,以至于InterSystems开发者社区最近的一些比赛,要求参赛作品用zpm打包。然后就有了上面的链接的内容:InterSystems决定把它做为自己官方的打包工具, 将它改名字叫IPM(InterSystems Package Manager),同时保持它的开源状况不变。

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· 二月 19, 2023 阅读大约需 1 分钟
一键在 VSCode 终端中运行 ObjectScript 类方法

各位开发者,大家好!

对我来说,关于 ObjectScript 的最痛苦的一件事是输入 ##class(Class).Method() 以在代码或终端中调用类方法。 为解决这个问题, 我甚至提出了一个在 ObjectScript 中简化它的想法

但是 VSCode ObjectScript中有一个刚刚引入到插件中的新功能 – 复制调用Copy Invocation!

只需将 **Copy Invocation**(复制调用)链接悬停在代码中的每个类方法上方,点击它,该调用就会被复制到缓冲区:

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如果您已经使用%UnitTest 框架构建了单元测试,或者正在考虑这样做,请查看InterSystems 测试管理器Test Manager

无需离开 VS Code,您现在可以浏览单元测试、运行或调试它们,并查看之前的运行结果。

InterSystems 测试管理器适用于 ObjectScript 扩展支持的两种源代码位置范例。您的单元测试类可以在 VS Code 的本地文件系统(“客户端编辑”范例)或服务器命名空间(“服务器端编辑”)中掌握。在这两种情况下,实际测试运行都发生在服务器命名空间中。

欢迎反馈。

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· 九月 14, 2023 阅读大约需 1 分钟
VS Code 无法连接到服务器的原因之一

昨天,我在一个客户网站提供从 Studio 迁移到 VS Code 的定制咨询时,就遇到了这种情况。

该站点的服务器已配置为使用delegated authentication,但尚未针对 /api/atelier Web 应用程序设置“delegated”复选框,而 InterSystems ObjectScript 扩展包的成员正是使用该复选框进行连接的。

一旦我们的应用程序设置了其复选框并单击了服务器管理器刷新按钮,就可以在服务器上枚举命名空间。

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· 九月 14, 2023 阅读大约需 2 分钟
容器中的 InterSystems IRIS

InterSystems 还发布了容器化部署的IRIS。这篇文章旨在演示 InterSystems IRIS 和依赖 IRIS 后端的应用程序如何打包到镜像中并在容器中的其他计算机中运行,以及这样做有多么简单。

容器运行包含所有必需的可执行文件、二进制代码、库和配置文件的镜像。镜像可以从一台机器移动到另一台机器,像 Docker Hub 这样的镜像存储库可以简化这个过程。

我在本演示中使用了 Open Exchange 的应用程序。

演示视频: https://www.loom.com/share/93f9a760b5f54c0a8811b7a212387b9d

IRIS 数据平台社区版的镜像(image)可以在 InterSystems 容器注册表中找到:

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· 四月 13, 2022 阅读大约需 7 分钟
用Globals 作为图数据库来存储和抽取图结构数据

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这篇文章是对我的  iris-globals-graphDB 应用的介绍。
在这篇文章中,我将演示如何在Python Flask Web 框架和PYVIS交互式网络可视化库的帮助下,将图形数据保存和抽取到InterSystems Globals中。

建议

 

第一步 : 通过使用Python 原生SDK建立与IRIS Globals的链接

 #create and establish connection
  if not self.iris_connection:
         self.iris_connection = irisnative.createConnection("localhost", 1972, "USER", "superuser", "SYS")
                                     
  # Create an iris object
  self.iris_native = irisnative.createIris(self.iris_connection)
  return self.iris_native

 

第二步 : 使用 iris_native.set( ) 功能把数据保存到Globals 里     

#import nodes data from csv file
isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1nodes")
if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1nodes.csv", newline='') as csvfile:

 reader = csv.DictReader(csvfile)
 for row in reader:
    self.iris_native.set(row["name"], "^g1nodes", row["id"])

 #import edges data from csv file
 isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1edges")
 if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1edges.csv", newline='') as csvfile:
 reader = csv.DictReader(csvfile)
 counter = 0                
 for row in reader:
    counter = counter + 1
    #Save data to globals
    self.iris_native.set(row["source"]+'-'+row["target"], "^g1edges", counter)  

 

第三步: 使用iris_native.get() 功能把节点和边缘数据从Globals传递给PYVIS

 #Get nodes data for basic graph    
  def get_g1nodes(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1nodes")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1nodes",level1_subscript)
            element = {"id": level1_subscript, "label": val, "shape":"circle"}
            result.append(element)            
        return result

    #Get edges data for basic graph  
    def get_g1edges(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1edges")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1edges",level1_subscript)
            element = {"from": int(val.rpartition('-')[0]), "to": int(val.rpartition('-')[2])}
            result.append(element)            
        return result

 

Step4: Use PYVIS Javascript to generate graph data

<script type="text/javascript">
    // initialize global variables.
    var edges;
    var nodes;
    var network;
    var container;
    var options, data;
  
    // This method is responsible for drawing the graph, returns the drawn network
    function drawGraph() {
        var container = document.getElementById('mynetwork');
        let node = JSON.parse('{{ nodes | tojson }}');
        let edge = JSON.parse('{{ edges | tojson }}');
     
        // parsing and collecting nodes and edges from the python
        nodes = new vis.DataSet(node);
        edges = new vis.DataSet(edge);

        // adding nodes and edges to the graph
        data = {nodes: nodes, edges: edges};

        var options = {
            "configure": {
                "enabled": true,
                "filter": [
                "physics","nodes"
            ]
            },
            "nodes": {
                "color": {
                  "border": "rgba(233,180,56,1)",
                  "background": "rgba(252,175,41,1)",
                  "highlight": {
                    "border": "rgba(38,137,233,1)",
                    "background": "rgba(40,138,255,1)"
                  },
                  "hover": {
                    "border": "rgba(42,127,233,1)",
                    "background": "rgba(42,126,255,1)"
                 }
                },

                "font": {
                  "color": "rgba(255,255,255,1)"
                }
              },
            "edges": {
                "color": {
                    "inherit": true
                },
                "smooth": {
                    "enabled": false,
                    "type": "continuous"
                }
            },
            "interaction": {
                "dragNodes": true,
                "hideEdgesOnDrag": false,
                "hideNodesOnDrag": false,
                "navigationButtons": true,
                "hover": true
            },

            "physics": {
                "barnesHut": {
                    "avoidOverlap": 0,
                    "centralGravity": 0.3,
                    "damping": 0.09,
                    "gravitationalConstant": -80000,
                    "springConstant": 0.001,
                    "springLength": 250
                },

                "enabled": true,
                "stabilization": {
                    "enabled": true,
                    "fit": true,
                    "iterations": 1000,
                    "onlyDynamicEdges": false,
                    "updateInterval": 50
                }
            }
        }
        // if this network requires displaying the configure window,
        // put it in its div
        options.configure["container"] = document.getElementById("config");
        network = new vis.Network(container, data, options);
        return network;
    }
    drawGraph();
</script>

 

第五步: 从app.py 主文件调用上面的代码

#Mian route. (index)
@app.route("/")
def index():
    #Establish connection and import data to globals
    irisglobal = IRISGLOBAL()
    irisglobal.import_g1_nodes_edges()
    irisglobal.import_g2_nodes_edges()

    #getting nodes data from globals
    nodes = irisglobal.get_g1nodes()
    #getting edges data from globals
    edges = irisglobal.get_g1edges()

    #To display graph with configuration
    pyvis = True
    return render_template('index.html', nodes = nodes,edges=edges,pyvis=pyvis)    

下面是关于此项目的 介绍视频:

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· 四月 17, 2022 阅读大约需 3 分钟
在IRIS容器里添加VSCode

在IRIS容器里添加VSCode

设置可重复的开发环境的最简单的方法之一是使用容器。我发现在快速迭代时,在我的开发环境容器里托管一个vscode实例是非常方便的。因此,我创建了一个快速的容器脚本,将一个基于浏览器的vscode添加到IRIS容器中。这应该适用于大多数2021.1以上的容器。我的代码库可以在这里找到

带VSCode 且预连接好的InterSystems IRIS 容器

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本月我们正式发布VS Code ObjectScript扩展的1.8.0版本,它包含以下增强功能和错误修复。

最大的更新是支持服务器端的项目文件,因为很多人会记得Studio。如果你在客户端工作,VS Code已经有很好的项目管理功能。你可以简单地使用一个文件夹作为一个项目,或者使用多个根目录的工作空间。但是如果你在服务器端工作,你可能会喜欢一些更好的工具管理能力,这就是这个功能的意义所在。更多内容,欢迎查阅文档的新项目章节

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医疗行业的互操作性在改善病人护理、降低医疗服务提供者的成本以及为提供者提供更准确的情况方面发挥着重要作用。然而,由于有这么多不同的系统,数据的格式也有很多不同的方式。有许多标准被创造出来以试图解决这个问题,包括HL7v2、HL7v3和CDA,但每一种都有其缺点。

FHIR,即快速医疗互操作性资源,是一种新的医疗数据格式,旨在解决这些问题。它是由国际卫生级七组织(HL7)开发的,该组织还开发了HL7v2、HL7v3和CDA。

今天我们将探讨如何在VS代码中借助IntelliSense和自动完成功能,通过使用FHIR Schema 创建和验证FHIR资源。

第 1 步 :从FHIR 官方网站 https://www.hl7.org/fhir/下载 JSON schema file 文件用来做资源校验

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· 八月 9, 2022 阅读大约需 1 分钟
GitHub上的VSCode-ObjectScript

不久前,GitHub推出了在浏览器中快速运行VSCode的功能,可以在任何仓库中运行。 在任何仓库或拉动请求上按下 . 键,或将URL中的.com换成.dev,就可以直接进入浏览器中的VS Code环境。

github dev

这个VSCode是桌面版的轻型版本,完全基于浏览器。由于这个原因,它对允许以这种方式工作的扩展插件有限制。让我介绍一下VSCode-ObjectScript扩展的新版本1.2.1,它现在支持在浏览器模式下运行。

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· 十二月 13, 2022 阅读大约需 7 分钟
InterSystems IRIS 嵌入式 Python 模板

嵌入式 Python 模板

今天你们分享一个简单的嵌入式 Python 模板,我建议将其作为任何使用 InterSystems IRIS 并将使用嵌入式 Python 的通用项目的起点。

功能:

  • 随时可用的嵌入式 Python;
  • 3 种嵌入式 Python 开发方式示例;
  • 随时可用的 VSCode 开发;
  • 支持 Docker;
  • 支持在线演示;
  • 随时可用的 ZPM 优先开发。

下面讨论一下这些功能!

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