2021年9月13日,中国 北京—— 致力于帮助客户解决最关键的可扩展性、互操作性和速度问题的创新数据技术提供商InterSystems今日宣布在中国推出InterSystems IRIS医疗版互联互通套件,以满足医院信息化建设的标准化要求,促进业务协同,助力公立医院高效建设互联互通平台。

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· 三月 5, 2021 阅读大约需 9 分钟
第四章 SQL标识符

第四章 标识符

标识符

标识符是SQL实体的名称,例如表、视图、列(字段)、模式、表别名、列别名、索引、存储过程、触发器或其他SQL实体。
标识符名称在其上下文中必须是唯一的;
例如,同一模式中的两个表或同一表中的两个字段不能具有相同的名称。
但是,不同模式中的两个表或不同表中的两个字段可以具有相同的名称。
在大多数情况下,相同的标识符名称可以用于不同类型的SQL实体;
例如,一个模式、该模式中的表以及该表中的字段都可以具有相同的名称,而不会产生冲突。
但是,同一个模式中的表和视图不能具有相同的名称。

InterSystems IRIS®数据平台SQL标识符遵循一组命名约定,根据标识符的使用,这可能会受到进一步的限制。
标识符不区分大小写。

标识符可以是简单标识符,也可以是分隔符。
InterSystems SQL默认支持简单标识符和分隔标识符。

简单标识符

简单标识符有以下语法:

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· 四月 13, 2021 阅读大约需 14 分钟
第二章 定义和构建索引(一)

第二章 定义和构建索引(一)

概述

索引是由持久类维护的结构,InterSystems IRIS®数据平台可以使用它来优化查询和其他操作。

可以在表中的字段值或类中的相应属性上定义索引。(还可以在多个字段/属性的组合值上定义索引。)。无论是使用SQL字段和表语法还是类属性语法定义相同的索引,都会创建相同的索引。当定义了某些类型的字段(属性)时,InterSystems IRIS会自动定义索引。可以在存储数据或可以可靠派生数据的任何字段上定义附加索引。InterSystems IRIS提供了几种类型的索引。可以为同一字段(属性)定义多个索引,为不同的目的提供不同类型的索引。

无论是使用SQL字段和表语法,还是使用类属性语法,只要对数据库执行数据插入、更新或删除操作,InterSystems IRIS就会填充和维护索引(默认情况下)。可以覆盖此默认值(通过使用%NOINDEX关键字)来快速更改数据,然后作为单独的操作生成或重新生成相应的索引。可以在用数据填充表之前定义索引。还可以为已经填充了数据的表定义索引,然后作为单独的操作填充(构建)索引。

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· 三月 27, 2021 阅读大约需 11 分钟
第十三章 使用动态SQL(五)

第十三章 使用动态SQL(五)

从结果集中返回特定的值

要从查询结果集中返回特定的值,必须一次一行遍历结果集。
要遍历结果集,请使用%Next()实例方法。
(对于单一值,结果对象中没有行,因此%Next()返回0,而不是错误。)
然后,可以使用%Print()方法显示整个当前行的结果,或者检索当前行的指定列的值。

%Next()方法获取查询结果中下一行的数据,并将该数据放入结果集对象的data属性中。
%Next()返回1,表示它位于查询结果中的某一行上。
%Next()返回0,表示它位于最后一行(结果集的末尾)之后。
每次调用%Next()返回1个增量%ROWCOUNT;
如果游标定位在最后一行之后(%Next()返回0),%ROWCOUNT表示结果集中的行数。

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· 三月 17, 2021 阅读大约需 9 分钟
第十二章 使用嵌入式SQL(一)

第十二章 使用嵌入式SQL(一)

可以将SQL语句嵌入InterSystemsIRIS®数据平台使用的ObjectScript代码中。这些嵌入式SQL语句在运行时转换为优化的可执行代码。

嵌入式SQL有两种:

  • 一个简单的嵌入式SQL查询只能返回单行中的值。简单嵌入式SQL还可以用于单行插入,更新和删除以及其他SQL操作。
  • 基于游标的嵌入式SQL查询可以遍历查询结果集,并从多行中返回值。基于游标的嵌入式SQL也可以用于多行更新和删除SQL操作。

注意:嵌入式SQL不能输入到Terminal命令行,也不能在XECUTE语句中指定。要从命令行执行SQL,请使用$SYSTEM.SQL.Execute()方法或SQL Shell接口。

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· 九月 27, 2021 阅读大约需 34 分钟
IRIS 2021 技术文档 First Look 17 Globals
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(ECP) Caché 出色的可用性和扩展特性之一是企业缓存协议 (ECP)。 在应用程序开发过程中,如对使用 ECP 的分布式处理加以考虑,可以横向扩展 Caché 应用程序的架构。 应用程序处理可以调整为非常高的速率,处理能力从单个应用程序服务器扩展到最多 255 个应用程序服务器,并且不需要任何应用程序更改。

在我参与的 TrakCare 部署中,ECP 已广泛使用多年。 十年前,主要供应商之一的一台“大型”x86 服务器可能总共只有八个核心。 对于大型部署来说,ECP 是横向扩展商业服务器处理能力的方式,不适合单台昂贵的大型企业服务器。 即使是高核心数的企业服务器也有限制,因此 ECP 也用于扩展这些服务器上的部署。

如今,大多数的新 TrakCare 部署或升级到当前硬件不需要 ECP 即可扩展。 目前的双插槽 x86 生产服务器可以拥有数十个核心和巨大容量的内存。 我们看到,在最近的 Caché 版本中,TrakCare 以及许多其他 Caché 应用程序具有可预测的线性扩展能力,能够随着单台服务器中 CPU 核心数量和内存的增加而支持逐渐增多的用户和事务。 在现场,我看到大多数的新部署都是虚拟化的,即使如此,虚拟机也可以根据需要扩展到主机服务器的规模。 如果资源需求超过单个物理主机可以提供的资源,则使用 ECP 进行横向扩展。

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以下步骤展示如何显示 /api/monitor 服务提供的指标列表示例。

在上个帖子中,我概述了以 Prometheus 格式显示 IRIS 指标的服务。 该贴介绍了如何在容器中设置和运行 IRIS 预览版 2019.4,然后列出了指标。


本帖假定您已安装 Docker。 如果未安装,现在就为您的平台安装吧 :)


步骤 1. 下载并运行 docker 形式的 IRIS 预览版

按照预览发行版的下载说明下载预览版许可证密钥IRIS Docker 映像。 例如,我选择了 InterSystems IRIS for Health 2019.4

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· 四月 20, 2021 阅读大约需 13 分钟
第四章 缓存查询(一)

第四章 缓存查询(一)

系统自动维护已准备好的SQL语句(“查询”)的缓存。这允许重新执行SQL查询,而无需重复优化查询和开发查询计划的开销。缓存查询是在准备某些SQL语句时创建的。准备查询发生在运行时,而不是在编译包含SQL查询代码的例程时。通常,PREPARE紧跟在SQL语句的第一次执行之后,但在动态SQL中,可以准备查询而不执行它。后续执行会忽略PREPARE语句,转而访问缓存的查询。要强制对现有查询进行新的准备,必须清除缓存的查询。

所有SQL调用都会创建缓存查询,无论是在ObjectScript例程中调用还是在类方法中调用。
- 动态SQL、ODBC、JDBC和$SYSTEM.SQL.DDLImport()方法在准备查询时创建缓存查询。管理门户执行SQL接口、InterSystems SQL Shell和%SYSTEM.SQL.Execute()方法使用动态SQL,因此使用准备操作来创建缓存查询。

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· 五月 9, 2023 阅读大约需 5 分钟
接收从 PACS 到 IRIS for Health 的 DICOM 消息

在上一篇文章中,我们看到了如何捕获位于我们服务器上一个文件夹中的DICOM类型的文件,以及如何将它们发送到PACS软件(在我们的案例中是ORTHANC开源解决方案)进行存储和咨询。那么,在这篇文章中,我们要处理的是相反的动作。

在我们的例子中,我们将配置我们的IRIS for Health Prodcution,以接收从我们的PACS通过TCP/IP发送的图像。要做到这一点,我们必须包括一个标准EnsLib.DICOM.Service.TCP类的业务服务,它将允许我们配置接收端。让我们来看看这个配置:

如您所见,我们已经声明了将监听的端口,通过该端口将接收从 PACS 发送的图像。我们还配置了本地 AET (Application Entity Title,应用实体名称)(IRIS) 和将向我们发送 DICOM (ORTHANC) 的 PACS,请记住这些字段是强制性的,并且将用于检查发送和接收 DICOM 消息的有效性。不要忘记必须从 DICOM 设置菜单配置和关联两个 AET:

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· 五月 12, 2021 阅读大约需 15 分钟
InterSystems 数据平台和性能 - 第 4 篇 - 关注内存

本帖将展示为 InterSystems 数据平台上运行的数据库应用调整共享内存需求(包括 global 和例程缓冲区、gmheap 以及 locksize)的方法,以及在配置服务器和虚拟化 Caché 应用程序时应考虑的一些性能提示。 和以往一样,当我谈到 Caché 时,我指的是所有数据平台(Ensemble、HealthShare、iKnow 和 Caché)。


本系列其他帖子的列表


当我最初开始使用 Caché 时,大多数客户的操作系统是 32 位的,Caché 应用程序的内存有限且昂贵。 通常部署的英特尔服务器只有几个核心,唯一的扩展方式是选择大型服务器,或者使用 ECP 横向扩展。 现在,即使是基本的生产级服务器也具有多个处理器、几十个核心,并且最小内存为 128 或 256 GB,可能达到 TB。 对于大多数数据库安装,ECP 已被遗忘,我们现在可以在单台服务器上大幅提高应用事务处理速率。

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本文提供了一个参考架构,作为示例说明基于 InterSystems Technologies(适用于 CachéEnsembleHealthShareTrakCare 以及相关的嵌入式技术,例如 DeepSeeiKnowZen Zen Mojo)提供的强大性能和高可用性应用。
Azure 有两种用于创建和管理资源的不同部署模型:Azure Classic Azure Resource Manager 本文中的详细信息基于 Azure Resource Manager (ARM) 模型。

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· 四月 13, 2022 阅读大约需 7 分钟
用Globals 作为图数据库来存储和抽取图结构数据

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这篇文章是对我的  iris-globals-graphDB 应用的介绍。
在这篇文章中,我将演示如何在Python Flask Web 框架和PYVIS交互式网络可视化库的帮助下,将图形数据保存和抽取到InterSystems Globals中。

建议

 

第一步 : 通过使用Python 原生SDK建立与IRIS Globals的链接

 #create and establish connection
  if not self.iris_connection:
         self.iris_connection = irisnative.createConnection("localhost", 1972, "USER", "superuser", "SYS")
                                     
  # Create an iris object
  self.iris_native = irisnative.createIris(self.iris_connection)
  return self.iris_native

 

第二步 : 使用 iris_native.set( ) 功能把数据保存到Globals 里     

#import nodes data from csv file
isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1nodes")
if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1nodes.csv", newline='') as csvfile:

 reader = csv.DictReader(csvfile)
 for row in reader:
    self.iris_native.set(row["name"], "^g1nodes", row["id"])

 #import edges data from csv file
 isdefined = self.iris_native.isDefined("^g1edges")
 if isdefined == 0:
    with open("/opt/irisapp/misc/g1edges.csv", newline='') as csvfile:
 reader = csv.DictReader(csvfile)
 counter = 0                
 for row in reader:
    counter = counter + 1
    #Save data to globals
    self.iris_native.set(row["source"]+'-'+row["target"], "^g1edges", counter)  

 

第三步: 使用iris_native.get() 功能把节点和边缘数据从Globals传递给PYVIS

 #Get nodes data for basic graph    
  def get_g1nodes(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1nodes")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1nodes",level1_subscript)
            element = {"id": level1_subscript, "label": val, "shape":"circle"}
            result.append(element)            
        return result

    #Get edges data for basic graph  
    def get_g1edges(self):
        iris = self.get_iris_native()
        leverl1_subscript_iter = iris.iterator("^g1edges")
        result = []
        # Iterate over all nodes forwards
        for level1_subscript, level1_value in leverl1_subscript_iter:
            #Get data from globals
            val = iris.get("^g1edges",level1_subscript)
            element = {"from": int(val.rpartition('-')[0]), "to": int(val.rpartition('-')[2])}
            result.append(element)            
        return result

 

Step4: Use PYVIS Javascript to generate graph data

<script type="text/javascript">
    // initialize global variables.
    var edges;
    var nodes;
    var network;
    var container;
    var options, data;
  
    // This method is responsible for drawing the graph, returns the drawn network
    function drawGraph() {
        var container = document.getElementById('mynetwork');
        let node = JSON.parse('{{ nodes | tojson }}');
        let edge = JSON.parse('{{ edges | tojson }}');
     
        // parsing and collecting nodes and edges from the python
        nodes = new vis.DataSet(node);
        edges = new vis.DataSet(edge);

        // adding nodes and edges to the graph
        data = {nodes: nodes, edges: edges};

        var options = {
            "configure": {
                "enabled": true,
                "filter": [
                "physics","nodes"
            ]
            },
            "nodes": {
                "color": {
                  "border": "rgba(233,180,56,1)",
                  "background": "rgba(252,175,41,1)",
                  "highlight": {
                    "border": "rgba(38,137,233,1)",
                    "background": "rgba(40,138,255,1)"
                  },
                  "hover": {
                    "border": "rgba(42,127,233,1)",
                    "background": "rgba(42,126,255,1)"
                 }
                },

                "font": {
                  "color": "rgba(255,255,255,1)"
                }
              },
            "edges": {
                "color": {
                    "inherit": true
                },
                "smooth": {
                    "enabled": false,
                    "type": "continuous"
                }
            },
            "interaction": {
                "dragNodes": true,
                "hideEdgesOnDrag": false,
                "hideNodesOnDrag": false,
                "navigationButtons": true,
                "hover": true
            },

            "physics": {
                "barnesHut": {
                    "avoidOverlap": 0,
                    "centralGravity": 0.3,
                    "damping": 0.09,
                    "gravitationalConstant": -80000,
                    "springConstant": 0.001,
                    "springLength": 250
                },

                "enabled": true,
                "stabilization": {
                    "enabled": true,
                    "fit": true,
                    "iterations": 1000,
                    "onlyDynamicEdges": false,
                    "updateInterval": 50
                }
            }
        }
        // if this network requires displaying the configure window,
        // put it in its div
        options.configure["container"] = document.getElementById("config");
        network = new vis.Network(container, data, options);
        return network;
    }
    drawGraph();
</script>

 

第五步: 从app.py 主文件调用上面的代码

#Mian route. (index)
@app.route("/")
def index():
    #Establish connection and import data to globals
    irisglobal = IRISGLOBAL()
    irisglobal.import_g1_nodes_edges()
    irisglobal.import_g2_nodes_edges()

    #getting nodes data from globals
    nodes = irisglobal.get_g1nodes()
    #getting edges data from globals
    edges = irisglobal.get_g1edges()

    #To display graph with configuration
    pyvis = True
    return render_template('index.html', nodes = nodes,edges=edges,pyvis=pyvis)    

下面是关于此项目的 介绍视频:

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本文档将向您展示如何开发 REST 接口。您可以将这些 REST 接口与 UI 工具(如 Angular)一起使用,以提供对数据库和互操作性产品的访问。您也可以使用它们支持外部系统访问 InterSystems IRIS®数据平台应用程序。
要浏览所有的技术概要(First Look),包括可以在 InterSystems IRIS 免费的评估实例上执行的那些,请参见 InterSystems First Looks(《InterSystems 技术概要》)。

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· 二月 18, 2022 阅读大约需 6 分钟
SQL语句与数据模式(Select Mode)

在InterSystems IRIS和InterSystems Caché 里,是否您遇到过执行一个SQL Insert/Update语句,明明给的是正确的日期值,但被告知“值‘2022-01-01’ 校验失败”的类似情况,并感到困惑?

如果有,那么您需要了解一下InterSystems IRIS和InterSystems Caché保存和显示数据的模式。



一 数据模式

InterSystems IRIS和InterSystems Caché里,数据有3种模式,称之为SELECT MODE:
逻辑模式:这是数据被保存到InterSystems IRIS和InterSystems Cache'时的格式。例如,%Date类型的数据,在数据库里被保存为一个整数,即从1840年12月31号到这个日期的天数,而不是YYYY-MM-DD的格式。

ODBC模式:这是ODBC对数据定义的格式。在这个模式下,%Date类型的数据就会显示为YYYY-MM-DD的格式。

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· 三月 6, 2021 阅读大约需 16 分钟
第五章 SQL定义表(一)

第五章 SQL定义表

表名称和架构名称

可以通过定义表(使用CREATE TABLE)或通过定义投影到表的持久类来创建表:

  • DDL:InterSystemsIRIS®数据平台使用CREATE TABLE中指定的表名来生成相应的持久类名,并使用指定的架构名来生成相应的包名。
  • 类定义:InterSystemsIRIS®数据平台使用持久类名称来生成对应的表名,并使用包名称来生成对应的模式名。

由于以下原因,这两个名字之间的对应关系可能不相同:

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· 四月 1, 2021 阅读大约需 7 分钟
第十四章 使用SQL Shell界面(三)

第十四章 使用SQL Shell界面(三)

SQL元数据、查询计划和性能指标

显示元数据

SQL Shell支持MMetadata命令以显示有关当前查询的元数据信息。

对于每个结果集项目,此命令列出以下元数据:列名称(SQL字段名称),键入(ODBC数据类型整数代码),PRE(精度或最大长度),比例(最大分数数字),NULL(BOOLEAN:1 = NULL允许,0 =不允许空值),标签(标题标签,请参阅列别名),表(SQL表名称),架构(架构名称),CTYPE(客户端数据类型,请参阅%SQL.statementColumn ClientType属性)。

SHOW STATEMENT

可以执行查询,然后发出show语句或显示st以显示准备好的SQL语句。默认情况下,必须执行查询。可以避免通过设置executemode =延迟执行查询,从而发出查询,然后发出show语句sql shell命令。

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· 一月 5, 2021 阅读大约需 4 分钟
增强型日志监视器

各位开发者们大家好!

此前,我向各位介绍了一个非常好用的运行分析监控面板,它能使消息处理过程中的关键指标可视化,例如入站/出站消息的数量和平均处理时间等。

现在,我想用一项许多人已熟悉的工作流程,来展示一个增强型日志监视器——将警告信息作为Production中的消息来处理。我们可以通过创建路由规则来实现对告警消息的过滤和路由,并运用预先构建的组件(例如电子邮件适配器等)来发送粒度级别的通知。

如你所知,监视和管理警告信息是确保任何应用程序平稳运行的关键。对诸如HealthShare和IRIS医疗版这样支撑医疗系统运转的一级应用程序和集成引擎来说对告警信息的处理更显得尤为重要。

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· 十月 26, 2022 阅读大约需 3 分钟
运行池大小配置的解读

“池大小”(PoolSize)设置的值决定了一个组件的作业的量和启动方式。在这篇文章中我们将具体讨论对于不同类型的组件来说“池大小”设置的可能值和这些值所代表的含义。

Pool Size = 1

对于所有的组件来说,运行池大小为1的含义都是一样的: 该组件有且只有一个作业,单独运行该组件的代码,顺序处理发送到该组件的消息(FIFO)。

Pool Size > 1

对于业务进程(BP)和业务操作(BO)来说,当运行池大小大于1时,该组件将运行多个作业(作业数=运行池大小设置数)。每个作业都只运行该组件的代码,但消息处理的顺序将被打乱。将运行池的大小设为大于1的值可以在一定程度上提升组件处理消息的性能,但是每个作业的性能还是受限于系统资源的,所以并不是说组件的性能可以随着运行池的大小增加而无限提升。

对于轮询类业务服务(Polling BS)来说,当运行池大小大于1时,该服务也将运行多个作业(作业数=运行池大小设置数)。但这种配置会导致多个进程对轮询结果产生竞争(race condition),所以一般情况下轮询服务不应将运行池大小设为大于1的数值。

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· 一月 6, 2023 阅读大约需 8 分钟
《数据二十条》的号角声

国务院于2022年12月19日发布了《中共中央 国务院关于构建数据基础制度更好发挥数据要素作用的意见》(后简称《数据二十条》),如何有效利用数据已经成为下一步的趋势。另一方面,无论是基于数据中台还是数据编织理念,两者也都对如何利用数据提出了构想。因此医疗行业数字化建设的目标已不能再局限于如何收集数据,建立医疗行业数据的流通机制将会是为越来越普遍的需求。

时钟拨回几年前,数据中台概念开始火爆。人们对数据中台的定义、诠释尽管有诸多差异,通过数据中台降低数据共享和利用的成本则是共同的期望。但经过这几年的探索之后,中台已死的观点也在涌现。究其原因,除去中台概念在技术上的不确定,数据流通过程中的责权益的不清晰也是严重的制约因素。毕竟,数据中台自身作为一套技术框架并不能代替法律法规与市场自动将数据转变为商品从而创造出流通价值。

那么,如何能够使数据的流通合规合法,使数据能够如货币和商品一般自由流动,则是我们需要思考和探索的主题,这次《数据二十条》的出现,无疑为医疗信息技术工作者提供了一个明确的思考方向。

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· 八月 19, 2022 阅读大约需 5 分钟
第六章 配置命名空间(一)

第六章 配置命名空间(一)

命名空间是虚拟工作空间中的数据和程序的集合。在命名空间中,可以定义各种组或人员需要的全局变量Global。例如,如果审计部门需要使用存在于不同系统或不同目录中的某些全局变量Global,可以设置一个单一的命名空间来引用网络上的所有会计全局变量和数据库。

IRIS 带有以下预定义的命名空间:

  • %SYS — 系统管理信息和实用程序。
    -USER — 安装时为空。通常用于应用程序开发。

可以在管理门户的命名空间页面上执行以下过程来配置命名空间,可以通过在主页上依次选择系统管理、配置、系统配置和命名空间来导航到该页面:

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挑战一:缺乏一个统一的技术体系?
InterSystems IRIS 医疗版通过统一的数据库、互操作性/中间件、机器学习和FHIR等医疗行业特有的功能来简化开发,开箱即用。

挑战二:需要高性能的解决方案,可以定制适合医疗行业使用的案例
InterSystems IRIS for Health医疗版由医疗行业开发人员创建并为医疗服务服务,具有所需的性能、可扩展性和灵活性,大量的全球、全国大型顶级医院案例。全美排名前20医院,全国客户数百家,百强医院30余家;

挑战三:开源和专有软件缺乏灵活性,无法为医疗行业应用提供高可靠性。
InterSystems IRIS医疗版实现一套平台兼容专有和开源模块,同时开发人员可以选择自己喜欢的开发语言和灵活性,支持多种开发语言(ObjectScript,.net, Java, Sql, 等等)

挑战四:缺乏具有医疗卫生领域专业知识的供应商,也没有为开发人员提供持续的支持。
InterSystems IRIS 医疗版的产品开发能力、屡获殊荣的支持和长期深耕医疗的企业文化,确保开发人员持续成功。

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· 十二月 30, 2021 阅读大约需 7 分钟
用API描述文件创建REST服务

可以使用内嵌REST API用描述文件生成REST服务

请求消息如下:

POST: http://[YourServer]/api/mgmnt/v2/INTEROP/cmAPI

Body: API 描述文件,例如下面的Json文件

Basic Authorization Username: 用户名

Basic Authorization Password: 密码

Content-Type Header: application/json

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