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· 一月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
InterSystems IRIS医疗版2020.1 HL7基准测试

简介

最近完成了针对IRIS医疗版2020.1版本的性能及可扩展性基准测试,重点关注HL7v2的互操作性。本文介绍了在各种工作负载下观察到的吞吐量,并提供了IRIS医疗版用作HL7v2消息传输互操作性引擎时的系统常规配置和调整准则。

基准测试模拟了与实际环境接近的工作负载(详细信息请参见“工作负载说明和方法”部分)。本次测试的工作负载包括HL7v2患者管理(ADT)和生命体征结果(ORU)数据,并包含数据内容转换和路由。

IRIS医疗版2020.1版本可以表明,采用第二代Intel®Xeon®可扩展处理器和Intel®Optane™SSD DC P4800X系列SSD存储的商用服务器,每天的持续消息吞吐量超过23亿条(入站和出站总量),与此前的Ensemble 2017.1 HL7v2吞吐量基准测试相比,扩展性提高了一倍多。

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· 一月 8, 2021 阅读大约需 9 分钟
InterSystems IRIS 和 Caché 中的多模型数据并行处理

众所周知,InterSystems IRIS 提供了很多的工具来提升应用系统可伸缩性。尤其在提升数据并行处理能力方面,InterSystems 做了很多努力,例如在 SQL 查询中使用并行处理,以及在 IRIS中引入最具吸引力的特征:分片(sharding)。然而,许多成熟的开发成果最初是在 Caché中完成的,而且已经迁移到 IRIS 中。这些成熟的开发成果大都使用 DBMS(数据库管理系统)的多模型功能,实现在单独的数据库中共存不同的数据模型。例如, HIS qMS 数据库同时包含语义关系(电子病历)、传统关系(与 PACS 的交互)和层次数据模型(实验室数据以及与其他系统的集成)。这些数据模型大多是通过 SP.ARM 的 qWORD 工具(一种直接访问 Global的小型数据库管理系统)实现的。遗憾的是,由于查询未使用 IRIS SQL,无法利用并行查询处理的新功能进行扩展。

而且,随着数据库规模的不断增长,大型关系型数据库所固有的大多数问题开始出现在非关系型数据库中。这就是我们关注可用于扩展的并行数据处理技术的一个主要原因。

在本文中,我将围绕多年来在解决任务时用到的并行数据处理展开多方位讨论,而这些是我在大数据问题探讨中很少提到的。我将重点讨论数据库的技术改造,或者更确切地说,是数据库转换技术。

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%SYS.Journal.Record 类有一个查询(query), List, 可以列出Journal文件中记录的数据修改历史。例如,要查询谁对global节点^QP(1,2)做过修改,可以使用如下代码。它查询Journal文件(输入参数pFilePath)中的global节点(输入参数pSearchGlobal)的操作:

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· 十月 7, 2022 阅读大约需 4 分钟
第三方HA软件结合MIRROR使用方法探讨

在Cache 2018之前的版本中,数据库的高可用是通过第三方HA软件保障的,Cache数据库在2018以后及IRIS支持MIRROR技术,通过MIRROR可以保障数据库的高可用及数据的冗余,那么在新版本中,第三方HA软件与MIRROR是否可以同时使用以实现更高的数据库可用性?使用起来有哪些需要注意的?本文重点介绍探讨上述两个问题。

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· 四月 11, 2021 阅读大约需 16 分钟
人月神话

人月神话

焦油坑

  1. 编程系统产品开发的工作量是供个人使用的,独立开发的构件程序的9倍。我估计软件构件产品化引起了3倍工作量,将软件构件整合成完成系统所需要的设计,集成和测试又强加了3倍工作量,这些高成本的构件在根本上是互相独立的。
  2. 编程行业“满足我们内心深处的创造渴望和愉悦所有人的共有情感”,其提供了五种乐趣:
  • 创建事物的快乐
  • 开发对其他人有用的东西的乐趣
  • 将可以活动,相互啮合的零部件组装成类似迷宫的东西,这个过程所体现出令人神魂颠倒的魅力。
  • 面对不重复的任务,不断学习的乐趣。
  • 纯粹的思维活动。
  1. 同样,这个行业具有一些内在固有的苦恼:

- 将做事方式调正到追求完美是学习编程的最困难的部分。
- 由其他人设定目标,并且必须依靠自己无法控制的事物,权威不等同于责任
- 任何创造性活动都伴随着枯燥艰苦的劳动,编程也不例外
- 人们通常期望项目在接近结束时,软件项目能收敛得快一些,然后,情况却是越接近完成,收敛得越慢。

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· 二月 22, 2023 阅读大约需 12 分钟
InterSystems IRIS的面向对象数据库特性

面向对象编程的优势

在应用程序开发时,我们使用的大多数开发语言都是面向对象编程 object-oriented programming (OOP)语言,例如大家熟悉的Java、.NET。而TIOBE的2023年2月的最新开发语言流行排行榜上,前5大语言都是面向对象编程语言,连排名第六的Visual Basic都有了越来越多的OO特性:

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技术概要:ODBC 和 InterSystems 数据库

如果您希望在 InterSystems IRIS®数据平台上使用 ODBC,本文将介绍如何设置它。
要浏览所有的技术概要(First Look),包括可以在 InterSystems IRIS 免费的评估实例上执行的那些,请参见 InterSystems 技术概要(InterSystems First Looks)。

1 ODBC: 如何在 InterSystems IRIS 中使用它
InterSystems 提供了一个完全兼容的(ODBC 3.5)ODBC 驱动程序,您可以使用它通过 ODBC 访问 InterSystems IRIS 数据库。当您安装 InterSystems IRIS 时,默认安装该驱动程序。
为了开始在 InterSystems IRIS 中使用 ODBC,您只需要在 InterSystems IRIS 实例上配置驱动程序。本技术概要(First Look)文档对这一过程进行了概述。
如果您还不熟悉 ODBC,请参见本文档末尾的 "了解更多信息" 一节中的链接,以获得更多信息。

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· 四月 17, 2022 阅读大约需 3 分钟
在IRIS容器里添加VSCode

在IRIS容器里添加VSCode

设置可重复的开发环境的最简单的方法之一是使用容器。我发现在快速迭代时,在我的开发环境容器里托管一个vscode实例是非常方便的。因此,我创建了一个快速的容器脚本,将一个基于浏览器的vscode添加到IRIS容器中。这应该适用于大多数2021.1以上的容器。我的代码库可以在这里找到

带VSCode 且预连接好的InterSystems IRIS 容器

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· 五月 15, 2022 阅读大约需 7 分钟
InterSystems 最佳实践之 掌握 %SYSTEM.Encryption 加密类

InterSystems IRIS对加密、解密和哈希操作有很好的支持。在%SYSTEM.Encryption(https://docs.intersystems.com/iris20212/csp/documatic/%25CSP.Documatic.c...)类中,有市场上主要算法的类方法。


IRIS算法和加密/解密类型

正如你所看到的,这些操作是基于密钥的,包括3个类:

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· 三月 25, 2021 阅读大约需 8 分钟
将 Python ODBC 连接到 IRIS 数据库 - 第 2 条快速笔记

关键字:PyODBC,unixODBC,IRIS,IntegratedML,Jupyter Notebook,Python 3

目的

几个月前,我简单谈到了关于“将 Python JDBC 连接到 IRIS”的话题。我后来频繁提起它, 因此决定再写一篇 5 分钟的笔记,说明如何“将 Python ODBC 连接到 IRIS”。

在 Windows 客户端中通常很容易设置 ODBC 和 PyODBC,不过我每次在 Linux/Unix 风格的服务器中设置 unixODBC 和 PyODBC 客户端时,都会遇到一些麻烦。

有没有一种简单连贯的方法,可以不安装任何 IRIS,在原版 Linux 客户端中让 PyODBC/unixODBC 针对远程 IRIS 服务器运行?

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IRISHealth以其完备且系统化的安全特性在医疗行业的数据库中独树一帜,这些特性包括安全认证、安全授权、安全审计、数据加密以及安全配置。其中数据传输无疑是其中最重要的一环。为此,IRISHealth采用了SSL/TLS技术来对传输的数据进行加密,有效保障了从IRIS数据平台的超级服务数据传输、Telnet服务数据传输、java/.net/Studio客户端的访问数据传输、MIRROR与DB的数据传输,到DBServer和ECPApp之间的数据传输的安全性。


本文是在两个IRISHealth2021实例之间进行ECP服务通信的示例,一个作为DBServer,一个作为ECPApp,两个实例之间通过使用SSL/TLS的ECP协议进行TCP的加密传输通信。

1.IRIS的DB和ECP环境:

DBServer

ECPApp

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前面介绍了通过mirroring或shadow,使用journal日志过滤器的方式,在不改动数据模型的情况下实现InterSystems IRIS/Caché上的CDC能力。
但如果你可以修改InterSystems IRIS/Caché上的数据模型,也可以考虑使用DSTIME特性实现变更数据捕获。

DSTIME特性

DSTIME特性是InterSystems IRIS/Caché的嵌入式实时BI工具DeepSee用于跟踪数据变更的。
InterSystems IRIS和2011版之后的Caché,都支持DSTIME特性。它会自动记录数据库中SQL表记录或持久化对象的变更,并将变更记录写入持久化的多维数组^OBJ.DSTIME中。

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· 三月 11, 2021 阅读大约需 10 分钟
第八章 SQL修改数据库

第八章 SQL修改数据库

可以对现有的表使用SQL语句,也可以对相应的持久化类使用ObjectScript操作来修改InterSystems IRIS®数据平台数据库的内容。
不能修改定义为只读的持久类(表)。

使用SQL命令为维护数据的完整性提供了自动支持。
SQL命令是一个原子操作(全部或没有)。
如果表上定义了索引,SQL将自动更新它们以反映更改。
如果定义了任何数据或引用完整性约束,SQL将自动执行它们。
如果有任何已定义的触发器,执行这些操作将拉动相应的触发器。

插入数据

可以使用SQL语句或设置和保存持久化类属性将数据插入表中。

使用SQL插入数据

INSERT语句将一条新记录插入SQL表中。
可以插入一条记录或多条记录。

下面的示例插入一条记录。
它是插入单个记录的几种可用语法形式之一:

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· 四月 8, 2021 阅读大约需 8 分钟
第二十章 用户、角色和权限

第二十章 用户、角色和权限

InterSystems IRIS®具有系统级安全性,以及一组与sql相关的额外安全性特性。
在数据库级保护之外,InterSystems SQL安全性提供了额外级别的安全功能。
SQL和系统级安全性之间的一些关键区别是:
- SQL保护比系统级保护更细粒度。可以为表、视图和存储过程定义特权。
- SQL权限既可以授予用户,也可以授予角色。
系统级权限只分配给角色。
- 持有SQL特权会隐式授予执行SQL操作所需的任何相关系统特权。
(相反,系统级特权并不意味着表级特权。)

InterSystems SQL在InterSystems IRIS数据平台上对ODBC、JDBC、Dynamic SQL和SQL Shell接口进行权限检查。
嵌入式SQL语句不执行特权检查;
假定使用嵌入式SQL的应用程序在使用嵌入式SQL语句之前会检查特权。

SQL权限和系统权限

要通过特定于SQL的机制操作表或其他SQL实体,用户必须具有适当的SQL权限。
系统级权限不足。
用户可以直接被授予SQL权限,也可以属于具有SQL权限的角色。

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· 四月 2, 2021 阅读大约需 7 分钟
数据应用方案分享之一:新生儿先天性心脏病筛查

着手书写数据应用方案分享系列文章的初衷是,希望从终端用户的视角阐述我们所期待的数据应用方式及其可能为医疗领域带来的获益,为医学信息工作者提供参考。在这个系列中,笔者会以临床常见疾病和流程为例,用真实的数据录入、获取、展现和使用场景说明需求;尤其是如何细致、精准的构建数据源头,以确保现代医学信息技术“有数可用”、“数用必达”。其中肯定有思虑不周全或逻辑不严谨之处,望各位读者按需审阅,取其精华、弃其糟粕。此外,本系列更多在于探讨数据应用的可能性,而非可行性。文中部分图片尚处于设想模拟阶段,并非真实系统图片,请知悉。

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· 一月 10, 2021 阅读大约需 11 分钟
使用规范优先的方式开发REST API

在本文中,我想谈一谈规范优先的 REST API 开发方式。

传统的代码优先 REST API 开发是这样的:

  • 编写代码
  • 使其支持 REST
  • 形成文档(成为 REST API)

规范优先遵循同样的步骤,不过是反过来的。 我们先制定规范(同时兼做文档),然后根据它生成一个样板 REST 应用,最后编写一些业务逻辑。

这是有好处的,因为:

  • 对于想要使用你的 REST API 的外部或前端开发者,你总是有相关且有用的文档
  • 使用 OAS (Swagger) 创建的规范可以导入各种工具,从而进行编辑、客户端生成、API 管理、单元测试和自动化,或者许多其他任务的简化
  • 改进了 API 架构。 在代码优先的方式中,API 是逐个方法开发的,因此开发者很容易失去对整体 API 架构的跟踪,但在规范优先的方式中,开发者被强制从 API 使用者的角度与 API 进行交互,这通常有助于设计出更简洁的 API 架构
  • 更快的开发速度 - 由于所有样板代码都是自动生成的,你无需编写代码,只需开发业务逻辑。
  • 更快的反馈循环 - 使用者可以立即查看 API,并且只需修改规范即可轻松提供建议
    让我们以规范优先的方式开发 API 吧!
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· 五月 4, 2023 阅读大约需 6 分钟
IRIS, Caché监控指导 - 警告和告警

当系统发生严重危机,一般错误,以及其他需要管理员关注的其他事件发生时, 管理员必须及时的收到系统发出的警告信息。

上篇文章中介绍了控制台日志。这是个文本文件,包含几乎所有的系统级别的错误信息,并且有严重级别的标识,那么使用工具来监控控制台日志文件,并给管理员发送通知是可行的方案吗?

当然。实际上,有些用户正是这样来管理Caceh'/IRIS的。他们有自己熟悉的监控工具,实时读取控制台日志,分析内容,并完成警告通知的发送。

这篇文章我来介绍的是Cache'/IRIS内置的处理警告的机制和配置方法。 通过把严重的错误和事件写入另一个文本文件alert.log,并配置邮件,SNMP, API接口发送通知,可以基本的实现caceh'/IRIS系统的警告通知工作。

Alerts.log

控制台日志中最严重的两个级别(级别2和3), 的记录会被写入另一个文本文件,名字是Alert.log。 默认存储于\installDir\mgr\路径。

  • 在操作门户中“系统>系统日志>控制台日志” ,你会发现 Alerts.log的内容会以红色的字体显示在最上方。比如下图中有2个严重级别的Alert。

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前言

本人因技术需要,了解到了IRIS Health产品,在听了产品介绍会之后,感觉该产品是否有趣,并且比较符合自己目前的需求,因此大概了解了下IRIS的架构。以下是本人的浅显理解,如有错误之处欢迎讨论。

本人从产品介绍和社区的文档中,了解到IRIS的大概功能分类

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