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· 三月 14 阅读大约需 3 分钟
Fhir-肝炎预测

使用 FHIR SQL BUILDER 处理 FHIR 资源以预测患丙型肝炎疾病的概率

随着科技的发展,医疗行业也在不断的进步,人类也往往更加关注自身的健康,
通过计算机学习和处理数据集,可以预测疾病。

前提条件:使用 FHIR 和 ML的能力
首先,我们的数据集从kaggle获得,并根据患者性别、年龄、ALP或ALT转化为FHIR资源,并导入到FHIR资源库中

要导入FHIR资源库,我们可以使用以下命令:

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· 八月 7 阅读大约需 5 分钟
在 Docker 容器中长期保留 IRIS 数据

默认情况下,在容器内创建的所有文件都存储在可写的容器层上。 这意味着:

  • 当容器消失时,数据将不会持续存在,并且如果另一个进程需要数据,很难将数据从容器中取出。
  • 容器的可写层与运行容器的主机紧密耦合。 你无法轻易将数据移动到其他地方。
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· 三月 4, 2021 阅读大约需 11 分钟
第三章 SQL语言元素(二)

第三章 SQL语言元素(二)

算术运算符和函数

InterSystems SQL支持以下算术运算符:

  • + 加法操作符。
    例如,17+7 = 24

  • 减法运算符。
    例如,17-7等于10
    注意,这些字符中的一对是InterSystems SQL注释指示器。
    因此,要指定两个或多个减法操作符或负号,必须使用空格或圆括号。
    例如,17- -7或17-(-7)等于24

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· 六月 9, 2021 阅读大约需 6 分钟
第二章 从对象写入XML输出

第二章 从对象写入XML输出

本章介绍如何从InterSystems IRIS对象生成XML输出。

创建XML编写器概述

InterSystems IRIS提供了用于为InterSystems IRIS对象生成XML输出的工具。可以指定XML投影的详细信息,如将对象投影到XML中所述。然后创建一个Writer方法,该方法指定XML输出的整体结构:字符编码、对象的显示顺序、是否包括处理指令等。

基本要求如下:

  • 如果需要特定对象的输出,则该对象的类定义必须扩展%XML.Adaptor。除了少数例外,该对象引用的类还必须扩展%XML.Adaptor

  • 输出方法必须创建%XML.Writer的实例,然后使用该实例的方法。

下面的终端会话显示了一个简单的示例,在该示例中,我们访问启用了XML的对象并为其生成输出:

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什么是互联互通?我们所说的互联互通其实就是国际上的互操作性,HIMSS对于互操作性定义的是:不同的信息系统、设备、应用系统之间、程序之间,在机构区域和国家边界之内,以及跨机构、区域和国家边界,以协调的方式来访问交换集成和协作使用数据的能力。

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· 九月 10, 2022 阅读大约需 4 分钟
第二十八章 管理许可(一)

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第二十八章 管理许可(一)

配置许可

每个 IRIS 实例维护其许可证容量和当前使用的独立本地视图,并且每个实例都需要访问许可证密钥。可以在每个实例上安装和激活本地许可证密钥文件。或者,如果要管理多个实例,可以配置许可证服务器来管理存储在中央位置的密钥文件,然后它可以将其分发到其他实例。在这种情况下,必须为每个实例配置密钥文件的 LicenseID,以便它可以在启动时检索密钥的副本。

多服务器许可证可以在同一台机器或不同机器上的协作实例之间共享。仅允许使用多服务器密钥进行共享。要使用多服务器许可,必须配置一个或多个 IRIS 许可服务器来分配密钥授权的 IRIS 许可单元。共享密钥的所有实例都必须配置为使用相同的许可证服务器或一组许可证服务器。许可服务器可以在运行 IRIS 实例的任何计算机上运行。监控进程向许可服务器发送更新消息,当多个实例共享一个许可时,许可服务器协调许可分配。

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· 九月 20, 2022 阅读大约需 2 分钟
FAQ常见问题系列 -- HA篇 虚拟化环境上的镜像问题

1. VMWare快照引起的网络中断导致非计划内主备机切换问题

1.1 问题描述

在创建虚拟机快照时,虚拟机需要短时间的冻结,这个短时间冻结通常指虚拟机静默,在静默过程中网络连接处于中断状态。由于数据库的不断增长,使用VMWare快照的方式对虚拟机进行备份的时长也会不断增加,当对虚拟机进行快照的时长长于InterSystems镜像服务质量 (QoS) 超时时间,即当主机网络中断超过QoS超时时间,仲裁机与备机观察并相互确认与主机的连接丢失后,将发起切换过程,使原备机成为主机并将虚拟IP从主机MAC地址解绑后重绑定到备机的MAC地址上。特别需要注意的是,在这种由于网络中断引起的切换中,仲裁与备机都无法得知主机的实际工作状态。因此,在主机网络连接恢复后,为了为了避免因切换期间主机还在处理数据导致主备机间数据不一致,备机主动发起请求让主机下线,关闭主机,此时主机状态显示为关闭(Down)。

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· 十月 1, 2022 阅读大约需 2 分钟
第三章 Caché 服务器页面简介 - 通过 cls 创建 csp 页面

第三章 Caché 服务器页面简介 - 通过 cls 创建 csp 页面

创建第一个 CSP 页面

本节介绍如何以两种不同的方式创建 Hello, World CSP 页面:

创建基于类的 CSP 页面

通过创建 %CSP.Page 的子类并覆盖其 OnPage 方法来创建 CSP 页面。通过此方法写入主设备的任何输出都会自动发送到 Web 浏览器并显示为网页。

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· 三月 28, 2023 阅读大约需 1 分钟
安装本地 FHIR 服务器的最快最简单的方法!

嗨大家好!

最近我需要使用 IRIS For Health 设置本地 FHIR 服务器,我认为我找到了有史以来最简单的方法!

只需在终端中运行以下两行:

 docker run --rm --name my-iris -d --publish 9091:1972 --publish 9092:52773 intersystemsdc/irishealth-community

docker exec -it my-iris iris session iris -U "USER" '##class(%ZPM.PackageManager).Shell("install fhir-server")'

您将在 http://localhost:9092/fhir/r4 本地运行 FHIR 服务器。

就是这么简单!

FHIR 服务器将使用最新版本的 InterSystems IRIS for Health Community Edition,并将通过 FHIRSERVER 命名空间中的 IPM 包从该应用程序部署 FHIR 服务器

这是针对 Mac OS的,所以请在评论中添加它在 Windows 中的工作方式。

这是一篇非常短的文章,因为使用 InterSystems IRIS for Health 和IPM Package Manager 设置本地 FHIR 服务器真的很容易。

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· 五月 4, 2023 阅读大约需 11 分钟
在 Docker 中配置镜像

我们客户的一个共同需求是配置 HealthShare HealthConnect 和 IRIS的高可用性模式。

市场上的其他集成引擎通常被宣传为具有“高可用性”配置,但事实并非如此。通常,这些解决方案与外部数据库一起使用,因此,如果这些数据库未配置为高可用性,当发生数据库崩溃或与它的连接丢失时,整个集成工具将变得不可用。

对于 InterSystems 解决方案,这个问题不存在,因为数据库是工具本身的一部分和核心。 InterSystems 如何解决高可用性问题?深奥的配置会把我们拖入异化和疯狂的漩涡?不!在 InterSystems,我们倾听并处理了您的投诉(正如我们一直努力做的那样 ;)),并且我们已将镜像功能提供给所有用户和开发人员。

镜像

镜像如何工作?这个概念本身非常简单。如您所知,IRIS 和 HealthShare 都使用一个日志系统,该系统记录每个实例的数据库上的所有更新操作。这个日志系统是后来帮助我们在崩溃后恢复实例而不会丢失数据的系统。好吧,这些日志文件在镜像中配置的实例之间发送,允许并保持镜像中配置的实例永久更新。

架构

让我们简要解释一下在 Mirror 中配置的系统架构是什么样的:

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· 七月 7, 2023 阅读大约需 2 分钟
FAQ常见问题系列 - Production基础问题
  1. 主机和备机为什么总是切换,会不会是与仲裁机连接的心跳检测出问题了
    • 查看镜像状态 打开管理门户 - ‘系统操作’ - ‘镜像监视器’
    • 如遇到主备切换,可以通过消息日志查看切换原因 打开管理门户 - ‘系统操作’ - ‘系统日志’ - ‘消息日志’
  2. 基础问题怎么查询
    • 通过管理门户查看日志 打开管理门户 - ‘系统操作’ - ‘系统日志’ - ‘消息日志’
    • 通过监控告警日志 告警日志文件:<intall-dir>/mgr/alerts.log文件
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· 三月 5, 2021 阅读大约需 3 分钟
Global 扫描和切片

Global 扫描和切片

这是一个在 IRIS 2020.1 和 Caché 2018.1.3 上工作的代码示例
不会与新版本保持同步
也不会获得 InterSystems 提供的支持服务!   

大多数情况下,默认存储使用的 global 只有 1 个表示 IDKEY 的下标级别。 对于索引 global,可能有 2 个或更多下标级别。

数组、父子关系或扩展了基础数据类的持久化类 是具有更多下标级别的示例。 但所有这些 global 都非常统一。

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· 四月 26, 2022 阅读大约需 4 分钟
第124章 SQL函数 SECOND

第124章 SQL函数 SECOND

返回日期时间表达式的秒数的时间函数。

大纲

{fn SECOND(time-expression)}

参数

  • time-expression - 作为列名、另一个标量函数的结果或字符串或数字文字的表达式。它必须解析为时间戳字符串或 $HOROLOG 字符串,其中基础数据类型可以表示为 %Time%TimeStamp%PosixTime

描述

SECOND 返回一个从 059 的整数,也可能返回小数秒。秒数是针对 $HOROLOG$ZTIMESTAMP 值、ODBC 格式日期字符串(没有时间值)或时间戳计算的。

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肾脏疾病可以从一些医学界熟知的参数中发现。这样,为了帮助医学界和计算机系统,特别是人工智能,科学家Akshay Singh发表了一个非常有用的数据集,用于训练肾脏疾病检测/预测方面的机器学习(ML)算法。这份出版物可以在最大和最知名的ML数据库Kaggle上找到,网址是https://www.kaggle.com/datasets/akshayksingh/kidney-disease-dataset

关于数据集

该肾脏疾病数据集有以下元数据信息(来源:https://www.kaggle.com/datasets/akshayksingh/kidney-disease-dataset):

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· 九月 11, 2022 阅读大约需 5 分钟
第二十九章 管理许可(二)

第二十九章 管理许可(二)

激活许可证密钥

IRIS 使用许可证密钥来确保其注册站点的正常运行、定义可用容量并控制对 IRIS 功能的访问。 许可证密钥以许可证密钥文件的形式提供,通常命名为 iris.key

安装 IRIS 后,使用以下程序激活许可证密钥。始终可以使用相同的过程为任何已安装的实例激活新的许可证密钥(即升级密钥)。可以激活放置在管理门户可访问的任何位置的许可证密钥;作为激活的一部分,许可证密钥将作为 iris.key 复制到实例的 install-dir/mgr 目录(如果尚未命名)。

注意:也可以在 Windows 安装期间选择许可证密钥。执行此操作时,许可证会自动激活,并且许可证密钥会作为 iris.key 复制到实例的 install-dir/mgr 目录中;不需要此处描述的激活过程。

本节还讨论了许可证故障排除和在所有许可证单元都在使用时从操作系统命令行升级许可证。

要激活许可证密钥,请使用以下过程:

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· 九月 20, 2022 阅读大约需 2 分钟
在虚拟化环境中使用镜像的注意事项

在虚拟化环境中使用镜像,构成镜像的InterSystems IRIS实例被安装在虚拟主机上,创造了一个混合的高可用性解决方案,将镜像的优点与虚拟化的优点结合起来。镜像通过自动故障切换对计划内或计划外的故障提供即时响应,而虚拟化HA软件在计划外的机器或操作系统故障后自动重新启动承载镜像成员的虚拟机。这允许失败的成员迅速重新加入镜像,充当备份(或在必要时作为主机)。

当镜像被配置在虚拟化环境中时,请参考以下建议:

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· 十一月 10, 2022 阅读大约需 6 分钟
Caché 字符编码自动判断

Caché 字符编码自动判断

先说几个场景:

  1. 使用文件字符流打开一个文本文档,但是我不确定是以UTF8编码的还是GB18030,所以就无法准确设置TranslateTable,就导致了中文乱码问题。
  2. 有一个文件下载的csp,其中文件名参数可能是中文,如果在一个UTF8编码的界面直接调用时,后台取到的文件名就会是乱码。
  3. 接收到字节流后需要转成字符流读取内容,但是无法确定编码格式,就无法准确的转成字符。

以上几个场景虽然大多都可以提前做好约定解决,但是可能有历史原因或者种种情况,需要我们自己能够解决,于是就有了下面的故事。

基础

首先我方系统使用GB18030编码,然后碰到的情况大多都是对方可能是UTF8编码,所以主要来解决识别字节流是不是UTF8编码的。

然后查了一个UTF8编码格式

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· 三月 18, 2023 阅读大约需 3 分钟
第一章 高可用性解决方案 - IRIS HA 解决方案中的问题

第一章 高可用性解决方案 - HA 解决方案中的问题

高可用性(HA)指的是使系统或应用程序在长时间内保持正常运行并可供用户使用的目标,从而最大限度地减少计划内和计划外停机时间。 IRIS提供自己的HA解决方案,并轻松与操作系统提供商提供的常见HA解决方案集成。

维护高系统可用性的主要机制称为故障转移。在这种方法下,故障的主系统由备用系统代替;也就是说,生产故障转移到备份系统。许多HA配置还提供了灾难恢复(DR)机制,即当HA机制无法保持系统可用时,恢复系统可用性。

本页简要讨论可与基于 IRIS 的应用程序一起使用的一般 HA 策略,然后涵盖 IRIS HA 解决方案中的问题,提供 HA 解决方案功能比较,并讨论使用分布式缓存和故障转移策略

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IRIS 配置和用户帐户包含需要跟踪的各种数据元素,许多人难以在 IRIS 实例之间复制或同步这些系统配置和用户帐户。那么如何简化这个过程呢?

在软件工程中,CI/CD 或 CICD 是持续集成 (CI) 和(更常见的)持续交付或(较少见的)持续部署 (CD) 的组合实践集。 CI/CD 能消除我们所有的挣扎吗?

我在一个开发和部署 IRIS 集群的团队工作。我们在 Red Hat OpenShift 容器平台上的容器中运行 IRIS。

如果您当前没有使用 Kubernetes,请不要停止阅读。即使您没有使用 Kubernetes 或在容器中运行 IRIS,您也可能会遇到与我和我的团队面临的挑战类似的挑战。

我们决定将代码与配置分开,并将它们放在不同的 GitHub 存储库中。每次在代码库中进行提交时,都会触发管道运行。结果,从代码库中的文件构建了一个新image。

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第三十二章 开发Productions - ObjectScript Productions - 定义警报处理器 - 使用路由警报处理器

使用路由警报处理器

如果需要通过多种输出机制联系用户,警报处理器应该是一个业务流程,用于确定如何在消息中路由 Ens.AlertReques。在这种情况下,Productions必须为每个输出机制包含一个额外的业务操作,并且警报处理器将消息转发到这些业务操作。

将警报处理器定义为路由进程

要将警报处理器定义为路由流程,请创建一个可以在消息中接收 Ens.AlertRequest 的业务流程类。

业务流程将检查消息并将它们转发给不同的业务操作,具体取决于警报内容和包含的任何逻辑。

逻辑可能需要考虑以下因素:

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· 一月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
InterSystems IRIS医疗版2020.1 HL7基准测试

简介

最近完成了针对IRIS医疗版2020.1版本的性能及可扩展性基准测试,重点关注HL7v2的互操作性。本文介绍了在各种工作负载下观察到的吞吐量,并提供了IRIS医疗版用作HL7v2消息传输互操作性引擎时的系统常规配置和调整准则。

基准测试模拟了与实际环境接近的工作负载(详细信息请参见“工作负载说明和方法”部分)。本次测试的工作负载包括HL7v2患者管理(ADT)和生命体征结果(ORU)数据,并包含数据内容转换和路由。

IRIS医疗版2020.1版本可以表明,采用第二代Intel®Xeon®可扩展处理器和Intel®Optane™SSD DC P4800X系列SSD存储的商用服务器,每天的持续消息吞吐量超过23亿条(入站和出站总量),与此前的Ensemble 2017.1 HL7v2吞吐量基准测试相比,扩展性提高了一倍多。

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· 五月 20, 2021 阅读大约需 7 分钟
互操作消息统一管理系列:MessageBank

一. 企业信息库简介

企业信息库(MessageBank)是一个可选的远程归档设施,可以从多个来自不同实例的互操作性Production中收集信息、事件日志项目和搜索表项。如下图所示:
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这套环境由两种角色的实例构成:
企业信息库服务器,它本身也是一个Production,完全由Message Bank服务组成,接收来自任何数量的客户Production提交的消息、日志等。

客户端Operation(Message Bank Operation),将其添加到一个正在运行的Production中,并用企业信息库服务器的地址进行配置。如连接通畅,消息和日志即可自动转发到Message Bank并在其中存储。

为了使你能方便地看到信息库中的信息,InterSystems IRIS®提供了以下附加选项。

对于企业信息库实例,管理门户自动包括企业监控器页面,在那里你可以监控客户端Production的状态,浏览消息库,并对被监控客户的消息进行检索。

对于每个客户端实例,你在消息库实例中配置一个到企业监控器的链接。

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· 九月 15, 2022 阅读大约需 3 分钟
第三十三章 管理许可(六)

第三十三章 管理许可(六)

应用许可

应用程序许可使应用程序合作伙伴能够利用 的许可功能来实现自己的许可目的。 IRIS 像管理自己的应用程序许可证一样管理客户应用程序许可证,维护使用计数并根据需要获取和返回用户许可证。当进程退出、停止或从进程表中删除时,或者当 Web 会话超时或被删除时,进程或 Web 会话使用的应用程序许可证与进程或会话使用的 IRIS 许可证一起自动释放。

应用程序许可证只是标准 .ini 格式的文件或此类文件的一部分,包含标识应用程序的部分标题和一些keyword=value对,在许可证中是唯一的,代表许可的功能。任何格式正确的应用程序许可证都可以在运行时由应用程序加载到 IRIS

应用程序许可 API 包括使应用程序能够代表用户使用和返回许可证的方法和查询,以及使程序能够获取有关应用程序和功能许可的信息,包括正在使用和仍然可用的许可证数量。

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