医疗行业的互操作性在改善病人护理、降低医疗服务提供者的成本以及为提供者提供更准确的情况方面发挥着重要作用。然而,由于有这么多不同的系统,数据的格式也有很多不同的方式。有许多标准被创造出来以试图解决这个问题,包括HL7v2、HL7v3和CDA,但每一种都有其缺点。

FHIR,即快速医疗互操作性资源,是一种新的医疗数据格式,旨在解决这些问题。它是由国际卫生级七组织(HL7)开发的,该组织还开发了HL7v2、HL7v3和CDA。

今天我们将探讨如何在VS代码中借助IntelliSense和自动完成功能,通过使用FHIR Schema 创建和验证FHIR资源。

第 1 步 :从FHIR 官方网站 https://www.hl7.org/fhir/下载 JSON schema file 文件用来做资源校验

0 0
0 207

作为一个12岁的书呆子,我最喜欢的书是斯蒂芬-皮尔写的《英雄失败之书》,这是一本关于人类不足之处的纪事。对我来说,这本书的亮点是佩德罗-卡罗莱纳的故事,一个努力开发葡语-英语短语手册的人。这是一项崇高的事业,但由于他缺乏说英语的能力,也没有一本葡英字典,因此受到阻碍。

然而,他确实拥有一本法英词典,一本葡法词典和一种真正能干的态度。他的劳动成果对葡萄牙度假者毫无益处,却让12岁的我笑得歇斯底里。我经常愉快地回忆起这个故事,但直到我开始工作时,我才开始把自己和卡洛琳娜先生进行比较。

我的工作是一名信息建模师。信息建模师的工作可以轻描淡写地概括为把现实变成可以存储在数据库中的东西。这是通过设计信息模型来完成的。在传统的软件设计中,有三种类型的信息模型。概念性、逻辑性和物理性。你从概念模型开始,它是对我们想要数字化的东西以及它们之间的关系的一个高级描述。然后你转到逻辑模型,描述这些对象如何在数据库中理想地创建。最后,你在物理模型中实现这一点,物理模型是由用户维护数据的数据库的实际实现。

"这是信息建模的传统智慧。但这种方法是否能实现目的有待商榷"。

这是信息建模的传统智慧。但这种方法是否能实现目的有待商榷。佩德罗的短语书的故事之所以有趣,是因为其方法明显不合适,而且客观上结果很差。这在语言学上相当于用叉子喝汤。但是,当主题比较模糊时,就很难推断方法是如何以及何时有缺陷的。

1 0
0 207
文章
· 九月 22, 2021 阅读大约需 22 分钟
IRIS 2021 技术文档 First Look 3 - 连接一个IDE

InterSystems IRIS 基础:连接一个 IDE

本文档告诉您如何快速连接您的集成开发环境(IDE),用于 ObjectScript、Java、.NET、Python 或 JavaScript/Node.js 的集成开发环境连接到 InterSystems IRIS® 的一个实例,并使用从 GitHub 下载的模板文件验证您是否已经成功连接。
此外,接下来的两节还包括以下内容:
• 部署 InterSystems IRIS
列出用于部署 InterSystems IRIS 的已授权和免费评估实例的选项。如果您还没有一个可以使用的实例,请查看本节。
• InterSystems IRIS 连接信息
详细介绍了将 IDE 连接到已授权或免费的 InterSystems IRIS 实例,以及以其他方式与之进行交互所需的信息 ,并解释了如何获得实例的信息。无论您想用哪个 IDE 连接到 InterSystems IRIS,都要查看涉及您所使用的实例类型的部分。

1 部署 InterSystems IRIS
本节涵盖了已授权的实例和免费的评估实例。

0 0
0 204
文章
· 四月 2, 2021 阅读大约需 7 分钟
数据应用方案分享之一:新生儿先天性心脏病筛查

着手书写数据应用方案分享系列文章的初衷是,希望从终端用户的视角阐述我们所期待的数据应用方式及其可能为医疗领域带来的获益,为医学信息工作者提供参考。在这个系列中,笔者会以临床常见疾病和流程为例,用真实的数据录入、获取、展现和使用场景说明需求;尤其是如何细致、精准的构建数据源头,以确保现代医学信息技术“有数可用”、“数用必达”。其中肯定有思虑不周全或逻辑不严谨之处,望各位读者按需审阅,取其精华、弃其糟粕。此外,本系列更多在于探讨数据应用的可能性,而非可行性。文中部分图片尚处于设想模拟阶段,并非真实系统图片,请知悉。

2 0
0 201
文章
· 一月 10, 2021 阅读大约需 11 分钟
使用规范优先的方式开发REST API

在本文中,我想谈一谈规范优先的 REST API 开发方式。

传统的代码优先 REST API 开发是这样的:

  • 编写代码
  • 使其支持 REST
  • 形成文档(成为 REST API)

规范优先遵循同样的步骤,不过是反过来的。 我们先制定规范(同时兼做文档),然后根据它生成一个样板 REST 应用,最后编写一些业务逻辑。

这是有好处的,因为:

  • 对于想要使用你的 REST API 的外部或前端开发者,你总是有相关且有用的文档
  • 使用 OAS (Swagger) 创建的规范可以导入各种工具,从而进行编辑、客户端生成、API 管理、单元测试和自动化,或者许多其他任务的简化
  • 改进了 API 架构。 在代码优先的方式中,API 是逐个方法开发的,因此开发者很容易失去对整体 API 架构的跟踪,但在规范优先的方式中,开发者被强制从 API 使用者的角度与 API 进行交互,这通常有助于设计出更简洁的 API 架构
  • 更快的开发速度 - 由于所有样板代码都是自动生成的,你无需编写代码,只需开发业务逻辑。
  • 更快的反馈循环 - 使用者可以立即查看 API,并且只需修改规范即可轻松提供建议
    让我们以规范优先的方式开发 API 吧!
0 0
0 199
文章
· 三月 11, 2021 阅读大约需 10 分钟
第八章 SQL修改数据库

第八章 SQL修改数据库

可以对现有的表使用SQL语句,也可以对相应的持久化类使用ObjectScript操作来修改InterSystems IRIS®数据平台数据库的内容。
不能修改定义为只读的持久类(表)。

使用SQL命令为维护数据的完整性提供了自动支持。
SQL命令是一个原子操作(全部或没有)。
如果表上定义了索引,SQL将自动更新它们以反映更改。
如果定义了任何数据或引用完整性约束,SQL将自动执行它们。
如果有任何已定义的触发器,执行这些操作将拉动相应的触发器。

插入数据

可以使用SQL语句或设置和保存持久化类属性将数据插入表中。

使用SQL插入数据

INSERT语句将一条新记录插入SQL表中。
可以插入一条记录或多条记录。

下面的示例插入一条记录。
它是插入单个记录的几种可用语法形式之一:

0 0
0 198
文章
· 八月 13, 2021 阅读大约需 1 分钟
FAQ 常见问题系列--Object Script篇 字符串%String长度限制

众所周知,Object Script是一个弱类型开发语言,%String是我们非常常用的一个类型,时不时有客户在初次接触Object Script编写程序时遇到%String长度限制的问题,在这里做一个简单总结,以便于相关开发人员作为参考。

1. MAXLEN设置字符串的长度。
Property Name As %String(MAXLEN = 50);
a) 如果不设置MAXLEN, 默认长度限制为50
b) MAXLEN = "", 没有限制长度,也就是字符串本身的长度限制。

如果超限,您将会看到如下报错,
错误 #7201: 数据类型值'abcdefghijklmnopqrstuvwxyzabcdefghijklmnopqrstuvwxyz'的长度超过50允许的MAXLEN

2. 字符串本身的长度限制。
在没有开启长字符串的情况下,%String类型的长度限制是32,767个字符。

0 2
0 197

我们很高兴与你分享有趣的信息,以及告诉你为什么Python是好的,它被用在哪里。

其中使用最多的库是NumPy和Pandas。NumPy(Numerical Python)用来对大型数据集进行分类。它简化了数组上的数学运算及其矢量化。Pandas提供两种数据结构:系列Series(一个元素列表)和数据框架DataFrames(一个有多列的表格)。这个库将数据转换为数据框架,允许你删除和添加新的列,以及执行各种操作。

Python为数据分析项目提供了无数的工具,可以帮助完成任何任务。

0 0
0 194

FHIR是快速医疗互操作资源(Fast Healthcare Interoperability Resources)的缩写,所以FHIR的核心是资源模型。它的颗粒度和结构都优于之前的V2 、V3、CDA标准,而且能够灵活扩展。另外一个优势就是它的API,它不仅提供了针对于资源模型本身的原子化的CRUD(创建、读取、更新、删除的这样一些原子化操作),而且提供了查询这种更复杂操作的能力,同样API是可以扩展的。

1 0
1 193
文章
· 四月 27, 2021 阅读大约需 6 分钟
在IRIS中联合运用OCR与NLP技术

根据IDC的报道,超过80%的信息是基于NoSQL的,尤其是文本文件。当数字服务或应用程序不能处理所有这些信息时,企业就会遭受损失。为了面对这一挑战,可以使用OCR技术。OCR使用机器学习和/或训练的图像模式将图像像素转化为文本。这一点很重要,因为许多文件被扫描成PDF格式的图像,或者许多文件中包含有文本的图像。因此,OCR是一个重要的步骤,可以从文件中获得所有可能的数据。

为了实现OCR,可以使用开源解决方案Google Tesseract,这是Python和Java社区中最流行的解决方案。Tesseract支持100多个习语,并且可以用新的模型进行训练以识别车牌、验证码等等。Tesseract是在C++中创建的,可以通过Java套用Tess4J构成一个中介层来使用它。下面的代码展示了调用过程。

0 0
0 189
文章
· 一月 28, 2022 阅读大约需 6 分钟
第三十七章 SQL函数 CURRENT_TIMESTAMP

第三十七章 SQL函数 CURRENT_TIMESTAMP

日期/时间函数,返回当前本地日期和时间。

大纲

CURRENT_TIMESTAMP
CURRENT_TIMESTAMP(precision)

参数

  • precision - 一个正整数,它将时间精度指定为小数秒的位数。
    默认值是0(没有小数秒);
    这个默认值是可配置的。

CURRENT_TIMESTAMP返回TIMESTAMP数据类型。

描述

CURRENT_TIMESTAMP要么不接受参数,要么接受精度参数。
不允许使用空参数括号。

CURRENT_TIMESTAMP返回当前时区的本地日期和时间;
它会根据当地的时间变化进行调整,例如日光节约时间。

0 0
0 187
文章
· 一月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
InterSystems IRIS医疗版2020.1 HL7基准测试

简介

最近完成了针对IRIS医疗版2020.1版本的性能及可扩展性基准测试,重点关注HL7v2的互操作性。本文介绍了在各种工作负载下观察到的吞吐量,并提供了IRIS医疗版用作HL7v2消息传输互操作性引擎时的系统常规配置和调整准则。

基准测试模拟了与实际环境接近的工作负载(详细信息请参见“工作负载说明和方法”部分)。本次测试的工作负载包括HL7v2患者管理(ADT)和生命体征结果(ORU)数据,并包含数据内容转换和路由。

IRIS医疗版2020.1版本可以表明,采用第二代Intel®Xeon®可扩展处理器和Intel®Optane™SSD DC P4800X系列SSD存储的商用服务器,每天的持续消息吞吐量超过23亿条(入站和出站总量),与此前的Ensemble 2017.1 HL7v2吞吐量基准测试相比,扩展性提高了一倍多。

1 2
0 187
文章
· 九月 29, 2022 阅读大约需 3 分钟
Cache死循环检测和申明式事务

使用Cache的两个痛点问题:

一、Cache作为后关系型数据库,使用其提供M语言操作Global数据结构。可以达到极快的查询速度。M语言的set赋值和初始化没有区分,加之是弱类型,非常容易出现死循环,就算你是多年老手也一个不小心就踩坑。我就经历过改代码即使很小心还是出了死循环把数据库tmp撑满的事故。

二、M语言作为完备的编程语言,结合cache数据库操作数据实在是不要太方便。同时一个复杂的业务提交到数据库通过一个M逻辑全部处理完成,极大的减少了app和数据库交互次数。复杂业务的事务就是一方面,通过TSTART、TROLLBACK 、TCOMMIT,前台一次数据库交互后台就可能做了几十张表的更新操作。直接使用事务是容易,但是极易引入开放事务锁表(你自己就算很小心,也难保调别人接口别人事务不完善,而你又没检测事务层级),锁表之后结束进程导致数据回滚。

解决办法:

据我观察出现上面两个问题的原因,第一个是M语言弱类型和没单独的初始化命令导致,就算你是老手、工作细致也难以避免。第二个不是Cache特有的,通用关系库也有事务写的不完整的问题,事务问题对开发要求高或者从框架设计可以解决。

16 4
1 187
文章
· 九月 15, 2021 阅读大约需 10 分钟
第十六章 SQL命令 CREATE TABLE(三)

第十六章 SQL命令 CREATE TABLE(三)

字段数据约束

数据约束控制字段允许使用的值、字段的默认值以及数据值使用的排序规则类型。所有这些数据约束都是可选的。可以按任何顺序指定多个数据约束,并以空格分隔。

NULL和NOT NULL

NOT NULL数据约束关键字指定该字段不接受空值;换句话说,每条记录都必须为该字段指定一个值。NULL和空字符串('') IRIS中是不同的值。可以在接受字符串的字段中输入空字符串,即使该字段定义了NOT NULL限制也是如此。不能在数值字段中输入空字符串。

NULL数据约束关键字显式指定此字段可以接受空值;这是字段的默认定义。

0 0
0 186
文章
· 三月 2, 2022 阅读大约需 12 分钟
如何以自动化方式/编程方式创建一个镜像环境

各位好,

你曾建立过一个镜像环境吗?它是否有一个私有网络、虚拟IP地址和SSL配置?
在做了几次之后,我意识到这是一个漫长的过程,而且需要很多手动操作来生成证书和配置每个IRIS实例。
对于经常要做这件事的人来说,这是一个痛苦的过程。

例如,质量保证团队可能需要为每个新的应用程序版本创建一个新的镜像环境来测试。支持团队可能需要创建一个镜像环境来重现一个复杂的问题。

我们肯定需要工具来快速创建这些镜像环境。

在这篇文章中,我们将用如下环境创建一个镜像样例:

  • 仲裁机
  • 主服务器
  • 故障切换备份成员
  • 读写报告异步成员
  • 节点间日志转移的SSL配置
  • 镜像环境中的私有网络
  • 虚拟IP地址
  • 镜像数据库

network-schema

0 0
0 186
文章
· 三月 25, 2021 阅读大约需 4 分钟
为什么 COVID-19 对机器学习也有危险?(Part I)

几个月前,我在 MIT Technology Review 读到一篇很有意思的文章,作者解释了新冠疫情如何给全球 IT 团队带来关乎机器学习 (ML) 系统的难题。

这篇文章引起我对 ML 模型部署后如何处理性能问题的思考。

我在一个 Open Exchange 技术示例应用 (iris-integratedml-monitor-example) 中模拟了一个简单的性能问题场景,并提交到 InterSystems IRIS AI Contest。 读完这篇文章后您可以去看看,如果喜欢,就请投我一票吧! :)

0 0
0 185
文章
· 四月 24, 2022 阅读大约需 10 分钟
在ObjectScript中调用Java程序 —— 一个国密算法的案例

尽管IRIS和HealthConnect拥有全面的互操作特性,但在实际工作中,还是有可能遇到需要使用遗留类库,dll SDK等方式与外部应用通信的情况。例如IRIS中并没有内嵌国密算法SM2、SM3和SM4,而开源社区中不乏通过Java、Python和C++等语言完成的具体实现。本文就将以调用SM4的Java实现为例展示ObjectScript程序与第三方语言通信的过程。

Github地址:https://github.com/LinZhuISC/javademo.SM4

跨编程环境调用设计要点

在开始实际操作之前,希望读者先针对整个调用过程中的主调方和被调方思考两个现象:

2 1
1 184
文章
· 六月 20, 2022 阅读大约需 8 分钟
IRIS/HealthConnect 高可用机制 Mirror 的配置

安装Arbiter

为了将自动故障转移扩展到尽可能广泛的故障情况,InterSystems建议你为每个镜像配置一个仲裁机。

要充当仲裁者,系统必须有一个正在运行的ISCAgent进程。由于ISCAgent是与InterSystems IRIS一起安装的,任何承载一个或多个InterSystems IRIS实例的系统都符合这一要求,可以被配置为仲裁者而无需进一步准备;但是,承载一个或多个故障转移或DR异步镜像成员的系统不应该被配置为该镜像的仲裁者。

没有托管InterSystems IRIS实例的系统可以通过安装Arbiter方式的作为仲裁者。请从InterSystems公司下载适合你的仲裁者系统平台的ISCAgent安装包,然后,安装ISCAgent。

注意:Arbiter的版本要和InterSystems IRIS安装版本保持一致。

0 0
1 182