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· 十一月 6 阅读大约需 6 分钟
FHIR 环境设置指南

我很清楚对于那些完全不熟悉 VS Code、Git、Docker、FHIR 和其他工具的人来说,设置环境时会遇到一些困难。 所以我决定写这篇文章,详细介绍整个设置过程,以便大家能够轻松上手。

如果您能在本文最后留下评论,告诉我说明是否清楚,是否有遗漏,或者是否有其他您觉得有用的东西,我将不胜感激。

设置包括:

✅ VS Code – 代码编辑器
✅ Git – 版本控制系统
✅ Docker – 运行 IRIS for Health Community 的实例
✅ VS Code REST 客户端扩展程序 – 用于运行 FHIR API 查询
✅ Python – 用于编写基于 FHIR 的脚本
✅ Jupyter Notebook – 用于 AI 和 FHIR 任务

准备工作:确保您在系统上拥有管理员权限

除了阅读本指南,您还可以按照视频中的步骤操作:

如果您是 Windows 系统(请注意:原文是YouTube视频,请跳转至EN原帖查看)

https://www.youtube.com/embed/IyvuHbxCwCY
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· 十一月 6 阅读大约需 7 分钟
Interoperability on Python (IoP) 简介

Interoperability on Python (IoP) 是一个概念验证项目,旨在展示与 Python 优先方式相结合时 InterSystems IRIS Interoperability Framework 的强大功能。IoP 利用Embedded Python(嵌入式 Python,InterSystems IRIS 的一个功能)使开发者能够用 Python 编写互操作性组件,从而可以与强大的 IRIS 平台无缝集成。本指南专为初学者编写,全面介绍了 IoP、其设置以及创建第一个互操作性组件的操作步骤。 阅读完本文,您将能够清楚地了解如何使用 IoP 构建可扩缩、基于 Python 的互操作性解决方案。

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· 十月 24 阅读大约需 14 分钟
构建 AI 智能体:从小白到大神

学习如何使用 LangGraph 设计结合了推理、矢量搜索和工具集成的可扩缩自主 AI 智能体。

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概括

  • AI 智能体是一种超越简单的聊天机器人的自主系统,它结合了记忆库、上下文,并具有自动完成任务的主动性。
  • LangGraph 是一种框架,它使我们能够利用具有内置状态管理的节点(任务)和边缘(连接),构建复杂的 AI 工作流。
  • 本指南将指导您构建 AI 赋能的客户支持智能体,该智能体可以划分优先级,识别相关主题,并确定是上报还是自动回复。

那么,AI 智能体究竟是什么?

让我们直面它吧 —“AI 智能体”听起来就像可以接管会议室的机器人。 实际上,它们是您得力的助手,可以简化复杂的工作流,消除重复性任务。 您可以把它们看作是聊天机器人的下一个进化阶段:它们不只是简单地等待提示;它们可以发起行动,协调多个步骤,并随时进行调整。

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· 九月 19 阅读大约需 12 分钟
利用 FHIR 简化健康数据集成

数字健康解决方案提供者面临的压力越来越大,他们不仅要集成复杂的健康数据系统,还要确保可扩缩性、安全性和符合 HL7 FHIR 等标准。 Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) 提供了一个标准化框架,使不同的健康 IT 系统能够毫不费力地进行通信,彻底改变了健康数据的交换方式。 但是,仅仅遵循 FHIR 标准并不足以应对健康数据集成错综复杂的问题。 解决方案合作伙伴必须利用 FHIR 代理、装饰和仓库等先进的架构组件来构建可扩缩的高效解决方案。 无论是本地部署、在公共云中,还是作为 InterSystems 管理的基于云的服务,InterSystems 提供为您的健康数据实现 FHIR 所需的所有必要功能。

Medical Science Hospital Lab Meeting healthcare

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数据是席卷医疗保健行业的数字化转型的核心。 要想发生根本性转变,需要一个新的基础来处理现代医疗保健的海量数据需求。

在您开发下一个治疗性突破、基因组见解和智能临床工作流时,上市速度至关重要。 您需要立即交付它们。

这就是我们为何扩展 InterSystems IRIS 数据平台的能力,以应对医疗保健信息的独特特征。 InterSystems IRIS for Health 是世界上第一个也是唯一一个专为快速开发医疗保健应用程序而设计的数据平台,管理着世界上最关键的数据。

IRIS Health diagram

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您知道当您拿到验血结果时一切看起来都像天书的那种感觉吗? 这就是 FHIRInsight 要解决的问题。 它最初的理念是,医疗数据不应该令人恐惧或困惑 – 它应该是我们所有人都能使用的东西。 验血是健康检查中十分常见的检查,但说实话,大多数人都很难理解它们,有时甚至对不擅长实验室工作的医务人员来说也是如此。 FHIRInsight 希望整个过程能够变得更简单,信息更富有实用价值。

🤖我们为什么要构建 FHIRInsight

这一切都始于一个简单而有力的问题:

“为什么验血结果仍然很难读懂 — 有时甚至对医生来说也是如此?”

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· 七月 18 阅读大约需 2 分钟
Fhir-丙型肝炎预测应用

大家好!

本文主要丰富了上一篇文章的内容,并介绍了应用程序的使用方法。

也许您已经读过上一篇文章,但我还是想说,
在完成初始化操作(包括模型创建和训练)后,Fhir HepatitisC Predict 应用程序将预测丙型肝炎(HepatitisC)。

首先

您需要在应用程序上输入一些信息,当然,只是一些检查结果,不包括隐私数据

SHOW显示

点击显示按钮,将显示该指标的数据是否在正常范围内,指标是高还是低。当然,每个指标的数据范围都是通过查询信息获得的,可能与实际范围略有不同。

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· 六月 3 阅读大约需 2 分钟
IRIS Interop DevTools: CCDA 和 FHIR 的 IRIS 转换入门

IRIS 支持开箱即用的 CCDA 和 FHIR 转换,但访问和查看这些功能需要大量的时间设置和产品知识。IRIS Interop DevTools 应用程序旨在弥补这一差距,让实施人员能够立即进入并查看产品的内置转换功能。

除了 IRIS XML、XPath 和 CCDA 转换环境,Interop DevTools 软件包现在还提供:

  • FHIR-SDA 转换设置
  • SDA-FHIR 转换设置
  • 构建 FHIR 错误验证
  • 加载 FHIR 转换所需的内容

已经更新仪表板的外观和感触,看起来更加直观和用户友好。在 IRIS 中执行,以便充分利用环境,同时用户界面允许可见性、可重复性以及隔离修改和模块进行测试的能力。

以下是5个功能支持:

1. XPath 评估器: 根据输入 CCD 评估 XPath 并返回结果

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Hi 大家好

在本文中,我讲介绍我的应用 iris-AgenticAI .

代理式人工智能的兴起标志着人工智能与世界互动方式的变革性飞跃--从静态响应转变为动态、目标驱动的问题解决方式。参看 OpenAI’s Agentic SDK , OpenAI Agents SDK使您能够在一个轻量级、易用且抽象程度极低的软件包中构建代理人工智能应用程序。它是我们之前的代理实验 Swarm 的生产就绪升级版。

该应用展示了下一代自主人工智能系统,这些系统能够进行推理、协作,并以类似人类的适应能力执行复杂任务。

应用功能

  • Agent Loop 🔄 一个内置循环,可自主管理工具的执行,将结果发回 LLM,并迭代直至任务完成。
  • Python-First 🐍 利用本地 Python 语法(装饰器、生成器等)来协调和连锁代理,而无需外部 DSL。
  • Handoffs 🤝 通过在专业代理之间委派任务,无缝协调多代理工作流程。
  • Function Tools ⚒️ 用 @tool 修饰任何 Python 函数,可立即将其集成到代理的工具包中。
  • Vector Search (RAG) 🧠 原生集成向量存储(IRIS),用于 RAG 检索。
  • Tracing 🔍 内置跟踪功能,可实时可视化、调试和监控代理工作流(想想 LangSmith 的替代方案)。
  • MCP Servers 🌐 通过 stdio 和 HTTP 支持模型上下文协议(MCP),实现跨进程代理通信。
  • Chainlit UI 🖥️ 集成 Chainlit 框架,可使用最少的代码构建交互式聊天界面。
  • Stateful Memory 🧠 跨会话保存聊天历史、上下文和代理状态,以实现连续性和长期任务。

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社区朋友们好,

传统的基于关键词的搜索方式在处理具有细微差别的领域特定查询时往往力不从心。而向量搜索则通过语义理解能力,使AI智能体能够根据上下文(而非仅凭关键词)来检索信息并生成响应。

本文将通过逐步指导,带您创建一个具备代理能力的AI RAG(检索增强生成)应用程序。

实现步骤:

  1. 添加文档摄取功能
    • 自动获取并建立文档索引(例如《InterSystems IRIS 2025.1版本说明》)
    • 实现向量搜索功能
  2. 构建向量搜索智能体
  3. 移交至主智能体(分流处理)
  4. 运行智能体

1. Create Agent Tools 添加文档摄取功能

Implement Document Ingestion: Automated ingestion and indexing of documents


1.1 - 以下是实现文档摄取工具的代码:

    def ingestDoc(self):
        #Check if document is defined, by selecting from table
        #If not defined then INGEST document, Otherwise back
        embeddings = OpenAIEmbeddings()	
        #Load the document based on the fle type
        loader = TextLoader("/irisdev/app/docs/IRIS2025-1-Release-Notes.txt", encoding='utf-8')      
        
        documents = loader.load()        
        text_splitter = RecursiveCharacterTextSplitter(chunk_size=400, chunk_overlap=0)
        
        texts = text_splitter.split_documents(documents)
                       
        #COLLECTION_NAME = "rag_document"
        db = IRISVector.from_documents(
            embedding=embeddings,
            documents=texts,
            collection_name = self.COLLECTION_NAME,
            connection_string=self.CONNECTION_STRING,
        )

        db = IRISVector.from_documents(embedding=embeddings,documents=texts, collection_name = self.COLLECTION_NAME, connection_string=self.CONNECTION_STRING,)

向量搜索智能体(Vector Search Agent)能够自动完成文档的摄取(ingest)索引构建(index), 该新功能在InterSystems IRIS 2025.1的数据资源文件夹里) 至 IRIS 向量存储, 只有当数据尚未存在时,才执行该操作。



运行以下查询以从向量存储中获取所需数据:

SELECT
id, embedding, document, metadata
FROM SQLUser.AgenticAIRAG



1.2 - 实现向量搜索功能


以下代码为智能体提供了搜索能力:

 def ragSearch(self,prompt):
        #Check if collections are defined or ingested done.
        # if not then call ingest method
        embeddings = OpenAIEmbeddings()	
        db2 = IRISVector (
            embedding_function=embeddings,    
            collection_name=self.COLLECTION_NAME,
            connection_string=self.CONNECTION_STRING,
        )
        docs_with_score = db2.similarity_search_with_score(prompt)
        relevant_docs = ["".join(str(doc.page_content)) + " " for doc, _ in docs_with_score]
        
        #Generate Template
        template = f"""
        Prompt: {prompt}
        Relevant Docuemnts: {relevant_docs}
        """
        return template


分流代理处理传入的用户查询,并将其委托给矢量搜索代理,后者执行语义搜索操作,以检索最相关的信息。

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· 三月 14, 2024 阅读大约需 3 分钟
Fhir-肝炎预测

使用 FHIR SQL BUILDER 处理 FHIR 资源以预测患丙型肝炎疾病的概率

随着科技的发展,医疗行业也在不断的进步,人类也往往更加关注自身的健康,
通过计算机学习和处理数据集,可以预测疾病。

前提条件:使用 FHIR 和 ML的能力
首先,我们的数据集从kaggle获得,并根据患者性别、年龄、ALP或ALT转化为FHIR资源,并导入到FHIR资源库中

要导入FHIR资源库,我们可以使用以下命令:

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· 三月 14, 2024 阅读大约需 5 分钟
使用 FHIR 适配器在旧系统上提供 FHIR 服务 - 发布资源

在上一篇文章中,我们了解了如何恢复存储在特定 HIS 数据库中的资源,因此今天我们将了解如何在 HIS 中添加新记录,其来源是我们在系统中收到的 FHIR 资源。

FHIR 的 CRUD 操作

FHIR 的主要功能之一是通过 Rest API 支持 CRUD 操作,这意味着任何使用 FHIR 的系统都必须提供对 GET、POST、PUT 和 DELETE 类型的 HTTP 调用的支持。在今天的文章中,我们将了解如何管理对安装 FHIR 适配器时自动配置的端点的 POST 调用。

如果我们回顾资源存储调用的 FHIR 规范,我们会发现它告诉我们,用于调用的 URL 必须遵循以下格式:

http(s)://server_url/{endpoint}/{Resource}

在我们的示例中,我们将不使用安全调用,因此我们的 URL 将如下所示:

http://localhost:52774/Adapter/r4/Patient

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· 三月 14, 2024 阅读大约需 6 分钟
教程:将 OpenAI 添加到互操作性生产中

人工智能(AI)最近受到广泛关注,因为它可以改变我们生活的许多领域。更好的计算机能力和更多数据帮助人工智能完成了许多惊人的事情,例如改进医学测试和制造自动驾驶汽车。人工智能还可以帮助企业做出更好的决策,提高工作效率,这也是人工智能越来越流行和广泛应用的原因。如何将 OpenAI API 调用集成到现有的 IRIS 互操作性应用程序中?

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· 十二月 29, 2023 阅读大约需 9 分钟
使用 FHIR 适配器在传统系统上提供 FHIR 服务 - 阅读资源

我们继续推出有关可供 HealthShare HealthConnect 和 InterSystems IRIS 用户使用的 FHIR 适配器工具的系列文章。

在前几篇文章中,我们介绍了小型应用程序,并在此基础上建立了我们的工作,并展示了安装 FHIR 适配器后在 IRIS 实例中部署的架构。在今天的文章中,我们将看到一个示例,说明如何执行最常见的 CRUD(创建 - 读取 - 更新 - 删除)操作之一,即读取操作,我们将通过恢复资源来完成此操作。

什么是资源?

FHIR 中的一个资源对应一种相关的临床信息,这种信息可以是病人(Patient)、对实验室的请求(ServiceRequest)或诊断(Condition)等。每种资源都定义了组成它的数据类型,以及对数据的限制和与其他类型资源的关系。每个资源都允许对其包含的信息进行扩展,从而满足 FHIR 80% 以外的需求(满足 80% 以上用户的需求)。

在本文的示例中,我们将使用最常见的资源 "Patient"。让我们来看看它的定义:

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我们继续使用FHIR适配器的示例,在本文中,我们将回顾如何在我们的IRIS实例中进行配置以及安装的结果。

配置项目的步骤与官方文档中所示的相同,您可以直接在此处查看。好吧,让我们开始工作吧!

安装

正如您在与本文相关的项目中看到的,我们将 IRIS 实例部署在 Docker 中,因此初始配置的主要部分将在 Dockerfile 中完成。别担心,我们不会详细介绍 Docker 配置。

要安装 FHIR 适配器,我们只需:

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想必大家都听说过 FHIR 是解决系统间所有互操作性和兼容性问题的灵丹妙药和解决方案。就在这里,我们可以看到他手持一份 FHIR 资源,愉快地享受其中:

但对于我们这些普通人,我们将做一个小小的介绍。

什么是 FHIR?

让我们直接进入定义:FHIR(Fast Healthcare Interoperability Resource)是由HL7(Health Level 7标准组)开发的一种互操作性标准,旨在实现医疗行业中不同系统之间的电子医疗数据交换。

FHIR 从根本上基于哪些技术?

主要是通过 REST API 和 JSON 格式进行 HTTP 调用的结合(尽管它可以是 XML 以及我们可用的任何其他通信,具体根据我们的使用情况)。

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您好!社区的各位老师,

在我的上一篇文章中,我们学习了以下主题:

  1. 什么是 Docker?
  2. Docker 的一些好处
  3. Docker 是如何工作的?
  4. Docker 镜像
  5. Docker容器
  6. Docker 镜像存储库
  7. InterSystems 的 Docker 镜像存储库
  8. Docker安装
  9. Docker 基本命令
  10. 使用 Docker 运行 IRIS 社区版
  11. Docker 桌面图形用户界面

在本文中,我们将讨论以下主题:

  1. 使用 Docker Compose 文件( YAML 文件)
  2. Docker 文件的使用(用于构建 Docker 镜像)
  3. Docker 卷的使用

那么让我们开始吧。

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· 九月 5, 2023 阅读大约需 11 分钟
HTTP请求监控响应时间

嗨,开发者们!

今天我想谈谈一个让我感到困难的话题。我相信你们中的很多人一定已经遇到过这种情况(所谓的“瓶颈”)。由于这是一个广泛的主题,因此本文将仅重点关注识别可能导致缓慢问题的传入 HTTP 请求。我还将向您提供我开发的一个小工具来帮助识别它们。

我们的软件变得越来越复杂,处理来自不同来源的大量请求,无论是前端还是第三方后端应用程序。为了确保最佳性能,必须有一个能够记录一些关键测量的日志系统,例如响应时间、global引用的数量以及每个 HTTP 响应执行的代码行数。作为工作的一部分,我参与了 EMR 软件的开发以及事件分析。由于用户负载主要来自 HTTP 请求(REST API 或 CSP 应用程序),因此在发生普遍缓慢问题时进行此类测量的需求变得显而易见。

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VR ICU® 是 InterSystems FHIR 创新孵化器 Caelestinus 的参与者。这篇文章将向您介绍我们利用 InterSystems FHIR Server 为医疗保健提供的 VR 解决方案。

我们是一家技术初创企业虚拟实验室,利用先进的 VR/AR 技术开发解决方案。VR ICU® 是一个针对重症监护室医务人员的培训平台,是在 Covid 时代为满足医院需求而创建的。

与InterSystems合作的优势

我们的 VR ICU® 解决方案符合实践需求,是与医院合作开发的。

除了技术解决方案和技能学习本身,记录培训课程、培训进度和成功率对于医院或麻醉学和重症监护部门的有效管理也至关重要。医务长可以通过了解谁在何时接受了培训,清楚地掌握能够在重症监护室使用设备的人员数量,从而有效地对他们进行培训,以保持技能、有控制地规划人员技能储备并提高他们的能力。

在这方面,与 InterSystems 的合作对我们来说至关重要,它使我们能够在应用程序中存储每次培训期间的数据。目前,我们会记录参与者的姓名、培训日期和时长、培训类型、设备类型、错误数量和类型,必要时还会记录培训成功完成的信息。

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· 七月 31, 2023 阅读大约需 2 分钟
ChatGPT 与 InterSystems FHIR SQL 数据库构建器

FHIR® SQL Builder或 Builder 是 InterSystems IRIS 医疗版数据平台 的一个组件。它是一种复杂的投射工具,用于将 InterSystems IRIS 医疗版数据平台FHIR 存储库中的数据创建为自定义的 SQL 模式,而无需将数据移动到单独的 SQL 存储库中。 Builder 专门设计用于与 InterSystems IRIS 医疗版数据平台中的 FHIR 存储库和多模型数据库配合使用。

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