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· 四月 13, 2022 阅读大约需 7 分钟
用Globals 作为图数据库来存储和抽取图结构数据

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这篇文章是对我的  iris-globals-graphDB 应用的介绍。
在这篇文章中,我将演示如何在Python Flask Web 框架和PYVIS交互式网络可视化库的帮助下,将图形数据保存和抽取到InterSystems Globals中。

建议

 

第一步 : 通过使用Python 原生SDK建立与IRIS Globals的链接

 #create and establish connection
  if not self.iris_connection:
         self.iris_connection = irisnative.createConnection("localhost", 1972, "USER", "superuser", "SYS")
                                     
  # Create an iris object
  self.iris_native = irisnative.createIris(self.iris_connection)
  return self.iris_native

 

第二步 : 使用 iris_native.set( ) 功能把数据保存到Globals 里     

#import nodes data from csv file
isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1nodes")
if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1nodes.csv", newline='') as csvfile:

 reader = csv.DictReader(csvfile)
 for row in reader:
    self.iris_native.set(row["name"], "^g1nodes", row["id"])

 #import edges data from csv file
 isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1edges")
 if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1edges.csv", newline='') as csvfile:
 reader = csv.DictReader(csvfile)
 counter = 0                
 for row in reader:
    counter = counter + 1
    #Save data to globals
    self.iris_native.set(row["source"]+'-'+row["target"], "^g1edges", counter)  

 

第三步: 使用iris_native.get() 功能把节点和边缘数据从Globals传递给PYVIS

 #Get nodes data for basic graph    
  def get_g1nodes(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1nodes")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1nodes",level1_subscript)
            element = {"id": level1_subscript, "label": val, "shape":"circle"}
            result.append(element)            
        return result

    #Get edges data for basic graph  
    def get_g1edges(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1edges")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1edges",level1_subscript)
            element = {"from": int(val.rpartition('-')[0]), "to": int(val.rpartition('-')[2])}
            result.append(element)            
        return result

 

Step4: Use PYVIS Javascript to generate graph data

<script type="text/javascript">
    // initialize global variables.
    var edges;
    var nodes;
    var network;
    var container;
    var options, data;
  
    // This method is responsible for drawing the graph, returns the drawn network
    function drawGraph() {
        var container = document.getElementById('mynetwork');
        let node = JSON.parse('{{ nodes | tojson }}');
        let edge = JSON.parse('{{ edges | tojson }}');
     
        // parsing and collecting nodes and edges from the python
        nodes = new vis.DataSet(node);
        edges = new vis.DataSet(edge);

        // adding nodes and edges to the graph
        data = {nodes: nodes, edges: edges};

        var options = {
            "configure": {
                "enabled": true,
                "filter": [
                "physics","nodes"
            ]
            },
            "nodes": {
                "color": {
                  "border": "rgba(233,180,56,1)",
                  "background": "rgba(252,175,41,1)",
                  "highlight": {
                    "border": "rgba(38,137,233,1)",
                    "background": "rgba(40,138,255,1)"
                  },
                  "hover": {
                    "border": "rgba(42,127,233,1)",
                    "background": "rgba(42,126,255,1)"
                 }
                },

                "font": {
                  "color": "rgba(255,255,255,1)"
                }
              },
            "edges": {
                "color": {
                    "inherit": true
                },
                "smooth": {
                    "enabled": false,
                    "type": "continuous"
                }
            },
            "interaction": {
                "dragNodes": true,
                "hideEdgesOnDrag": false,
                "hideNodesOnDrag": false,
                "navigationButtons": true,
                "hover": true
            },

            "physics": {
                "barnesHut": {
                    "avoidOverlap": 0,
                    "centralGravity": 0.3,
                    "damping": 0.09,
                    "gravitationalConstant": -80000,
                    "springConstant": 0.001,
                    "springLength": 250
                },

                "enabled": true,
                "stabilization": {
                    "enabled": true,
                    "fit": true,
                    "iterations": 1000,
                    "onlyDynamicEdges": false,
                    "updateInterval": 50
                }
            }
        }
        // if this network requires displaying the configure window,
        // put it in its div
        options.configure["container"] = document.getElementById("config");
        network = new vis.Network(container, data, options);
        return network;
    }
    drawGraph();
</script>

 

第五步: 从app.py 主文件调用上面的代码

#Mian route. (index)
@app.route("/")
def index():
    #Establish connection and import data to globals
    irisglobal = IRISGLOBAL()
    irisglobal.import_g1_nodes_edges()
    irisglobal.import_g2_nodes_edges()

    #getting nodes data from globals
    nodes = irisglobal.get_g1nodes()
    #getting edges data from globals
    edges = irisglobal.get_g1edges()

    #To display graph with configuration
    pyvis = True
    return render_template('index.html', nodes = nodes,edges=edges,pyvis=pyvis)    

下面是关于此项目的 介绍视频:

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许多使用InterSystems IRIS的用户在调试代码的时候习惯使用命令行的方式,比如运行一个函数查看输出或者查看代码运行过程中保存在global中的数据等等。

对于将 InterSystems IRIS 安装在 Windows 操作系统的用户,只需要点击右下角图标选择Terminal 就可以很方便的使用。

但是对于将其安装到 Linux 或者Docker 容器中的用户,要使用命令行却不那么方便,下面我将会介绍在我们 Openexchange 中的一个应用 -- Web Terminal。

也就是说可以在网页中直接执行Terminal中的命令。

2016-09-18_212035

或者查看SQL执行结果:

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嗨,开发者们,新年好!
不要错过2021年的《ISC 应用市场Open Exchange应用文摘》。让我们认识一下最受欢迎的应用程序和它们的开发者,欢迎免费下载。.
2021概览:
183 新应用
6,899 次下载
654 位开发者
566 应用累计
15,897 次下载累计
1,457 位开发者累计

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亲爱的社区开发者们,大家好!

欢迎积极参与新一轮InterSystems开发者竞赛!

随着 InterSystems IRIS 2021.2 预览版 的发布和全新的 LOAD DATA 功能,我们希望将其与最新的竞赛(数据集)结合起来!

🏆 InterSystems 数据集竞赛🏆

竞赛时间: 2021年12月27日-2022年1月16日

奖金总额: $9,450

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亲爱的开发者们,

如果您需要更改您的主邮箱地址(登录邮箱),同时不希望丢失任何开发者生态系统资源里的activity——在社区、Global Master、Open Exchange中的各种交流与历史活动痕迹——该如何去做呢?

很简单,我们来帮您!

1️⃣ 我们会帮您把所有资料信息从您的旧账户中转移到新账户

包括您的所有发帖、评论、艾特(@)和点赞记录,都会被保存在新账户中!

2️⃣ 如果您是 Global Masters的成员,您的级别、徽章、分数等等,也会被转移到新账户中。

3️⃣ 我们还会帮您转移您发布在 Open Exchange中的应用。

4️⃣ 除此之外,如果您只是需要停用您的旧账号(而无需转移任何活动记录),我们都可以帮您一键操作。

您所需要做的,就是通过社区email私信联系 @Irina.Podmazko,提供 :

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亲爱的社区开发者们,大家好!

我们诚挚地邀请您参加与InterSystems开发者竞赛(InterSystems IRIS Analytics)竞赛优胜者交流 online meetup!

日期 & 时间: 美国东部时间2021年9月17日(周五)12:00;北京时间2021年9月18日(周六)0:00-1:00

在此次线上交流会上,您将了解到:

  • 优胜者简介
  • 优胜者提交项目的简短demo
  • 关于项目中使用到的技术的开放探讨、问答,以及下一场开发者竞赛的安排。

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亲爱的社区开发者们,大家好!

我们真诚邀请您参加 Online Meetup:InterSystems 开发者竞赛(人工智能与机器学习)!

时间: 2021年7月30日(周五) 11:00 AM (美东时间)23:00 (北京时间)

在这场在线Meetup,您将了解到:

  • 此次优胜者的个人履历;
  • 获奖Application的简短Demo;
  • 有关应用技术的开放探讨、问答,以及下次竞赛的一些计划。

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· 七月 6, 2021 阅读大约需 2 分钟
使用 Yape 解包 pButtons - 更新说明和快速指南

如果一张图片胜过千言万语,那么一段视频又价值几何? 当然胜过敲一个帖子。

请在 InterSystems Developers YouTube 观看我的“Coding talks”:

1. 使用 Yape 分析 InterSystems IRIS 系统性能。 第 1 部分:安装 Yape

在容器中运行 Yape。

2. Yape 容器 SQLite iostat InterSystems

提取和绘制 pButtons 数据,包括时间范围和 iostat。

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下载网址:

https://hub.docker.com/r/yape/yape/

$ docker container run --rm -v "$(pwd)":/data yape/yape --version
yape 2.2.6
 

在以下网址查看自述文件:

https://github.com/murrayo/yape

更改包括:

  • 恢复配置文件,进行了更多更改使 x 和 y 轴更智能。
  • 更新了配置文件中的线条样式选择。
  • 解决了 yyyy 日期和 yy 日期或退出的问题。 使窗口标题的日期字符串一致(去掉小数位),在标题中添加短日期。
  • 提高了 y 轴上小于 10 的值的小数精度,例如 Windows 每次读取时间为秒,而不是 linux 中的毫秒
  • 更新 Python 库后的一些小错误修复。

现在,GitHub 和容器保持同步。

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亲爱的社区开发者们,大家好!

欢迎积极参与新一轮InterSystems开发者竞赛!

🏆 InterSystems 编程大赛:FHIR 加速器 🏆

提交在AWS上使用InterSystems的IRIS FHIR-as-a-service的应用程序,或帮助使用InterSystems IRIS FHIR加速器开发的解决方案。点击这篇文章,了解如何在AWS上申请应用InterSystems IRIS FHIR 加速器服务 (FHIRaaS) 。

    时间:2021年5月10日-6月6日

    奖金总额: $8,750

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