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· 十月 23, 2023 阅读大约需 12 分钟
FHIR Profile - FHIR扩展与再约束

FHIR标准提供灵活的扩展与再约束机制 - Profile。到底Profile机制如何工作?什么样的扩展需要用到Profile?怎么建立Profile?


FHIR核心资源模型 - FHIR Core

FHIR发布的资源模型是按80/20原则设计的 - 最常用那80%的用例中需要的数据会被涵盖在FHIR核心资源模型中,这些数据需求可能只是所有用例需要数据的20%;通过对核心资源的扩展和再约束,可以让它们适用于不常见的20%用例和未被涵盖的80%的数据需求。

FHIR发布的资源模型是FHIR核心资源模型(FHIR Core),它们有如下特点:

1. 对象模型 - 有继承关系。所有资源都继承自DomainResource

2. 为了保证最大的适用度,资源中的绝大多数属性的最小基数都是0,意味着它们都可以为空

3. 资源的属性可以通过code(值集)、coding、CodeableConcept(术语)进行取值范围约束

4. 为了防止医疗错误,所有的属性都没有且不能有默认值

当需要对核心资源模型进行扩展和再约束时,FHIR提供了profile机制对所做的扩展和再约束进行画像(描述),这就是profile的意思。

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· 十二月 27, 2023 阅读大约需 7 分钟
FHIR小百科 - 处方的表达

在医疗行业中,处方是个非常重要的临床工作数据概念。因此,在考察用FHIR能如何构造我国所需医疗行业数据模型时,就会需要考虑如何用FHIR表达处方。

在2019年,FHIR的工作组已否认需要使用特定的资源来表达处方(不是药嘱)这个概念,见:

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· 六月 13, 2023 阅读大约需 13 分钟
IRIS镜像的监控和警告

在维护IRIS的镜像前,管理员需要清楚的了解以下一些概念:

Mirror的切换模式(failover mode)

切换模式在镜像监视器里被翻译成”故障转移模式“。 有两种模式:

  • Agent Controlled模式:
  • Arbiter Controlled模式:(页面上翻译为“仲裁程序受控制”)

通常情况,生产环境的镜像是安装了arbiter(仲裁者)的。Mirror启动时,在还没有连接上arbiter的时候,自动进入Agent-Controlled模式。而后当两台机器,主机,备机都连通了Arbiter,会保持在这个模式。

  • 主备之间有连接;
  • 又都连到arbiter;
  • backup is active,

满足上面的条件,就进入arbiter controlled mode。而如果主备的任一方,失去了和arbiter的连接,或者备用侧丢了active, 开始尝试连接另一方,退回到agent-controlled模式。

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· 八月 7, 2023 阅读大约需 1 分钟
如何自定义 Web 网关错误消息

InterSystems 常见问题解答标题

您可以为以下 Web Gateway 错误消息/系统响应设置单独的错误页面:

  • 服务器错误
  • 服务器繁忙
  • 服务器无法使用
  • 服务器超时
  • 连接关闭

在 Web Gateway 管理界面上进行设置([Management Portal] > [System Administration] > [Configuration] > [Web Gateway Management] > [Configuration] > [Default Parameters])。

在“默认参数”(Default Parameters )菜单的“错误页面”部分中,设置要显示的 html 页面的文件名或发生错误时要重定向到的 URL。

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· 九月 3, 2023 阅读大约需 7 分钟
在 Python 上使用IRIS REST API 进行 SQL 迁移

对于即将到来的Python 竞赛,我想制作一个小型演示,介绍如何使用 Python 创建一个简单的 REST 应用程序,该应用程序将使用 IRIS 作为数据库。使用这个工具

  • FastAPI框架,高性能,易学,快速编码,可用于生产
  • SQLAlchemy 是 Python SQL 工具包和对象关系映射器,为应用程序开发人员提供 SQL 的全部功能和灵活性
  • Alembic 是一个轻量级数据库迁移工具,可与 SQLAlchemy Database Toolkit for Python 一起使用。
  • Uvicorn 是 Python 的 ASGI Web 服务器实现。

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· 六月 13, 2023 阅读大约需 4 分钟
第五十六章 镜像中断程序 - 计划外停机程序

第五十六章 镜像中断程序 - 计划外停机程序

计划外停机程序

当一个故障转移成员意外失败时,适当的程序取决于哪个 实例失败,镜像所处的故障转移模式(参见自动故障转移机制详述),另一个故障转移成员实例的状态,两个故障转移成员的 ISCAgent 的可用性, 和镜像的设置。

  • 备份故障转移成员的计划外中断
  • 具有自动故障转移的主要故障转移成员的计划外中断
  • 未发生自动故障转移时主要故障转移成员的计划外中断
  • 主要故障转移成员的计划外隔离
  • 两个故障转移成员的计划外中断

在阅读和使用本节时,您能需要查看对各种中断情况的镜像响应,其中讨论了主服务器变得不可用时备份行为的详细信息。

备份故障转移成员的计划外中断

当备份故障转移成员的 实例或其主机系统发生故障时,主要继续正常运行,尽管某些应用程序可能会出现短暂的暂停(有关详细信息,请参阅备份中断的影响)。

当备份发生意外中断时,纠正导致故障的条件,然后重新启动备份实例或主机系统。当备份的 实例重新启动时,它会自动加入镜像作为备份。

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· 七月 12, 2023 阅读大约需 4 分钟
当 GPT 与 FHIR 碰撞出火花:利用Open API 的规范力量

FHIR 通过提供标准化数据模型来构建医疗保健应用程序并促进不同医疗保健系统之间的数据交换,彻底改变了医疗保健行业。由于 FHIR 标准基于现代 API 驱动的方法,因此移动和 Web 开发人员更容易使用它。然而,与 FHIR API 交互仍然具有挑战性,尤其是在使用自然语言查询数据时。

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第五十七章 镜像中断程序 - 在手动故障转移之前确定备份是否处于活动状态

在手动故障转移之前确定备份是否处于活动状态

假设有两个名为 IRIS AIRIS B 的故障转移成员。如果 ^MIRROR 例程确认备份 (IRIS B) 在与主 (IRIS A) 丢失联系时处于活动状态,因此具有最新的来自 IRIS A 的日志数据,可以使用单个过程手动进行故障转移。当连接因主要故障而丢失时,不会造成数据丢失的风险。但是,当发生多个故障时,活动备份可能没有来自主服务器的所有最新日志数据,因为主服务器在连接丢失后继续运行了一段时间。

使用以下过程确定备份是否处于活动状态:

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· 七月 12, 2023 阅读大约需 4 分钟
如何利用 InterSystems 开放交换工具进行快速 API 开发

在本文中,我将分享我们在 2023 年全球峰会技术交流室中提出的主题。我和@Rochael.Ribeiro

借此机会,我们就以下话题进行探讨:

  • 用于快速 API 的开放交换工具
  • 开放API规范
  • 传统与快速 Api 开发
  • 复合 API(互操作性)
  • 规范优先或 API 优先方法
  • API 治理和监控
  • 演示(视频)

用于快速 API 的开放交换工具

当我们谈论快速现代 API 开发(Rest / json)时,我们将使用两个 Intersystems Open Exchange 工具:

第一个是用于快速开发 API 的框架,我们将在本文中详细介绍。

https://openexchange.intersystems.com/package/IRIS-apiPub

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图像

你好社区

在本文中,我将介绍我的应用程序irisChatGPT ,它是基于LangChain Framework构建的。

首先,让我们对框架进行一个简单的概述。

全世界都在谈论ChatGPT以及大型语言模型 (LLM) 如何变得如此强大,并且表现超出预期,提供类似人类的对话。这只是将其应用于每个企业和每个领域的开始!

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第五十六章 开发Productions - ObjectScript Productions - 不常见的任务 - 在适配器类中包含凭据

在适配器类中包含凭据

要在适配器类中包含生产凭证,请在类定义中执行以下操作:

  • 包括名为 Credentials 的设置。
  • 定义一个名为 CredentialsSet() 的方法,该方法使用 Credentials 设置的值作为键来查找 Credentials 表中的用户名和密码。然后实例化一个包含用户名和密码的凭据对象。

覆盖Production凭证

虽然Production凭证系统集中管理并将登录数据保留在源代码之外,但有时需要编写代码以从其他来源获取凭证。例如,代码可能会从 Web 表单或 cookie 中检索用户名和密码,然后将它们与 HTTP 出站适配器一起使用以连接到其他站点。

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· 八月 10, 2023 阅读大约需 2 分钟
如何比较两个数据库中的多个Global和Routines

InterSystems 常见问题解答

※如果您想比较使用Mirror、Shadow或其他机制复制的数据库,请使用此方法。

您可以使用 DATACHECK 实用程序来比较Global。请参阅下面的文档。
DataCheck 概述 [IRIS]

***

Routines比较使用系统例程 %RCMP 或管理门户。

以下是如何在管理门户中使用它。

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· 八月 26, 2023 阅读大约需 3 分钟
第十章 ObjectScript - 按值或按引用传递变量

第十章 ObjectScript - 按值或按引用传递变量

按值或按引用传递变量

调用方法时,可以通过值或引用将变量值传递给该方法。在大多数情况下,这些变量是没有下标的局部变量,因此本节首先讨论这些变量。

与其他编程语言一样, IRIS 具有一个存储位置,其中包含每个局部变量的值。变量的名称充当内存位置的地址。

当将没有下标的局部变量传递给方法时,可以按值传递该变量。这意味着系统会复制该值,从而使原始值不受影响。要传递内存地址,请在参数列表中紧邻变量名称之前放置一个句点。

为了演示这一点,请考虑名为 Test.Parameters 的类中的以下方法:

ClassMethod Square(input As %Integer) As %Integer
{
    set answer=input*input
    set input=input + 10
    return answer
}

假设定义一个变量并将其按值传递给此方法:

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· 九月 5, 2023 阅读大约需 2 分钟
第十九章 ObjectScript - 执行例程

第十九章 ObjectScript - 执行例程

执行例程

执行例程时,使用DO命令,如下所示:

 do ^routinename

要执行一个过程、函数或子程序(不访问其返回值),可以使用以下命令:

 do label^routinename

 do label^routinename(arguments)

要执行过程、函数或子例程并引用其返回值,可以使用$$label^routinename$$label^routinename(参数)形式的表达式。例如:

 set myvariable=$$label^routinename(arguments)

在所有情况下,如果标签位于同一个例程中,则可以省略插入符号和例程名称。例如:

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· 十一月 20, 2023 阅读大约需 2 分钟
Java 大赛作品展示--基于IRIS 原生 Java API 的Global编辑器

这是Java 编程比赛的相关文章。

我决定推出一个基于 IRIS Native API for Java 的 CRUD++ Global编辑器。
++因为它不仅仅是C reate、 R ead、 U pdate、 D elete
Global可视化对于立即查看结果始终很重要。

  • 为此,我使用模仿 ZWrite 的树查看器扩展了 API,并且还允许检查子树。
  • $Query Style Navigator 正向和反向操作可轻松找到感兴趣的全局节点。
  • 最后,ZKill 添加了一个选项,可以删除全局节点的内容而不删除下面的子树。

这需要在服务器端有一个小的帮助器类作为默认 API 的扩展

我的策略是拥有一个可从命令行使用的相当适度的界面
就像在 Docker 控制台或终端上一样,并使其尽可能简单。
花哨的图形界面只会分散示例的基本内容。

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第十一章 创建Callout Library - 使用 J 链接类型传递标准计数字符串

使用 J 链接类型传递标准计数字符串

iris-callin.h 头文件定义了计数字符串结构 IRIS_EXSTR,表示标准 IRIS 字符串。此结构包含一个字符元素数组(8 位、16Unicode32wchar t)和一个指定数组中元素数量的 int 值(最多字符串长度限制):

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第二十九章 开发Productions - ObjectScript Productions - 定义业务操作 - 定义消息处理程序方法

定义消息处理程序方法

当创建业务操作类时,通常最大的任务是编写用于此适配器的消息处理程序,即接收生产消息的方法,然后调用适配器的方法以便与生产之外的目标进行通信。

每个消息处理程序方法都应具有以下签名:

Method Sample(pReq As RequestClass, Output pResp As ResponseClass) As %Status

这里Sample是方法名,RequestClass是请求消息类名,ResponseClass是响应消息类名。

通常,该方法应执行以下部分或全部操作:

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· 七月 13, 2023 阅读大约需 1 分钟
国际主流医疗数据标准一览

前不久,北京市人民政府印发了《关于更好发挥数据要素作用进一步加快发展数字经济的实施意见》的通知。其中提到要“率先探索数据跨境流通”。今年1月,北京市互联网信息办公室也发文公示,首都医科大学附属北京友谊医院与荷兰阿姆斯特丹大学医学中心合作研究项目成为全国首个被北京网信办批准的数据出境安全评估案例(编号20220001)。可以预见,为更好发挥数据要素作用将来可能出现越来越多的跨境数据流通。那么我们今天仅仅看下,在医疗领域国际主要流行的数据标准都有哪些。

以下是国际数字医疗合作组织的主要统计(该组织协同了世界卫生组织WHO,OECD和33个不同的国家和地区)

从上表可以看出,数据共享领域 DICOM,HL7 v2, CDA, FHIR,v3 是主要的标准,在临床术语方面 ICD9/10/11, SNOMED 和Lionc是目前国际上各个国家和地区最主流的医疗数据标准。供大家参考。

相关阅读

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· 七月 27, 2023 阅读大约需 3 分钟
第四章 HL7 架构和可用工具 - 查看数据结构

第四章 HL7 架构和可用工具 - 查看数据结构

查看数据结构

当单击“数据结构”列中的名称时,InterSystems 会显示该数据结构中的所有字段。这是 HL7 数据结构页面。显示的以下列是最有用的:

  • 组件列列出了可用于访问段内字段的数字。
  • 属性名称列列出了可用于访问段内字段的名称。
  • 单击“数据结构”列中的条目可深入了解详细信息。
  • 单击“代码表”列(如果有)中的条目可查看可在此字段中输入的有效代码。

当单击上面段结构页面中名为 2.3:XCN 的数据结构项时,将出现以下示例页面。该页面指出类别 2.3 数据结构 XCN 描述“扩展复合 ID 号和名称”并由 14 个字段组成。其中,有些是简单值,有些是数据结构,有些是代码。

有了这些信息,就可以为消息结构 2.3:ADT_A01 中的复杂 PR1grp().PR1:Surgeon 字段创建虚拟属性路径,如下所示:

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· 八月 27, 2023 阅读大约需 1 分钟
第十一章 ObjectScript - 操作符

第十一章 ObjectScript - 操作符

操作符

ObjectScript 中的运算符优先级严格是从左到右;在表达式中,运算按照它们出现的顺序执行。可以在表达式中使用显式括号来强制某些操作先于其他操作执行。

通常,即使并不严格需要括号,也会使用括号。很有用,因为它使代码的意图更加清晰。

Familiar Operators

ObjectScript 为常见活动提供以下运算符:

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· 九月 5, 2023 阅读大约需 11 分钟
HTTP请求监控响应时间

嗨,开发者们!

今天我想谈谈一个让我感到困难的话题。我相信你们中的很多人一定已经遇到过这种情况(所谓的“瓶颈”)。由于这是一个广泛的主题,因此本文将仅重点关注识别可能导致缓慢问题的传入 HTTP 请求。我还将向您提供我开发的一个小工具来帮助识别它们。

我们的软件变得越来越复杂,处理来自不同来源的大量请求,无论是前端还是第三方后端应用程序。为了确保最佳性能,必须有一个能够记录一些关键测量的日志系统,例如响应时间、global引用的数量以及每个 HTTP 响应执行的代码行数。作为工作的一部分,我参与了 EMR 软件的开发以及事件分析。由于用户负载主要来自 HTTP 请求(REST API 或 CSP 应用程序),因此在发生普遍缓慢问题时进行此类测量的需求变得显而易见。

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· 十二月 16, 2023 阅读大约需 4 分钟
第三十七章 XML 模式的高级选项 - 超类如何表示为类型

第三十七章 XML 模式的高级选项 - 超类如何表示为类型

超类如何表示为类型

如果需要 XML 架构来显示特定的类型层次结构,则需要了解映射如何解释 IRIS 类层次结构。

类层次结构代表了有意义的数据组织等。该层次结构尽可能地反映在相应的 XML 类型定义中。

例如,假设有以下类:
- 名为 Base 的类,定义了三个公共属性(Property1Property2Property3)。
- 名为 Addition1 的类,它扩展 Baseand 并定义一个附加公共属性 (Addition1)。
- 名为 Addition2 的类,它扩展 Addition1 并定义一个附加公共属性 (Addition2)。

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第十五章 创建Callout Library - 处理 UNIX 信号处理错误

处理 UNIX 信号处理错误

UNIX 及相关操作系统下运行时,如果进程收到信号,某些系统调用可能会失败,最常见的是打开、读取、写入、关闭、ioctl 和暂停。如果函数使用任何这些系统调用,代码必须能够区分真正的错误、Ctrl-C 和应重新启动的调用。

以下函数允许检查异步事件并在 $ZF 中设置新的警报处理程序。函数声明包含在 iris-cdzf.h 中:

sigrtclr()

int sigrtclr(); — 清除重试标志。应在使用 sigrtchk() 之前调用一次。

dzfalarm()

int dzfalarm(); — 建立新的 `SIGALRM 处理程序。

进入 $ZF 时,会自动保存先前的处理程序。退出时会自动恢复。用户程序不应改变任何其他信号的处理。

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· 三月 22 阅读大约需 4 分钟
IRIS/Caché SQL优化经验分享 - Collation(排序规则)

这个帖子内容有点深。如果您读的有困难,请直接跳过这篇,对绝大多数IRIS/Caché使用者,它一点都不重要。

数据库表的Collation(排序规则)本来是一个非常简单的概念。说到它是因为曾经发现过由Collation引起的性能问题。

我试图用一句话来解释数据库的排序规则:

  • 绝大多数数据库因为业务查询需要,保存的字符型数据是不分大小写的。当你执行一个 order by, group by, distinct,like等等条件查询时,因为这个不分大小写的collation,你得到的结果也不分大小写。例如,对名字做group by, James, james一定是在一组。
  • 如果非要区分大小写,会在查询的时候使用一个函数
  • 因为要操作非英语的字符集,以及可以被当作字符看待的数字类型,适应不同的排序规则,一个数据库可能有很多种Collation类型。

很简单,在表一级定义Collation的SQL语句是:

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· 七月 4, 2023 阅读大约需 11 分钟
小实验--生成式AI和 FHIR 结合

这是个实验项目,使用OpenAI API与FHIR资源和Python相结合来回答医疗行业的用户提问。

项目想法

生成式人工智能,如OpenAI上提供的LLM模型, 已被证明在理解和回答高层次问题方面具有显著能力。他们使用大量的数据来训练他们的模型,因此他们可以回答复杂的问题。

他们甚至可以使用编程语言,根据提示创建代码 --我不得不承认,让我的工作自动化的想法让我感到有些焦虑。但到目前为止,似乎这是人们必须要习惯的事情,不管你喜不喜欢。所以我决定做一些尝试。

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第五十七章 开发Productions - ObjectScript Productions - 不常见的任务 - 以编程方式使用查找表

IRIS 提供了名为 Lookup() 的实用函数,以便可以轻松地从业务规则或 DTL 数据转换中执行表查找。此功能仅在创建至少一个查找表并用适当的数据填充后才起作用。

有关定义查找表的信息,请参阅配置产品中的定义数据查找表。

如果需要比管理门户提供的更直接的查找表操作,请在类中使用 Ens.Util.LookupTable。此类公开查找表以通过对象或 SQL 进行访问。此外,它还提供类方法来清除表、将数据导出为 XML 以及从 XML 导入数据。

Ens.Util.LookupTable提供以下字符串属性:

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· 七月 30, 2023 阅读大约需 3 分钟
第七章 HL7 架构和可用工具 - 使用 HL7 消息查看器页面

第七章 HL7 架构和可用工具 - 使用 HL7 消息查看器页面

使用 HL7 消息查看器页面

HL7 提供了消息查看器页面。可以使用此页面显示、转换和导出 HL7 消息(外部文件或来自生产消息存档的消息)。

要访问此页面,请选择互操作性 > 互操作 > HL7 v2.x > HL7 v2.x 消息查看器。

选择选项

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· 八月 14, 2023 阅读大约需 4 分钟
第二十二章 参考 - HL7业务服务的设置

第二十二章 参考 - HL7业务服务的设置

提供HL7业务服务设置的参考信息。

HL7最重要的设置如下:
- 池大小-默认值为1,可以支持FIFO(先进先出)处理。在许多情况下,必须按顺序接收多个患者的人口统计更新。例如,许多应用程序在处理订单消息之前需要接收ADT注册消息,在收到结果消息之前必须接收订单消息,等等。
- 类别—此文本标签允许在配置图中对配置项进行排序。
- 追加时间戳-(仅限文件)在存档路径中的文件名追加时间戳。
- 归档路径-(仅限文件和FTP)指定HL7消息归档的位置。
- 呼叫间隔-在寻找更多输入之前等待的秒数。缺省值是5秒。最小值是0.1秒。

Ack Mode

帮助建立发布 HL7 确认消息以响应收到的 HL7 消息的格式和约定。对于业务服务,此设置可以具有下表中显示的值之一。

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