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· 一月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
InterSystems IRIS医疗版2020.1 HL7基准测试

简介

最近完成了针对IRIS医疗版2020.1版本的性能及可扩展性基准测试,重点关注HL7v2的互操作性。本文介绍了在各种工作负载下观察到的吞吐量,并提供了IRIS医疗版用作HL7v2消息传输互操作性引擎时的系统常规配置和调整准则。

基准测试模拟了与实际环境接近的工作负载(详细信息请参见“工作负载说明和方法”部分)。本次测试的工作负载包括HL7v2患者管理(ADT)和生命体征结果(ORU)数据,并包含数据内容转换和路由。

IRIS医疗版2020.1版本可以表明,采用第二代Intel®Xeon®可扩展处理器和Intel®Optane™SSD DC P4800X系列SSD存储的商用服务器,每天的持续消息吞吐量超过23亿条(入站和出站总量),与此前的Ensemble 2017.1 HL7v2吞吐量基准测试相比,扩展性提高了一倍多。

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本贴提供了在 VMware ESXi 5.5 及更高版本的环境中部署 Caché 2015 及更高版本时,关于配置、系统规模调整和容量规划等方面的指南。

我假定您已经了解 VMware vSphere 虚拟化平台,所以直接给出推荐。 本指南中的推荐不特定于任何具体硬件或站点特定的实现,也不应作为规划和配置 vSphere 部署的全面指南,而是一份您可以做出选择的最佳实践配置清单。 我希望您的 VMware 专家实施团队能针对具体站点对这些推荐进行评估。


这里是 InterSystems 数据平台和性能系列的其他帖子的列表。

注:本帖更新于 2017 年 1 月 3 日,强调必须为生产数据库实例设置虚拟机内存预留,以保证 Caché 有足够内存可用,并且不会出现内存交换或膨胀而对数据库性能产生负面影响。 更多详细信息,请参见下面的内存部分。

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图像

你好社区

在本文中,我将介绍我的应用程序irisChatGPT ,它是基于LangChain Framework构建的。

首先,让我们对框架进行一个简单的概述。

全世界都在谈论ChatGPT以及大型语言模型 (LLM) 如何变得如此强大,并且表现超出预期,提供类似人类的对话。这只是将其应用于每个企业和每个领域的开始!

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· 九月 17, 2022 阅读大约需 10 分钟
IRIS镜像配置(3)

把数据库添加进Mirror

以往的经验里, 用户在把数据库添加到镜像时遇到过各种各样的问题,以致必须请求外部帮助才能解决。除了步骤本身比较繁琐,很大的原因是阅读文档不细致。还有一个,就是对英文水平不太高的用户,有些英文句式并不是很好懂,比如说,文档中有这一句其实非常关键:

If you attempt to add a new database to the mirror on a nonprimary member that was not created as a mirrored database on the primary, but rather added to the mirror after it was created, an error message notes this and you cannot complete the operation.

我用最好的翻译器DeepL翻译后的中文是:

如果你试图在一个非主要成员上向镜像添加一个新的数据库,而这个数据库并不是在主要成员上作为镜像数据库创建的,而是在创建后添加到镜像中的,那么就会出现错误信息提示,你无法完成操作。

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3.1 InterSystems IRIS内码与多语言支持

3.1.1 InterSystems IRIS内码与字符集转换

InterSystems IRIS的内码是UTF-16,因此它支持Unicode多语言字符集。对于其它字符编码,例如UTF-8、GB18030、Big 5,它会自动进行转码。例如对于简体中文,它将GB18030输入数据转换为UTF-16,或者将UTF-16数据转换为GB18030输出。

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· 一月 20, 2021 阅读大约需 15 分钟
InterSystems IRIS数据平台:数据接收速度测试

跨行业用例大多要求具备每秒接收数千或数百万条记录的能力,同时能够支持实时同步查询,例如:股票交易处理、欺诈检测、物联网应用(包括异常检测和实时OEE监控)等。Gartner将这种能力称为“HTAP”(混合事务分析处理)。Forrester等其他公司将其称为Translytics。InterSystems IRIS是功能强大、可扩展、高性能、资源高效的事务分析型数据平台,同时具备内存数据库的高性能以及传统数据库的一致性、可用性、可靠性以及低成本的特性。

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· 八月 9, 2022 阅读大约需 1 分钟
在ObjectScript中运行shell命令

有时,有必要从主机操作系统的Shell(即你的ObjectScript程序所在的地方)执行命令,以启动程序、操作系统服务、安排crontasks以及其他活动。为此,该语言有一个叫做$ZF(-100). 的实用程序:

$ZF(-100,flags,program,args)

其中flags是你想执行的命令的类型。在我们的例子中,标志是"/ SHELL",用于在主机操作系统上执行shell命令。

Program是要执行的程序或服务的名称。

Args是传递给程序的执行参数。

一个例子是在提示符下打印一些内容,例如:

$ZF(-100,"/SHELL","echo","https://www.intersystems.com/")

如果你的程序依赖于改变当前目录,要运行该程序,在调用前使用以下命令:

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· 一月 4, 2023 阅读大约需 4 分钟
IRIS, Caché监控指导 - 系统健康检查

以下是我们应客户的要求拟定的Caché系统健康检查的建议。InterSystems的工程师们认为其中的项目足以了解客户当前的系统健康状况。

这些项目中有些,比如Buttons, pButtons报告是必须的,其他内容,尤其是问卷部分,越多回答对系统健康的了解也越清楚。InterSystems公司的技术支持中心WRC(World Response Center),在合适的条件下可以协助用户解读健康检查的结果。

在后面的内容中, 我会详细介绍这些检查的项目,比如报告的执行步骤,已经如何简单的发现问题。

检查的内容也适用于IRIS,仅仅是执行的步骤上有细微的区别,后面文章会详细说。

健康检查项目

本健康检查只用于Caché系统本身的内容, 不包括Caché上使用的各种应用。

建议用户收集下列两部分数据和资料:

系统运行数据

  • [ ] 所有Caché实例服务器的网络架构图,包含所有的数据服务器,应用服务器,镜像服务器,灾备服务器。还应该包含网段的划分, 相关的Web服务器,负载均衡设备的部署等情况。以及一切客户认为和Caché工作相关的网络配置的情况。

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最在第一期“极客聊吧”中,InterSystems销售工程师们聊了聊这些话题:为什么有些医院和某些商保之间可以直接结算,有些又不能?医院和保险之间的结算难在哪儿?在InterSystems 2021全球线上峰会中提到的医保结算案例对国内实践有哪些借鉴意义?FHIR又能起到什么关键作用?医疗数据实现互联互通的关键是什么?以下是文字版。

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Iris-python-template

包含各种Python代码的项目模版,可用于InterSystems IRIS 社区容器版Community Edition with container。

特性 :

  • Notebooks 记事本
    • Embedded Python 内核
    • ObjectScript 内核
    • Vanilla Python 内核
  • Embedded嵌入式 Python
    • Code example代码样例
    • Flask demo
  • IRIS Python Native 原生APIs
    • Code example

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· 六月 1, 2021 阅读大约需 4 分钟
使用 InterSystems IRIS 实现 Data Fabric 架构

什么是 Data Fabric?

“这是一套用于在公司中实施、管控、管理和执行数据操作的硬件基础架构、软件、工具和资源,功能包括跨所有数据存储平台的数据采集、转换、存储、分发、整合、复制、可用性、安全性、保护、灾难恢复、演示、分析、保存、保留、备份、恢复、归档、召回、删除、监视和容量规划,并可使应用程序的使用满足公司的数据需求”。 
(Alan McSweeney)
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· 五月 20, 2021 阅读大约需 7 分钟
互操作消息统一管理系列:MessageBank

一. 企业信息库简介

企业信息库(MessageBank)是一个可选的远程归档设施,可以从多个来自不同实例的互操作性Production中收集信息、事件日志项目和搜索表项。如下图所示:
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这套环境由两种角色的实例构成:
企业信息库服务器,它本身也是一个Production,完全由Message Bank服务组成,接收来自任何数量的客户Production提交的消息、日志等。

客户端Operation(Message Bank Operation),将其添加到一个正在运行的Production中,并用企业信息库服务器的地址进行配置。如连接通畅,消息和日志即可自动转发到Message Bank并在其中存储。

为了使你能方便地看到信息库中的信息,InterSystems IRIS®提供了以下附加选项。

对于企业信息库实例,管理门户自动包括企业监控器页面,在那里你可以监控客户端Production的状态,浏览消息库,并对被监控客户的消息进行检索。

对于每个客户端实例,你在消息库实例中配置一个到企业监控器的链接。

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· 三月 4, 2021 阅读大约需 11 分钟
第三章 SQL语言元素(二)

第三章 SQL语言元素(二)

算术运算符和函数

InterSystems SQL支持以下算术运算符:

  • + 加法操作符。
    例如,17+7 = 24

  • 减法运算符。
    例如,17-7等于10
    注意,这些字符中的一对是InterSystems SQL注释指示器。
    因此,要指定两个或多个减法操作符或负号,必须使用空格或圆括号。
    例如,17- -7或17-(-7)等于24

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· 九月 11, 2021 阅读大约需 1 分钟
定时删除journal文件方法

背景:在实际场景中,处理历史数据问题会出现数据暴增的情况,在此情景下journal文件会暴增从而出现磁盘被沾满的风险,因此需要对journal进行删除。
步骤:
1.点击【系统操作】->【任务管理器】->【新任务】创建定时任务。
2.按下图输入参数
image
重要参数:
任务运行所在的 命名空间:%SYS
任务类型:运行传统任务
执行代码:do ##Class(%SYS.Journal.File).PurgeAll()

  1. 点击【下一步】设定时间
    按业务需要设定

4.点击【完成】

备注:此任务在数据暴增情况结束后应挂起。

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· 一月 20, 2021 阅读大约需 8 分钟
InterSystems API 管理器简介

大家可能已经听说过,我们近期推出了InterSystems API管理器 (以下简称IAM)。InterSystems IRIS数据平台™新增了一项功能,支持用户监视、控制和管理IT基础架构中基于Web的API间通信。

在本文中,我将向大家展示如何设置IAM,并重点介绍IAM中可用的一些功能。InterSystems API管理器可提供你所需的一切功能。

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· 一月 10, 2021 阅读大约需 11 分钟
使用规范优先的方式开发REST API

在本文中,我想谈一谈规范优先的 REST API 开发方式。

传统的代码优先 REST API 开发是这样的:

  • 编写代码
  • 使其支持 REST
  • 形成文档(成为 REST API)

规范优先遵循同样的步骤,不过是反过来的。 我们先制定规范(同时兼做文档),然后根据它生成一个样板 REST 应用,最后编写一些业务逻辑。

这是有好处的,因为:

  • 对于想要使用你的 REST API 的外部或前端开发者,你总是有相关且有用的文档
  • 使用 OAS (Swagger) 创建的规范可以导入各种工具,从而进行编辑、客户端生成、API 管理、单元测试和自动化,或者许多其他任务的简化
  • 改进了 API 架构。 在代码优先的方式中,API 是逐个方法开发的,因此开发者很容易失去对整体 API 架构的跟踪,但在规范优先的方式中,开发者被强制从 API 使用者的角度与 API 进行交互,这通常有助于设计出更简洁的 API 架构
  • 更快的开发速度 - 由于所有样板代码都是自动生成的,你无需编写代码,只需开发业务逻辑。
  • 更快的反馈循环 - 使用者可以立即查看 API,并且只需修改规范即可轻松提供建议
    让我们以规范优先的方式开发 API 吧!
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· 六月 24, 2023 阅读大约需 8 分钟
IRIS 与Open AI 集成

众所周知,人工智能的世界已经到来,每个人都想利用它为自己谋取利益。

有许多平台通过订阅或私人免费提供人工智能服务。然而,由于在计算领域产生的大量“噪音”而脱颖而出的是 Open AI,这主要归功于其最著名的服务:ChatGPT 和 DALL-E。

什么是Open AI?

Open AI 是一个非营利性人工智能研究实验室,由 Sam Altman、Ilya Sutskever、Greg Brockman、Wojciech Zaremba、Elon Musk、John Schulman 和 Andrej Karpathy 于 2015 年发起,旨在促进和开发友好的人工智能,造福于人类所有的。

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尽管作为一个没有资金支持的医科专业学生,Case Western Reserve大学的Jane Hinkle最近在不到一周的时间里利用EHR供应商Epic的去识别化病人数据库Cosmos进行了临床研究,还得了奖。

Cosmos是一个HIPAA限定的数据集,整合了超过1.22亿名患者的Epic EHR数据。

"我们围绕Cosmos建立的概念就是我们所说的自助分析,这意味着Cosmos中的大数据被设置为Cosmos的任何用户都可以访问,"Epic的临床信息学家Dave Little博士在采访中告诉EHRIntelligence。"在简的案例中,我们看到一个医科学生能够带着一个有针对性的问题,从1.22亿的患者数据中找到她所需要的数据来回答这个问题。这在研究界历来是闻所未闻的。"

Hinkle的研究发现,儿科病人从COVID-19引发心肌炎的可能性是COVID-19疫苗的三到五倍。她告诉EHRIntelligence,她最初关注的是一项使用大数据工具来分析阻塞性睡眠呼吸暂停的研究。然而,当关于心肌炎是否是COVID-19疫苗接种的不良反应的问题出现时,Hinkle和她的研究导师、公共卫生硕士、医学博士、MetroHealth 公司的首席医疗信息官David Kaelber转移了他们的重点。

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孕产妇风险可以通过一些医学界众所周知的参数来测量。这样,为了帮助医学界和计算机系统,特别是人工智能,科学家Yasir Hussein Shakir发布了一个非常有用的数据集,用于训练检测/预测孕产妇风险的机器学习(ML)算法。这份出版物可以在最大和最知名的ML数据库Kaggle上找到,网址是 https://www.kaggle.com/code/yasserhessein/classification-maternal-health....

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· 四月 2, 2021 阅读大约需 7 分钟
数据应用方案分享之一:新生儿先天性心脏病筛查

着手书写数据应用方案分享系列文章的初衷是,希望从终端用户的视角阐述我们所期待的数据应用方式及其可能为医疗领域带来的获益,为医学信息工作者提供参考。在这个系列中,笔者会以临床常见疾病和流程为例,用真实的数据录入、获取、展现和使用场景说明需求;尤其是如何细致、精准的构建数据源头,以确保现代医学信息技术“有数可用”、“数用必达”。其中肯定有思虑不周全或逻辑不严谨之处,望各位读者按需审阅,取其精华、弃其糟粕。此外,本系列更多在于探讨数据应用的可能性,而非可行性。文中部分图片尚处于设想模拟阶段,并非真实系统图片,请知悉。

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· 八月 1, 2024 阅读大约需 3 分钟
Caché/M 数据库系统 InterSystems IRIS 的 Windows 安装

针对 InterSystems IRIS 数据库的一些基本概念。

InterSystems IRIS 是什么

InterSystems IRIS 是基于 Caché/M 语言开发的一个数据库,这个数据库被大量使用在医疗系统中,也是北美地区医疗系统病历和文件管理中默认使用的事实标准。

Caché/M 是什么

Caché/M 是 MUMPS 程序语言 开发的数据库,Caché/M 提供了代码接口,可以直接使用 Caché/M 对数据库来进行操作。

Caché 是一个法语单词,但是又非常容易和英语使用的 Cache 搞混,所以大部分时候使用的是 Caché/M 来表达。

M 表达的意思是 Mumps 程序语言,简称 M 语言,Caché 使用 M 语言构建了不少函数。

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我们很高兴与你分享有趣的信息,以及告诉你为什么Python是好的,它被用在哪里。

其中使用最多的库是NumPy和Pandas。NumPy(Numerical Python)用来对大型数据集进行分类。它简化了数组上的数学运算及其矢量化。Pandas提供两种数据结构:系列Series(一个元素列表)和数据框架DataFrames(一个有多列的表格)。这个库将数据转换为数据框架,允许你删除和添加新的列,以及执行各种操作。

Python为数据分析项目提供了无数的工具,可以帮助完成任何任务。

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