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Michael Lei · 五月 12, 2021 阅读大约需 11 分钟
InterSystems 数据平台和性能 - 第 5 篇 使用 SNMP 进行监控

InterSystems 数据平台和性能 - 第 5 部分 使用 SNMP 进行监控

在之前的帖子中,我展示了如何使用 pButtons 收集历史性能指标。 我首选 pButtons 是因为我知道它随每个数据平台实例(Ensemble、Caché、...)一起安装。 不过,还有其他方法可以实时收集、处理和显示 Caché 性能指标,以进行简单的监视,或进行更重要的并且复杂得多的运营分析和容量计划。 最常见的数据收集方法之一是使用 SNMP(简单网络管理协议)。

SNMP 是 Caché 向各种管理工具提供管理和监控信息的标准方式。 Caché 在线文档包含了 Caché 和 SNMP 之间接口的详细信息。 虽然 SNMP 应该可以直接与 Caché 配合工作,但仍有一些配置技巧和陷阱。 我经历了很多次错误的开始,并且在 InterSystems 其他同事的帮助下,才让 Caché 与操作系统 SNMP 主代理建立对话,所以我写了这篇帖子,希望您可以避免同样的痛苦。

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Claire Zheng · 一月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
InterSystems IRIS医疗版2020.1 HL7基准测试

简介

最近完成了针对IRIS医疗版2020.1版本的性能及可扩展性基准测试,重点关注HL7v2的互操作性。本文介绍了在各种工作负载下观察到的吞吐量,并提供了IRIS医疗版用作HL7v2消息传输互操作性引擎时的系统常规配置和调整准则。

基准测试模拟了与实际环境接近的工作负载(详细信息请参见“工作负载说明和方法”部分)。本次测试的工作负载包括HL7v2患者管理(ADT)和生命体征结果(ORU)数据,并包含数据内容转换和路由。

IRIS医疗版2020.1版本可以表明,采用第二代Intel®Xeon®可扩展处理器和Intel®Optane™SSD DC P4800X系列SSD存储的商用服务器,每天的持续消息吞吐量超过23亿条(入站和出站总量),与此前的Ensemble 2017.1 HL7v2吞吐量基准测试相比,扩展性提高了一倍多。

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我的几个孩子都很喜欢手工艺品,您可能会觉得作为一个父亲我会用夸张的表情表扬他们很有创意然后还拍照片发到Pinterest(世界上最大的图片社交分享网站)上去,但是我从来都没这么做过。我肯定爱我的孩子,我也确实认为他们有创意,但老实讲如果你有一个正上小学的孩子,你肯定很清楚他们实际的水平。

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本文是上一篇关于如何从流行数据库(如 PostgreSQL 和 MySQL)迁移到 IRIS 的后续文章。

我们将使用与从 PostgreSQL 迁移相同的过程。 但是,您会发现它更容易,因为 MySQL 中的数据类型与 IRIS 非常相似。 这就是为什么我们不需要在列中创建转换规则。

获取示例数据到迁移过程

在 GitHub 中,可以下载 docker-compose 项目来构建和运行 2 个数据库:

  • 源数据库:带有示例数据库的 MySQL 数据库 Docker 实例。
  • 目标数据库:InterSystems IRIS 数据平台 Docker 实例,具有用于接收源数据库的现成模式。

要获取示例并运行它,请执行以下步骤:

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本贴提供了在 VMware ESXi 5.5 及更高版本的环境中部署 Caché 2015 及更高版本时,关于配置、系统规模调整和容量规划等方面的指南。

我假定您已经了解 VMware vSphere 虚拟化平台,所以直接给出推荐。 本指南中的推荐不特定于任何具体硬件或站点特定的实现,也不应作为规划和配置 vSphere 部署的全面指南,而是一份您可以做出选择的最佳实践配置清单。 我希望您的 VMware 专家实施团队能针对具体站点对这些推荐进行评估。


这里是 InterSystems 数据平台和性能系列的其他帖子的列表。

注:本帖更新于 2017 年 1 月 3 日,强调必须为生产数据库实例设置虚拟机内存预留,以保证 Caché 有足够内存可用,并且不会出现内存交换或膨胀而对数据库性能产生负面影响。 更多详细信息,请参见下面的内存部分。

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Michael Lei · 六月 23, 2021 阅读大约需 3 分钟
加密一个数据库需要多久?

一位客户请求估计使用 cvencrypt 实用工具加密一个数据库需要多久。

这个问题有点像问一根绳子有多长 — 视情况而定。 但这是一个有趣的问题。 答案主要取决于客户使用的目标平台上的 CPU 和存储的性能,因此答案更关乎的是提出一个简单方法,可以在运行 cvencrypt 时使用该方法对 CPU 和存储进行基准测试。

方法

  1. 将一个有代表性的大文件 CACHE.DAT 复制到目标存储
  2. 通过系统管理门户创建密钥文件(包括密钥)
  3. 对 CACHE.DAT 示例文件运行 cvencrypt(如下所示)

下面显示了测试文件到位后的过程:

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Michael Lei · 三月 12 阅读大约需 1 分钟
Linux TZ环境变量未被设置以及对Caché的影响

在最近的大规模基准测试活动中,我们看到过多的%sys CPU时间,对应用程序的扩展产生了负面影响。

问题

我们发现,由于TZ环境变量没有被设置,很多时间都花在了localtime()系统调用上。 我们创建了一个简单的测试程序来证实这一观察结果,设置了TZ与未设置TZ的时间差和所需的CPU资源都是惊人的。 我们发现,当TZ没有设置时,从localtime()继承使用stat()系统调用到/etc/local_time是成本很高。

建议

InterSystems强烈建议在任何Linux安装中,无论是x86还是Linux on Power,都要确认TZ环境变量的设置是否适当,以获得最佳性能。 更多详情请见。"man tzset"。

目前的Caché 2016.1现场测试包含了对日期和时间功能的优化,初步测试表明有很大的改进。 下面是测试新的内部函数调用的样本输出,在这两种情况下,在Power上的Linux都没有设置TZ。

在Caché 2016.1 FT之前:

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王喆 · 九月 24 阅读大约需 2 分钟
使用Global进行数据可视化---商业智能(BI)

在医院但凡接触“数据”和“指标”的人,对以下场景应该是深有感触。同样的指标、同样的时间,有可能是同一个部门出的,最后“数据不一致”。除了“匪夷所思”,更有“深恶痛绝”。那么,如何解决这个问题?我的答案是商业智能(BI)。随着技术和市场的发展,有很多公司开始研发直接面向业务用户的敏捷BI工具,FineBI就是这样的一款BI工具。这个也是我接触的第一款国产BI。

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Michael Lei · 五月 12, 2021 阅读大约需 15 分钟
InterSystems 数据平台和性能 - 第 4 篇 - 关注内存

本帖将展示为 InterSystems 数据平台上运行的数据库应用调整共享内存需求(包括 global 和例程缓冲区、gmheap 以及 locksize)的方法,以及在配置服务器和虚拟化 Caché 应用程序时应考虑的一些性能提示。 和以往一样,当我谈到 Caché 时,我指的是所有数据平台(Ensemble、HealthShare、iKnow 和 Caché)。


本系列其他帖子的列表


当我最初开始使用 Caché 时,大多数客户的操作系统是 32 位的,Caché 应用程序的内存有限且昂贵。 通常部署的英特尔服务器只有几个核心,唯一的扩展方式是选择大型服务器,或者使用 ECP 横向扩展。 现在,即使是基本的生产级服务器也具有多个处理器、几十个核心,并且最小内存为 128 或 256 GB,可能达到 TB。 对于大多数数据库安装,ECP 已被遗忘,我们现在可以在单台服务器上大幅提高应用事务处理速率。

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Michael Lei · 六月 23, 2021 阅读大约需 15 分钟
最低限度的监控和警报解决方案

InterSystems 数据平台包括了用于系统监视和警报的实用程序及工具,但对于不熟悉构建于 InterSystems 数据平台(又名 Caché)的解决方案的系统管理员来说,他们需要知道从何处下手以及需要配置什么。

本指南以在线文档和开发者社区帖子为参考,介绍了实现最低限度的监视和警报解决方案的途径,以及如何启用和配置以下组件:

  1. Caché Monitor:扫描控制台日志并发送电子邮件警报。

  2. System Monitor:监视系统状态和资源,根据固定参数生成通知(警报和警告),同时跟踪整体系统运行状况。

  3. Health Monitor:对主要的系统和用户定义指标进行采样,并将它们与用户可配置的参数和既定的标准值进行比较,在样本超过适用或学习的阈值时生成通知。

  4. History Monitor:维护性能指标和系统使用情况指标的历史数据库。

  5. pButtons:每天按计划收集操作系统指标和 Caché 指标。

请记住,本指南是最低配置,所包含的工具灵活且可扩展,因此可在需要时提供更多功能。 本指南跳过了文档,让您直接上手。 您需要更深入地研究文档才能充分利用监视工具,同时,请考虑将本指南作为启动和运行的速查表。

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众说周知,EPIC 是电子病历厂商中当之无愧的领导者,本文让我们看看EPIC是如何玩转FHIR的,并进一步了解其互操作性方法、资源和API工具。

几十年来,EPIC和其他主要的EHR供应商一直在围绕着互操作性作斗争,有时候互相容忍,有时也得接受(开放接口)。

今天,大多数电子病历厂商已经针对市场和监管的压力采取了行动,采用FHIR API标准,扩大病人对医疗记录的访问。

但在早期,EPIC和其他竞争对手争先恐后地抢占市场份额,为了成为院内系统的主导者,与其他厂商分享数据、给别人提供数据访问似乎是自我毁灭。

那么今天,EPIC在FHIR API、SMART on FHIR 应用市场、患者访问和互操作性战略方面的立场如何? 以下是关于EPIC在FHIR API和互操作性上提供的简单介绍和链接。


EPIC 在FHIR API和互操作性上的战略和资源

EPIC互操作性的方法和选择

大多数EPIC集成的重点是通过EPIC系统提供扩展访问,但不一定与其他厂商共享。

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Nicky Zhu · 一月 8, 2021 阅读大约需 3 分钟
精华--InterSystems 数据平台的容量规划和性能系列文章

索引

下文按顺序列出了数据平台上容量计划和性能系列中的所有帖子。 也列出了我的其他帖子。 我将随着该系列中新帖子的增加进行更新。


容量计划和性能系列

通常,每个帖子的内容都建立在上一个帖子的基础上,但您也可以直接浏览感兴趣的主题。

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Michael Lei · 五月 12, 2021 阅读大约需 7 分钟
InterSystems 数据平台和性能 – 第 2篇

部分 在上个帖子中,我们安排了使用 pButtons 进行 24 小时的性能指标收集。 在本帖中,我们将研究几个收集到的关键指标,以及它们与底层系统硬件的关系。 我们还将开始探索 Caché(或任一 InterSystems 数据平台)指标与系统指标之间的关系。 以及如何使用这些指标来了解系统的每日节拍率并诊断性能问题。

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本帖概述了通过为 InterSystems 数据平台(InterSystems IRIS、Caché 和 Ensemble)上的数据库磁盘创建 LVM 物理盘区 (PE) 条带来实现低延迟存储 IO 的最佳实践配置,并提供了有用链接。

一致的低延迟存储是获得最佳数据库应用程序性能的关键。 例如,对于在 Linux 上运行的应用程序,经常在数据库磁盘中使用逻辑卷管理器 (LVM) ,因为它能够扩展卷和文件系统,或者为在线备份创建快照。 对于数据库应用程序,在使用 LVM PE 条带化逻辑卷的情况下,并行写入还可提高数据 I/O 的效率,从而有助于提高大规模连续读取和写入的性能。

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Michael Lei · 四月 17 阅读大约需 3 分钟
翻译博客文章--浏览医疗保健的未来

在最近一次探索马里兰小镇的 "度假 "期间,我偶然发现了一家非常令人愉快的书店,在那里我愉快地消磨了一下午。我和我的家人都是读者,喜欢各种类型的书--新的、二手的、印刷的、电子的。我们尽量在当地购物,以帮助零售店保持运营。

这次访问促使我思考图书行业所发生的事情与我们的医疗保健系统所发生的事情之间的一些相似之处。

医疗保健行业与图书行业的趋势


数字化


我们阅读内容的格式已经发生了根本性的变化。在2020年,电子书几乎占美国市场的四分之一。音频书占美国图书收入的10亿美元。许多印刷书籍是按需出版的,而不是保存在库存中。同样,医疗保健早已不再是一个“伸出舌头说啊 ”的行业,基因组测试、由人工智能算法读取的X射线、可植入设备和远程医疗访问已经改变了医疗的面貌。

虚拟服务

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Michael Lei · 十一月 2 阅读大约需 1 分钟
InterSystems IRIS医疗版的“专精特新”

门为医疗行业打造,深度整合国内外医疗行业标准,专有技术服务医疗行业44年,可能是全球最早从事医疗信息化的公司;

耕细做打磨数十年的稳定、可靠、易用、可扩展的数据平台;

色鲜明,不唯技术、终生负责、以解决客户问题为核心的特色企业文化;

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Nicky Zhu · 一月 8, 2021 阅读大约需 2 分钟
ECP 魔术

我最近看到有人称 ECP 为魔术。 它似乎确实如此,并且它在许多工程中发挥了相当有趣的作用。 下列各图表简单显示了分布式架构中检索和使用数据的方式。

有关 ECP(包括容量计划)的更多信息,请单击以下链接:数据平台及性能 - 第 7 部分 性能、可伸缩性和可用性 ECP

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在本帖中,我将展示使用外部备份来备份 Caché 的策略,以及与基于快照的解决方案集成的示例。 如今,大多数解决方案部署在基于 VMware 的 Linux 上,因此许多帖子都以展示解决方案如何集成 VMware 快照技术为例。

Caché 备份 - 包括电池?

Caché 安装后即包含 Caché 在线备份,可提供不间断的 Caché 数据库备份。 但随着系统规模的扩大,您应该考虑更高效的备份解决方案。 集成了快照技术的外部备份是推荐的系统(包括 Caché 数据库)备份解决方案。

外部备份有特殊注意事项吗?

外部备份的在线文档包含了全部详细信息。 一个关键考虑事项是:

“为确保快照的完整性,Caché 提供了在创建快照时冻结数据库写操作的方法。 在创建快照期间,只冻结对数据库文件的物理写入,从而允许用户进程继续在内存中不间断地执行更新。”

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Johnny Wang · 四月 25 阅读大约需 39 分钟
Angular 中 Ensemble 工作流的 UI

大家应该都已经很熟悉 InterSystems Ensemble(一个集成和应用程序开发平台),每个人都知道 Ensemble Workflow 子系统是什么以及它对于自动化人类交互的作用。 对于那些不了解 Ensemble Workflow 的人,我将简要介绍它的功能(已经熟悉的朋友可以直接跳过这一部分并学习如何使用 Angular.js 中的 Workflow 接口)。

InterSystems Ensemble

InterSystems Ensemble 是一个集成和应用程序开发平台,旨在集成异构系统、自动化业务流程和创建新的复杂应用程序,这些应用程序通过新的业务逻辑或新的用户界面增强集成应用程序的功能:EAI、SOA、BPM、BAM 甚至 BI (感谢 InterSystems DeepSee:一种用于开发分析应用程序的内置技术)。

Ensemble 具有以下关键功能:

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Google Cloud Platform (GCP) 为基础架构即服务 (IaaS) 提供功能丰富的环境,其作为云提供完备的功能,支持所有的 InterSystems 产品,包括最新的 InterSystems IRIS 数据平台。 与任何平台或部署模型一样,必须留心以确保考虑到环境的各个方面,例如性能、可用性、操作和管理程序。 本文将详细阐述所有这些方面。

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临床研究必须与健康数据相连

就在不久以前,临床科研人员还需要依靠三联的纸质NCR表格,手工收集从堆积如山的手写电子病历中提炼出来的病人数据。从又大又重的《医师案头参考》(PDR)撕下几页,通过传真机发送给FDA,用于药物安全报告。业内专业人士接受了大量的培训,以确保数据经过源文件验证、双键处理,并在经过看似无休止的查询以纠正错误之后,保证其符合目的。

值得庆幸的是,随着电子健康档案的广泛采用,健康数据的数字化,这一过程得到了极大的改善。但是,鉴于临床研究进展缓慢,特别是精美的Excel表格仍由人工数据摘要完成,该领域早该有更多的技术变革,特别是围绕释放医疗互操作性的全部好处。如果我们能做到这一点,生命科学公司将有机会利用宝贵的健康数据来确保病人的安全,优化新药的疗效,并使临床开发过程更加高效,减少错误。

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Li Yan · 一月 11, 2021 阅读大约需 27 分钟
面向 Amazon Web Services (AWS) 的 InterSystems IRIS 示例参考架构

Amazon Web Services (AWS) 云提供广泛的云基础设施服务,例如计算资源、存储选项和网络,这些都非常实用:按需提供,几秒内就可用,采用即付即用定价的模式。 新服务可得到快速配置,且前期无需支出大量资金。 这使得大企业、初创公司、中小型企业以及公共部门的客户可以访问他们所需的基础设施,从而快速响应不断变化的业务需求。

更新日期:2019 年 10 月 15 日

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Michael Lei · 五月 12, 2021 阅读大约需 13 分钟
InterSystems 数据平台和性能 – 第 3 篇:聚焦 CPU

本周,我将关注 CPU - 主要硬件食物群之一 :) 一位客户请我就以下情况提供建议:他们的生产服务器已接近使用寿命终止,是时候更新硬件了。 他们还考虑通过虚拟化来整合服务器,并希望适当调整裸机或虚拟机的容量规模。 今天我们将关注 CPU,在后面的帖子中,我将介绍适当调整其他主要食物群(内存和 IO)规模的方法。

所以问题是:

  • 如何将五年多以前对处理器的应用要求转换成针对当今的处理器?
  • 目前的处理器有哪些是合适的?
  • 虚拟化如何影响 CPU 容量计划?

2017 年 6 月添加: 要深入了解 VMware CPU 注意事项和规划的细节,以及一些常见问题,另请查看以下帖子:虚拟化大型数据库 - VMware cpu 容量计划

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这是一个我开发的名为NiPaRobotica Pharmacy的小应用。 从附件可以看到一个界面,能够接收药房配药请求,并将订单上的行项目转换为发送给机器人的配药对话 。我在3家医院的药房部署了这个接口,其中两家药房有6个机器人被安排来将药物从分配槽配送到药剂师的窗口,每天能服务1200个病人。这些机器人能够将病人平均等待时间从2小时减少一半到1小时.接下来我把这个接口部署到专门为慢病病人建的6个配送点,例如如结核病、艾滋病毒、糖尿病、癫痫、高血压和哮喘等等。这个项目的目标是“把药物带给病人”。 这些点有六个6 ATM形式的药房配药设备 (Pharmacy Dispense Units ,PDU),可以让病人直接与呼叫中心的药剂师沟通。在每个PDU 背后是一个存放上千种药物的大型的机器人。我的应用可以发送指令给机器人,机器人将药物分配到传送带上,送到一个打印机下面。这个打印机已经收到药房标签的内容,包括病人姓名、剂量说明和其他信息等。然后打印机把标签放下并贴在药品包装上。这包药再往前走一点就有一块海绵压住标签,使其更牢固地贴在包装上。然后,传送带将物品传送到PDU中的一个盒子里,一旦所有药物都被分发出去,病人就能打开PDU上的一个盖子,取出他的药品。这个项目最重要的意义是让病人少跑腿,不需要请假,还要长途跋涉到他们平时看病的医院,再取药回家。

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InterSystems IRIS 2021.1 的发布引入了自适应分析(Adaptive Analytics)的介绍。 为了开始使用和熟悉 InterSystems IRIS BI cube示例,我们创建了一个用于自适应分析的 HoleFoods 应用程序示例模版。 此示例应用程序可在 Open Exchange 上获得, 还有一个学习服务课程learning services course 可用于了解有关自适应分析的更多信息。

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