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姚 鑫 · 三月 4, 2021 阅读大约需 11 分钟
第三章 SQL语言元素(二)

第三章 SQL语言元素(二)

算术运算符和函数

InterSystems SQL支持以下算术运算符:

  • + 加法操作符。
    例如,17+7 = 24

  • 减法运算符。
    例如,17-7等于10
    注意,这些字符中的一对是InterSystems SQL注释指示器。
    因此,要指定两个或多个减法操作符或负号,必须使用空格或圆括号。
    例如,17- -7或17-(-7)等于24

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姚 鑫 · 三月 1, 2021 阅读大约需 7 分钟
第二章 InterSystems SQL基础

第二章 InterSystems SQL基础

本章概述了InterSystems SQL的特性,特别是那些SQL标准未涵盖的特性,或者与InterSystems IRIS®数据平台统一数据架构相关的特性。
本教程假定读者具备SQL知识,并不是为介绍SQL概念或语法而设计的。

本章讨论以下主题:
- 表
- 查询
- 权限
- 数据显示选项
- 数据排序类型
- 执行SQL

在InterSystems SQL中,数据显示在表中。每个表都包含许多列。一个表可以包含零个或多个数据值行。以下术语大体上等效:

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在使用xDBC连接到字符集为US7ASCII的Oracle数据库时,大家可能遇到过中文的乱码问题,尤其是使用Oracle自己的xDBC驱动的时候。

字符集为US7ASCII的Oracle数据库虽然可以保存中文数据,但给客户端带来了很多麻烦,需要对获取和提交的数据进行转码。

 

在Ensemble/Health Connect/InterSystems IRIS 中使用SQL适配器连接到这样的Oracle数据库时,可以使用$ZCVT函数进行转码。

1. $ZCVT函数

$ZCVT函数是广泛使用的字符串转换函数,可以做大小写转换、编码转换、URL 和 URI 转换等。我们用其编码转换能力来解决字符集转码问题。

 

2. 获取的SQL结果集数据有中文时

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姚 鑫 · 三月 6, 2021 阅读大约需 16 分钟
第五章 SQL定义表(一)

第五章 SQL定义表

表名称和架构名称

可以通过定义表(使用CREATE TABLE)或通过定义投影到表的持久类来创建表:

  • DDL:InterSystemsIRIS®数据平台使用CREATE TABLE中指定的表名来生成相应的持久类名,并使用指定的架构名来生成相应的包名。
  • 类定义:InterSystemsIRIS®数据平台使用持久类名称来生成对应的表名,并使用包名称来生成对应的模式名。

由于以下原因,这两个名字之间的对应关系可能不相同:

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Claire Zheng · 一月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
InterSystems IRIS医疗版2020.1 HL7基准测试

简介

最近完成了针对IRIS医疗版2020.1版本的性能及可扩展性基准测试,重点关注HL7v2的互操作性。本文介绍了在各种工作负载下观察到的吞吐量,并提供了IRIS医疗版用作HL7v2消息传输互操作性引擎时的系统常规配置和调整准则。

基准测试模拟了与实际环境接近的工作负载(详细信息请参见“工作负载说明和方法”部分)。本次测试的工作负载包括HL7v2患者管理(ADT)和生命体征结果(ORU)数据,并包含数据内容转换和路由。

IRIS医疗版2020.1版本可以表明,采用第二代Intel®Xeon®可扩展处理器和Intel®Optane™SSD DC P4800X系列SSD存储的商用服务器,每天的持续消息吞吐量超过23亿条(入站和出站总量),与此前的Ensemble 2017.1 HL7v2吞吐量基准测试相比,扩展性提高了一倍多。

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如果看了前一篇InterSystems IRIS医疗行业版创建FHIR服务器,应该您已经搭建好了FHIR服务器和FHIR资源仓库。除了使用FHIR REST API来操作这个FHIR服务器,您还可以更直观地看看它的价值 - 使用SMART on FHIR应用。这次,基于上次建好的FHIR服务器,我们用10分钟把一个SMART on FHIR运行起来。

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InterSystems IRIS/Caché的CDC

InterSystems IRIS/Caché未提供开箱即用的变更数据捕获(CDC)工具,而且由于其多模型建模能力和底层的多维存储模型,相对于关系型数据库的单一模型,针对于SQL的CDC在InterSystems IRIS/Caché上会更复杂一些。例如通过Journal日志记录的是底层持久化多维数组的数据变更,而不是SQL table的变更。

通常,在应用层面实现变更数据捕获是更灵活和简单的方式,例如通过设置触发器、类的DSTIME参数。但如果无法在应用层做CDC,可以考虑使用InterSystems IRIS/Caché的Journal和强大的开发能力获取数据变更。

这里介绍使用InterSystems IRIS/Caché的Reporting类型的异步镜像成员获取数据变更。

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Muhammad Waseem · 十月 16, 2021 阅读大约需 2 分钟
如何使用HL7相應地更新結果參考範圍和異常標誌

在本文中,我將演示以下內容:

  • 使用自定義實用程序函數從數據庫更新 ReferencesRange(OBX:7) 針對 ObservationIdentifier(OBX:3.1)[TestCode]
  • 根據數據庫實用程序函數中的 ObservationIdentifier(OBX:3.1)[TestCode] 和 ObservationValue(OBX:5)[Result] 更新異常標誌 (OBX:8)
  • 基於異常標誌的路由消息 (OBX:8)

以下是主要和轉換後的 HL7 2.5 ORU_R01 消息:
 

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2021年9月13日,中国 北京—— 致力于帮助客户解决最关键的可扩展性、互操作性和速度问题的创新数据技术提供商InterSystems今日宣布在中国推出InterSystems IRIS医疗版互联互通套件,以满足医院信息化建设的标准化要求,促进业务协同,助力公立医院高效建设互联互通平台。

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姚 鑫 · 三月 5, 2021 阅读大约需 9 分钟
第四章 SQL标识符

第四章 标识符

标识符

标识符是SQL实体的名称,例如表、视图、列(字段)、模式、表别名、列别名、索引、存储过程、触发器或其他SQL实体。
标识符名称在其上下文中必须是唯一的;
例如,同一模式中的两个表或同一表中的两个字段不能具有相同的名称。
但是,不同模式中的两个表或不同表中的两个字段可以具有相同的名称。
在大多数情况下,相同的标识符名称可以用于不同类型的SQL实体;
例如,一个模式、该模式中的表以及该表中的字段都可以具有相同的名称,而不会产生冲突。
但是,同一个模式中的表和视图不能具有相同的名称。

InterSystems IRIS®数据平台SQL标识符遵循一组命名约定,根据标识符的使用,这可能会受到进一步的限制。
标识符不区分大小写。

标识符可以是简单标识符,也可以是分隔符。
InterSystems SQL默认支持简单标识符和分隔标识符。

简单标识符

简单标识符有以下语法:

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Nicky Zhu · 五月 7 阅读大约需 3 分钟
一个新库引发的血案

我们的一位客户五一期间向使用IRIS搭建的数据流推送一家三甲医院数年的历史数据,导致实施的同事们经历了一系列噩梦,包括但不限与:

1. 由于未通知实施团队有这样规模的数据推送,数据推送过程与全库备份任务重叠。尽管实例和数据流正常运行,但备份任务与数据流争抢IO,导致备份任务不能在预期时间内完成,实施童鞋五一加班处理问题。

2. 为了节省磁盘空间,服务器上部署了定期删除IRIS备份文件的任务,原本能够保持一周的全备+增量备份,但在本次数据暴增的情况下,新的备份尚未完成而旧的全备已被删除,导致问题发生时没有可用于恢复的备份。

3. 由于这次数据推送前未进行数据质量校验,推送的数据全部不合规,但已经历了较长的数据流进行处理全部入库;同时由于备份文件已被删除,无法通过恢复数据库的方法回滚,导致实施童鞋不得不逐条从生产环境三个库的数百张表中挑出问题数据逐一删除,从五一放假结束至今还未完成善后工作。大家可以设想一下,如果备份还在,那么恢复备份就可以了。

因此,我们希望再次提醒各位在前线奋斗的亲们:

1. 善待你的备份。尽管对于大型医院或医疗集团来说,两周的全备+增量备份策略下,备份文件会占据数个TB的存储空间。但在需要回滚时,这几个T的空间能救命。

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姚 鑫 · 五月 12, 2021 阅读大约需 4 分钟
第五章 管理全局变量(一)

第五章 管理全局变量(一)

管理门户提供管理全局变量的工具,系统类提供执行某些相同任务的方法。本章介绍如何使用这些工具。

一般建议

与ObjectScript命令SETMERGEKILL和其他命令一样,这里描述的工具提供了直接访问操作全局变量的权限。如果通过全局访问删除或修改,则会绕过所有对象和SQL完整性检查,并且没有撤消选项。因此,在执行这些任务时要非常小心,这一点很重要。(查看和导出不会影响数据库,并且是安全活动。)

使用本章中介绍的工具时,请确保以下事项:

  • IRIS使用哪些全局变量。并不是所有这些都被视为“系统”全局变量-也就是说,即使没有选中“系统”复选框,它们中的一些也是可见的。其中一些全局变量存储代码,包括的代码。
  • 确保知道应用程序使用哪些全局变量。

即使应用程序从不执行任何直接全局访问,应用程序也会使用全局变量。请记住,如果创建持久类,则它们的数据和任何索引都存储在全局变量中,全局变量的名称基于类名(默认情况下)。

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姚 鑫 · 三月 27, 2021 阅读大约需 11 分钟
第十三章 使用动态SQL(五)

第十三章 使用动态SQL(五)

从结果集中返回特定的值

要从查询结果集中返回特定的值,必须一次一行遍历结果集。
要遍历结果集,请使用%Next()实例方法。
(对于单一值,结果对象中没有行,因此%Next()返回0,而不是错误。)
然后,可以使用%Print()方法显示整个当前行的结果,或者检索当前行的指定列的值。

%Next()方法获取查询结果中下一行的数据,并将该数据放入结果集对象的data属性中。
%Next()返回1,表示它位于查询结果中的某一行上。
%Next()返回0,表示它位于最后一行(结果集的末尾)之后。
每次调用%Next()返回1个增量%ROWCOUNT;
如果游标定位在最后一行之后(%Next()返回0),%ROWCOUNT表示结果集中的行数。

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姚 鑫 · 二月 12, 2021 阅读大约需 2 分钟
第三十二章 Caché 变量大全 $ZJOB 变量

第三十二章 Caché 变量大全 $ZJOB 变量

包含JOB状态信息。

大纲

$ZJOB
$ZJ

描述

$ZJOB包含一个数字,其中每个位代表作业状态的一个特定方面。 $ZJOB返回一个整数,该整数由设置的状态位的总和组成。例如,如果$ZJOB = 5,则表示设置了1位和4位。

要测试单个$ZJOB位设置,可以使用整数除(\)和模(#)运算符。例如,$ZJOB\x#2,其中x是位号。下表显示了位的布局(按位的位置值)、其设置和含义:

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尽管IRIS和HealthConnect拥有全面的互操作特性,但在实际工作中,还是有可能遇到需要使用遗留类库,dll SDK等方式与外部应用通信的情况。例如IRIS中并没有内嵌国密算法SM2、SM3和SM4,而开源社区中不乏通过Java、Python和C++等语言完成的具体实现。本文就将以调用SM4的Java实现为例展示ObjectScript程序与第三方语言通信的过程。

Github地址:https://github.com/LinZhuISC/javademo.SM4

跨编程环境调用设计要点

在开始实际操作之前,希望读者先针对整个调用过程中的主调方和被调方思考两个现象:

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姚 鑫 · 二月 14, 2021 阅读大约需 1 分钟
第三十四章 Caché 变量大全 $ZNAME 变量

第三十四章 Caché 变量大全 $ZNAME 变量

包含当前例程名称。

大纲

$ZNAME
$ZN

描述

$ZNAME包含在当前进程上执行的例程的名称。通常,这是ZLOAD加载的当前例程。如果当前没有执行任何例程,则$ZNAME包含空字符串。

当ZLOAD加载一个例程时,它将成为所有名称空间中当前进程的当前加载例程。因此,可以使用$ZNAME显示任何名称空间中当前加载的例程的名称,而不仅仅是加载该例程的名称空间。

例程名称区分大小写。

请注意,尝试ZLOAD例程失败会删除当前加载的例程,并将$ZNAME设置为空字符串。

不能使用SET命令修改此特殊变量。尝试这样做会导致错误。

$ZNAME值可以通过以下任何命令设置:

  • ZLOAD command
  • ZSAVE command
  • 无参数ZREMOVE命令(设置为空字符串)
  • DO command
  • GOTO command with ^routine
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Caché Shadow

上次介绍了使用InterSystems IRIS/Caché的Reporting类型的异步镜像成员获取数据变更。但早期的Caché并不支持镜像,例如Caché 2008,它只支持Shadow。

在这些早期版本上是否也可以实利用Journal实现类似CDC的功能呢?答案是肯定的,就是利用Shadow服务器的Dejournaling filter routine (Dejournaling过滤器routine)。

Dejournaling filter routine

InterSystems Caché的 Dejournaling过滤器routine是一个用户自定义的routine,用于在Shadow服务器上过滤Journal记录。当配置了Dejournaling 过滤器后,Shadow服务器在redo journal前会自动调用Dejournaling过滤器routine。该routine传入参数以下:

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姚 鑫 · 四月 9, 2021 阅读大约需 4 分钟
第二十一章 导入和导出SQL数据

第二十一章 导入和导出SQL数据

在InterSystems IRIS®Data Platform Management Portal中,有用于导入和导出数据的工具:
- 从文本文件导入数据
- 将数据导出到文本文件

这些工具使用动态SQL,这意味着查询是在运行时准备和执行的。可以导入或导出的行的最大大小为3,641,144个字符。

还可以使用%SQL.Import.Mgr类导入数据,使用%SQL.Export.Mgr类导出数据。

从文本文件导入数据

可以将数据从文本文件导入到合适的InterSystems IRIS类中。执行此操作时,系统将在表中为该类创建并保存新行。该类必须已经存在并且必须编译。要将数据导入到此类中,请执行以下操作:
1. 从管理门户中选择系统资源管理器,然后选择SQL。使用页面顶部的切换选项选择一个命名空间;这将显示可用命名空间的列表。
2. 在页面顶部,单击向导下拉列表,然后选择数据导入。

  1. 在向导的第一页上,从指定外部文件的位置开始。对于导入文件所在的位置,请单击要使用的服务器的名称。

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姚 鑫 · 四月 27, 2021 阅读大约需 5 分钟
第七章 解释SQL查询计划

第七章 解释SQL查询计划

本章介绍由ShowPlan生成的InterSystems SQL查询访问计划中使用的语言和术语。

存储在映射中的表

SQL表存储为一组映射。
每个表都有一个包含表中所有数据的主映射;
表还可以有其他的映射,如索引映射和位图。
每个映射可以被描绘成一个多维全局,其中一些字段的数据在一个或多个下标中,其余字段存储在节点值中。
下标控制要访问的数据。

  • 对于主映射,RowIDIDKEY字段通常用作映射下标。
  • 对于索引映射,通常将其他字段用作前导下标,将RowID/IDKEY字段用作附加的较低级别的下标。
  • 对于位图,可以将位图层视为附加的RowID下标级别。但是,位图只能用于为正整数的RowID

发展计划

编译SQL查询会生成一组指令来访问和返回查询指定的数据。
这些指令表示为. int例程中的ObjectScript代码。

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Michael Lei · 五月 10, 2021 阅读大约需 10 分钟
通过深度学习解释和研究 Covid-19 X 射线分类器

关键字:深度学习,Grad-CAM,X 射线,Covid-19,HealthShare,IRIS

目的

在复活节周末,我谈到了一些针对 Covid-19 肺的深度学习分类器。  演示结果还算不错,似乎与当时有关该主题的一些学术研究刊物相吻合。 但它真的足够“好”吗? 

最近,我偶然收听了一个关于“机器学习中的可解释性”的在线午餐网络讲座,Don 在演讲的最后谈到了这个分类结果:

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