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这篇文章是对我的  iris-globals-graphDB 应用的介绍。
在这篇文章中,我将演示如何在Python Flask Web 框架和PYVIS交互式网络可视化库的帮助下,将图形数据保存和抽取到InterSystems Globals中。

建议

 

第一步 : 通过使用Python 原生SDK建立与IRIS Globals的链接

 #create and establish connection
  if not self.iris_connection:
         self.iris_connection = irisnative.createConnection("localhost", 1972, "USER", "superuser", "SYS")
                                     
  # Create an iris object
  self.iris_native = irisnative.createIris(self.iris_connection)
  return self.iris_native

 

第二步 : 使用 iris_native.set( ) 功能把数据保存到Globals 里     

#import nodes data from csv file
isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1nodes")
if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1nodes.csv", newline='') as csvfile:

 reader = csv.DictReader(csvfile)
 for row in reader:
    self.iris_native.set(row["name"], "^g1nodes", row["id"])

 #import edges data from csv file
 isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1edges")
 if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1edges.csv", newline='') as csvfile:
 reader = csv.DictReader(csvfile)
 counter = 0                
 for row in reader:
    counter = counter + 1
    #Save data to globals
    self.iris_native.set(row["source"]+'-'+row["target"], "^g1edges", counter)  

 

第三步: 使用iris_native.get() 功能把节点和边缘数据从Globals传递给PYVIS

 #Get nodes data for basic graph    
  def get_g1nodes(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1nodes")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1nodes",level1_subscript)
            element = {"id": level1_subscript, "label": val, "shape":"circle"}
            result.append(element)            
        return result

    #Get edges data for basic graph  
    def get_g1edges(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1edges")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1edges",level1_subscript)
            element = {"from": int(val.rpartition('-')[0]), "to": int(val.rpartition('-')[2])}
            result.append(element)            
        return result

 

Step4: Use PYVIS Javascript to generate graph data

<script type="text/javascript">
    // initialize global variables.
    var edges;
    var nodes;
    var network;
    var container;
    var options, data;
  
    // This method is responsible for drawing the graph, returns the drawn network
    function drawGraph() {
        var container = document.getElementById('mynetwork');
        let node = JSON.parse('{{ nodes | tojson }}');
        let edge = JSON.parse('{{ edges | tojson }}');
     
        // parsing and collecting nodes and edges from the python
        nodes = new vis.DataSet(node);
        edges = new vis.DataSet(edge);

        // adding nodes and edges to the graph
        data = {nodes: nodes, edges: edges};

        var options = {
            "configure": {
                "enabled": true,
                "filter": [
                "physics","nodes"
            ]
            },
            "nodes": {
                "color": {
                  "border": "rgba(233,180,56,1)",
                  "background": "rgba(252,175,41,1)",
                  "highlight": {
                    "border": "rgba(38,137,233,1)",
                    "background": "rgba(40,138,255,1)"
                  },
                  "hover": {
                    "border": "rgba(42,127,233,1)",
                    "background": "rgba(42,126,255,1)"
                 }
                },

                "font": {
                  "color": "rgba(255,255,255,1)"
                }
              },
            "edges": {
                "color": {
                    "inherit": true
                },
                "smooth": {
                    "enabled": false,
                    "type": "continuous"
                }
            },
            "interaction": {
                "dragNodes": true,
                "hideEdgesOnDrag": false,
                "hideNodesOnDrag": false,
                "navigationButtons": true,
                "hover": true
            },

            "physics": {
                "barnesHut": {
                    "avoidOverlap": 0,
                    "centralGravity": 0.3,
                    "damping": 0.09,
                    "gravitationalConstant": -80000,
                    "springConstant": 0.001,
                    "springLength": 250
                },

                "enabled": true,
                "stabilization": {
                    "enabled": true,
                    "fit": true,
                    "iterations": 1000,
                    "onlyDynamicEdges": false,
                    "updateInterval": 50
                }
            }
        }
        // if this network requires displaying the configure window,
        // put it in its div
        options.configure["container"] = document.getElementById("config");
        network = new vis.Network(container, data, options);
        return network;
    }
    drawGraph();
</script>

 

第五步: 从app.py 主文件调用上面的代码

#Mian route. (index)
@app.route("/")
def index():
    #Establish connection and import data to globals
    irisglobal = IRISGLOBAL()
    irisglobal.import_g1_nodes_edges()
    irisglobal.import_g2_nodes_edges()

    #getting nodes data from globals
    nodes = irisglobal.get_g1nodes()
    #getting edges data from globals
    edges = irisglobal.get_g1edges()

    #To display graph with configuration
    pyvis = True
    return render_template('index.html', nodes = nodes,edges=edges,pyvis=pyvis)    

下面是关于此项目的 介绍视频:

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在集成平台建设如火如荼的今天,如何能最大程度发挥集成平台价值,让集成平台不再止步于业务系统接口的打通,而是真正作为医院的IT基础架构,释放出更大价值?5月27日,InterSystems技术总监乔鹏 ( @Qiao.Peng )和InterSystems销售工程师王菁伟( @Jingwei Wang )将针对集成平台建成后的应用价值,围绕“业务流程再造”角度,探讨以低代码方式梳理并再造业务闭环流程、从而赋能业务创新并促进医院精细化管理和高质量发展。点击链接或扫描报名。

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姚 鑫 · 二月 3, 2021 阅读大约需 2 分钟
第二十三章 Caché 变量大全 $Y 变量

第二十三章 Caché 变量大全 $Y 变量

包含光标的当前垂直位置。

大纲

$Y

描述

$Y包含光标的当前垂直位置。当字符写入设备时,Caché会更新$Y以反映垂直光标位置。

输出的每个换行符(换行符)(ASCII 10)将$Y递增1。换页符(ASCII 12)将$Y重置为0。

$Y是16位无符号整数。当其值达到65536时,$Y换行为0。换句话说,如果$Y为65535,则下一个输出字符将其重置为0。

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姚 鑫 · 二月 19, 2021 阅读大约需 2 分钟
第四十一章 Caché 变量大全 $ZSTORAGE 变量

第四十一章 Caché 变量大全 $ZSTORAGE 变量

包含进程的最大可用内存。

大纲

$ZSTORAGE
$ZS

描述

$ZSTORAGE包含JOB的进程私有内存的最大内存量(以KB为单位)。此内存可用于局部变量、堆栈和其他表。此内存限制不包括例程目标代码的空间。此内存根据需要分配给进程,例如在分配数组时。

一旦将此内存分配给进程,通常在该进程退出之前不会释放它。但是,当大量内存被使用(例如,大于32MB)然后被释放时,系统间IRIS会尝试在可能的情况下将释放的内存释放回操作系统。

还可以使用$ZSTORAGE设置最大内存大小。例如,以下语句将作业的最大进程专用内存设置为524288 KB

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姚 鑫 · 三月 5, 2021 阅读大约需 9 分钟
第四章 SQL标识符

第四章 标识符

标识符

标识符是SQL实体的名称,例如表、视图、列(字段)、模式、表别名、列别名、索引、存储过程、触发器或其他SQL实体。
标识符名称在其上下文中必须是唯一的;
例如,同一模式中的两个表或同一表中的两个字段不能具有相同的名称。
但是,不同模式中的两个表或不同表中的两个字段可以具有相同的名称。
在大多数情况下,相同的标识符名称可以用于不同类型的SQL实体;
例如,一个模式、该模式中的表以及该表中的字段都可以具有相同的名称,而不会产生冲突。
但是,同一个模式中的表和视图不能具有相同的名称。

InterSystems IRIS®数据平台SQL标识符遵循一组命名约定,根据标识符的使用,这可能会受到进一步的限制。
标识符不区分大小写。

标识符可以是简单标识符,也可以是分隔符。
InterSystems SQL默认支持简单标识符和分隔标识符。

简单标识符

简单标识符有以下语法:

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姚 鑫 · 三月 18, 2021 阅读大约需 6 分钟
第十二章 使用嵌入式SQL(二)

第十二章 使用嵌入式SQL(二)

嵌入式SQL代码

简单的SQL语句

可以将简单的SQL语句(单个嵌入式SQL语句)用于各种操作,包括:

  • INSERTUPDATEINSERT OR UPDATEDELETE语句。
  • `DDL语句。
  • GRANTREVOKE语句。
  • 只返回一行的SELECT语句(或者如果只对返回的第一行感兴趣)。

简单的SQL语句也被称为非基于游标的SQL语句。本章稍后将介绍基于游标的嵌入式SQL。

例如,以下语句查找ID为43的(唯一的)患者的姓名:

 &sql(SELECT Name INTO :name
    FROM Patient
    WHERE %ID = 43)

如果对可以返回多行的查询使用简单语句,则只返回第一行:

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姚 鑫 · 四月 9, 2021 阅读大约需 4 分钟
第二十一章 导入和导出SQL数据

第二十一章 导入和导出SQL数据

在InterSystems IRIS®Data Platform Management Portal中,有用于导入和导出数据的工具:
- 从文本文件导入数据
- 将数据导出到文本文件

这些工具使用动态SQL,这意味着查询是在运行时准备和执行的。可以导入或导出的行的最大大小为3,641,144个字符。

还可以使用%SQL.Import.Mgr类导入数据,使用%SQL.Export.Mgr类导出数据。

从文本文件导入数据

可以将数据从文本文件导入到合适的InterSystems IRIS类中。执行此操作时,系统将在表中为该类创建并保存新行。该类必须已经存在并且必须编译。要将数据导入到此类中,请执行以下操作:
1. 从管理门户中选择系统资源管理器,然后选择SQL。使用页面顶部的切换选项选择一个命名空间;这将显示可用命名空间的列表。
2. 在页面顶部,单击向导下拉列表,然后选择数据导入。

  1. 在向导的第一页上,从指定外部文件的位置开始。对于导入文件所在的位置,请单击要使用的服务器的名称。

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你好,

我们需要跟踪数据库随时间的变化-如果可能的话,跟踪到SQL粒度级别。例如:用户xyz运行例程^ abc,我们得到类似于更改日志的信息,该日志告诉我们:表A的值已更新,插入,更新等。

是否可以使用IRIS级别的工具(审计日志,Journal文件等),将日志的全局集和终止数转换为SQL级别更改?

我还找到了一个名为Liquibase的第三方基于Java的工具,但它似乎更适合于跟踪基于架构和表的更改或预定义的定义。

谢谢,

詹姆士

Tracking DAT / Database Changes Over Time, Similar to SQL ChangeLog

Hello,

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姚 鑫 · 五月 4, 2021 阅读大约需 7 分钟
第二章 全局变量结构(二)

第二章 全局变量结构(二)

全局变量物理结构

全局变量使用高度优化的结构存储在物理文件中。管理此数据结构的代码也针对运行InterSystems IRIS的每个平台进行了高度优化。这些优化确保全局操作具有高吞吐量(每单位时间的操作数)、高并发性(并发用户总数)、缓存的高效使用,并且不需要与性能相关的持续维护(例如频繁的重建、重新索引或压缩)。

用于存储全局变量的物理结构是完全封装的;应用程序不会以任何方式担心物理数据结构。

全局变量存储在磁盘上的一系列数据块中;每个块的大小(通常为8KB)是在创建物理数据库时确定的。为了提供对数据的高效访问,InterSystems IRIS维护了一种复杂的B树状结构,该结构使用一组指针块将相关数据块链接在一起。InterSystems IRIS维护一个缓冲池-经常引用的块的内存缓存-以降低从磁盘获取块的成本。

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姚 鑫 · 五月 9, 2021 阅读大约需 6 分钟
第四章 多维存储的SQL和对象使用(一)

第四章 多维存储的SQL和对象使用(一)

本章介绍InterSystems IRIS®对象和SQL引擎如何利用多维存储(全局变量)来存储持久对象、关系表和索引。

尽管InterSystems IRIS对象和SQL引擎会自动提供和管理数据存储结构,但了解其工作原理的详细信息还是很有用的。

数据的对象视图和关系视图使用的存储结构是相同的。为简单起见,本章仅从对象角度介绍存储。

数据

每个使用%Storage.Persistent存储类(默认)的持久化类都可以使用多维存储(全局变量)的一个或多个节点在InterSystems IRIS数据库中存储其自身的实例。

每个持久化类都有一个存储定义,用于定义其属性如何存储在全局变量节点中。这个存储定义(称为“默认结构”)由类编译器自动管理。

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由于这是一个预览版,我们渴望在下个月的通用版发布之前了解您对这个新版本的经验。请通过开发者社区分享您的反馈,以便我们能够共同打造一个更好的产品。

InterSystems IRIS数据平台2021.1是一个扩展维护(EM)版本。自2020.1(上一个EM版本)以来,在持续交付(CD)版本中增加了许多重要的新功能和改进。请参考2020.22020.32020.4的发布说明,了解这些内容的概况。

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说明

欢迎来到InterSystems广播站--数据点!在这一集里,我们和在线培训团队负责人Jenny Ames聊了聊InterSystems IRIS--稳定、灵活、可扩展、可互操作的数据平台,它为世界上许多最关键的核心应用提供支持。从它的多模型性质到它的集成引擎,再到它的医疗保健功能,在一次谈话中,有很多东西需要解读。

本期节目回放:https://datapoints.castos.com/episodes/1-what-is-intersystems-iris-jenny...

关于InterSystems广播站的更多信息,请访问https://datapoints.intersystems.com

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Jingwei Wang · 三月 24 阅读大约需 3 分钟
创建REST 服务

 

REST是一种架构风格,而不是一种格式。尽管REST经常使用HTTP来传输消息,使用JSON来传递数据,但你也可以用XML或纯文本来传递数据。REST利用了现有的网络标准,如HTTP、URL、XML和JSON。

虽然它可以使用XML来描述数据,但它更常使用JSON,这是一个轻量级的数据封装器。

InterSystems REST服务

InterSystems REST服务由以下组件组成:

规范类(%REST.Spec的一个子类):这个类包含了REST服务的OpenAPI 2.0规范(Swagger)。InterSystems支持几个扩展属性,你可以在规范中使用。

调度类(%CSP.REST的一个子类):这个类负责接收HTTP请求并在实现类中调用合适的方法。

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InterSystems SQL支持在InterSystems IRIS数据平台数据库中将流数据存储为BLOB(Binary Large Objects 二进制大对象)或CLOB(Character Large Objects字符大对象)的能力。

InterSystems SQL支持两种流字段:

  • 字符流:用于大量的文本。
  • 二进制流:用于图像、音频或视频。

BLOBs和CLOBs可以存储多达4GB的数据(JDBC和ODBC规范规定的限制)。除了在通过ODBC或JDBC客户端访问时如何处理字符编码转换(如Unicode到多字节)外,BLOB和CLOB的操作在各方面都是相同的:BLOB中的数据被视为二进制数据,决不转换为其他编码,而CLOB中的数据被视为字符数据,在必要时进行转换。

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姚 鑫 · 二月 4, 2021 阅读大约需 5 分钟
第二十四章 Caché 变量大全 $ZA 变量

# <center> 第二十四章 Caché 变量大全 $ZA 变量

包含当前设备上最后一次读取的状态。

# 大纲

```java
$ZA
```

# 描述

`$ZA`包含当前设备上最后一次读取的状态。

不能使用`SET`命令修改此特殊变量。尝试这样做会导致`<SYNTAX>`错误。

# 注意

## `$ZA`,带终端I / O

`$ZA`被实现为一系列位标志,每个位表示一条特定的信息。下表显示了可能的值、它们的含义,以及如何使用模(`#`)和整数除(`\`)运算符测试它们:

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姚 鑫 · 二月 20, 2021 阅读大约需 6 分钟
第四十二章 Caché 变量大全 $ZTIMESTAMP 变量

第四十二章 Caché 变量大全 $ZTIMESTAMP 变量

包含协调世界时间格式的当前日期和时间。

大纲

$ZTIMESTAMP
$ZTS

描述

$ZTIMESTAMP包含协调的通用时间值形式的当前日期和时间。这是世界范围内的时间和日期标准;此值很可能与当地的时间(和日期)值不同。

$ZTIMESTAMP将日期和时间表示为以下格式的字符串:

ddddd,sssss.fff

其中ddddd是一个整数,指定自1840年12月31日起的天数;sssss是一个整数,指定自当天午夜以来的秒数,fff是一个可变的数字,指定小数秒。这种格式类似于$HOROLOG,只是$HOROLOG不包含分数秒。

假设当前日期和时间(世界协调时)如下:

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