#InterSystems IRIS for Health

0 关注者 · 916 帖子

InterSystems IRIS for Health™ 是全球第一个也是唯一一个专门为医疗应用程序的快速开发而设计的数据平台,用于管理全世界最重要的数据。它包括强大的开箱即用的功能:事务处理和分析、可扩展的医疗保健数据模型、基于 FHIR 的解决方案开发、对医疗保健互操作性标准的支持等等。所有这些将使开发者能够快速实现价值并构建具有突破性的应用程序。了解更多信息

文章 Michael Lei · 八月 1, 2024 4m read

随着 IRIS 中向量数据类型和向量搜索功能的引入,应用程序的开发正在开启一个充满各种可能性的全新世界,其中一个应用程序示例是我最近在巴伦西亚卫生局的一次公开竞赛中看到的应用程序,他们要求提供一种工具,能够使用 AI 模型协助进行 ICD-10 编码。

我们如何实现与所要求的应用程序类似的应用程序? 我们来看看需要什么:

  1. ICD-10 代码列表,我们将使用它作为 RAG 应用程序的上下文,在纯文本中搜索诊断结果。
  2. 经过训练的模型,它会将文本向量化,我们将在其中查找 ICD-10 代码中的对应项。
  3. Python 库,用于对 ICD-10 代码和文本进行摄取和向量化。
  4. 一个支持文本的友好前端,我们会在其中查找可能的诊断结果。
  5. 从前端接收的请求的编排。

IRIS 为我们提供哪些功能来满足上述需求?

  1. CSV 导入,可以使用 RecordMapper 功能,也可以直接使用嵌入式 Python。
  2. 嵌入式 Python 使我们能够实现使用所选模型生成向量所需的 Python 代码。
  3. 发布将从前端应用程序调用的 REST API。
  4. 互操作性生产,以允许在 IRIS 中跟踪信息。

我们只需要看看开发的示例:

d[IA]gnosis

在本文中,您可以访问开发的应用程序,在后续文章中,我们将详细了解如何实现每个功能,包括模型的使用、向量的存储和向量搜索的使用。

0
0 158
文章 姚 鑫 · 七月 30, 2024 3m read

第九章 使用进程私有全局变量来支持非常大的消息

使用进程私有全局变量来支持非常大的消息

默认情况下、 Web 服务在解析请求或响应时通常使用本地数组内存。可以强制它改用进程私有全局变量;这使 Web 服务能够处理非常大的消息。

为此,请指定 Web 服务类的 USEPPGHANDLER 参数,如下所示:

Parameter USEPPGHANDLER = 1;

如果此参数为 1,则 Web 服务在解析请求或响应时始终使用进程私有全局变量。如果此参数为 0,则 Web 服务始终使用本地数组内存来实现这些目的。如果未设置此参数,则 Web 服务使用默认值,通常是本地数组内存。

自定义 Web 服务的回调

可以通过覆盖其回调方法来定制 Web 服务的行为:

OnRequestMessage()

如果没有安全错误,则在 Web 服务收到请求消息时调用;如果出现安全错误,则不会调用此回调。系统在执行安全处理、检查信封是否有错误以及处理 WS-Addressing 标头中指定的操作(如果有)后调用此回调。此回调对于记录原始 SOAP 请求等任务很有用。

此方法具有以下签名:

Method OnRequestMessage(mode As %String, action As %String, request As %Stream.Object)

其中:

  • mode 指定 SOAP 请求的类型。
0
0 105
文章 姚 鑫 · 七月 25, 2024 2m read

第四章 覆盖 HTTP SOAP 操作和请求消息名称

覆盖 HTTP SOAP 操作和请求消息名称

当通过 HTTP 调用 Web 方法时,HTTP 标头必须包含 SOAP 操作,该操作是指示 SOAP HTTP 请求意图的 URI。对于 SOAP 1.1SOAP 操作作为 SOAPAction HTTP 标头包含在内。对于 SOAP 1.2,它包含在 Content-Type HTTP 标头中。

SOAP 操作指示 SOAP HTTP 请求的意图。该值是一个标识意图的 URI;它通常用于路由入站 SOAP 消息。例如,防火墙可以使用此标头适当地过滤 HTTP 中的 SOAP 请求消息。

对于 Web 服务中的 Web 方法,SOAPAction HTTP 标头默认具有以下形式(对于 SOAP 1.1):

SOAPAction: NAMESPACE/Package.Class.Method

其中 NAMESPACEWeb 服务的 NAMESPACE 参数的值,Package.Class.Method 是用作 Web 方法的方法的名称。例如:

SOAPAction: http://www.myapp.org/GSOAP.WebService.GetPerson

要覆盖此设置,请在 Web 方法的定义中为 SoapAction 方法关键字指定一个值。

0
0 193
文章 Michael Lei · 七月 25, 2024 1m read

InterSystems 常见问题FAQ 

要编译包含映射修饰符的类rountine,请指定编译器修饰符“/mapped=1”或“/mapped”。例如,执行以下操作:

[示例 1] 获取类列表并编译

 do $System.OBJ.GetClassList(.list,"/mapped")
 // build your classes starting from .list
 do $System.OBJ.Compile(.list) 

[示例 2] 编译所有类 

 do $system.OBJ.CompileAll("/mapped") 
0
0 145
文章 Michael Lei · 七月 18, 2024 2m read

InterSystems 常见问题系列

使用 ErrorList 查询 SYS.ApplicationError 类.

  • 注 1: 在 %SYS 命名空间中运行.
  • 注 2: 这是个非存储的utility, 所以我们用 %ResultSet 类而不用 %SQL.Statement.

执行命令的例子如下.

USER>set $namespace="%SYS"   //equal to zn "%SYS"
%SYS>set rset=##class(%ResultSet).%New()

%SYS>set rset.ClassName="SYS.ApplicationError"
%SYS>set rset.QueryName="ErrorList"
// The first argument of the query is the namespace name, the second argument is the date (in MM/DD/YYYY format).
%SYS>do rset.Execute("USER","08/17/2020")

// To display the results on the screen, execute the %Display() method.
%SYS>do rset.
0
0 178
文章 Michael Lei · 七月 18, 2024 1m read

InterSystems 常见问题系列

可以通过 TRY-CATCH 来完成:

 #dim ex As %Exception.AbstractException
 TRY {
    //Code that causes an error
  }
  CATCH ex {
     do ex.Log()
  }

如果用了 ^%ETN, 从BACK 接入点 (BACK^%ETN)处调用.

请参考另外一篇文章: 如何使用命令获得应用错误 (^ERRORS)

0
0 179
文章 Jingwei Wang · 八月 30, 2022 3m read

InterSystems IRIS 允许从任何符合DB-API的Python应用程序对InterSystems IRIS 进行快速、无缝地访问。Python DB-API驱动是对PEP 249 v2.0(Python数据库API规范 v2.0)的完整兼容。

步骤

  1. 前提是要有一个Python的开发环境。
    本示例使用vs code 如下所示创建一个dbapi.py文件。
    dbapi.py :
    # Embedded Python examples from summer 2022
    import iris as dbapi
    ​
    mytable = "mypydbapi.test_things"
    conn = dbapi.connect(hostname='localhost', port=1972, namespace='IRISAPP', username='superuser', password='iris')
    ​
    # Create table
    cursor = conn.cursor()
    try:
     cursor.
1
0 414
文章 Yongfeng Hou · 十一月 23, 2023 3m read

        IRISHealth以其完备且系统化的安全特性在医疗行业的数据库中独树一帜,这些特性包括安全认证、安全授权、安全审计、数据加密以及安全配置。其中数据传输无疑是其中最重要的一环。为此,IRISHealth采用了SSL/TLS技术来对传输的数据进行加密,有效保障了从IRIS数据平台的超级服务数据传输、Telnet服务数据传输、java/.net/Studio客户端的访问数据传输、MIRROR与DB的数据传输,到DBServer和ECPApp之间的数据传输的安全性。


        本文是在两个IRISHealth2021实例之间进行ECP服务通信的示例,一个作为DBServer,一个作为ECPApp,两个实例之间通过使用SSL/TLS的ECP协议进行TCP的加密传输通信。

1.IRIS的DB和ECP环境:




DBServer

ECPApp

10.1.30.231 10.1.30.232

2. CA证书的环境:




CA根服务器 

DBServer

ECPApp

10.1.30.231 10.1.30.231 10.1.30.232
CARoot.cer DataSever.cer ECPApp.cer
CARoot.key DataSever.key ECPApp.
5
3 441
文章 Michael Lei · 七月 11, 2024 1m read

在当今充满活力的医疗保健行业,获取全面、精简的医疗记录对于做出明智的决策至关重要。人工智能驱动的健康图表应用程序是一个开创性的解决方案,旨在为医生提供一种获取和理解健康数据的有效方式。

主要功能

- 全面的数据检索: 健康图表应用程序通过提取各种健康数据,包括过敏症、病情、手术、免疫接种、药物、家族史、社会史、生命体征和化验结果,超越了传统记录。这种全面的视角可以让人们深入了解患者的健康历程。

- 通过人工智能增强洞察力:通过利用人工智能的力量,Health Chart 应用程序可以智能处理数据。人工智能引擎将原始信息转化为可操作的洞察,生成健康摘要和风险评估。这不仅节省了医生的宝贵时间,还提高了患者护理质量。

公司介绍:https://www.prairiebyte.com

软件试用

目标使用者--临床医生

类别--护理协调, 数据可视化, 疾病管理/基层医疗

应用程序类型--SMART ON FHIR应用程序

FHIR 版本--R4

支持的电子病历系统--Cerner、Epic等支持FHIR API的软件系统

0
0 258
文章 Michael Lei · 七月 9, 2024 1m read

Abstractive Health是一款医生人工智能助手,可帮助医生创建最佳病历。我们直接与国家 HIE 和 EHR 集成。我们的医疗摘要可用于门诊、住院和急诊护理,实现临床笔记的自动化,如 SOAP 笔记、进展笔记、护理过渡、ED Provider 笔记和出院摘要。我们使用生成式人工智能和 LLM 来压缩数百页的医疗笔记,从而节省您的时间,让您可以专注于病人护理。

公司介绍:https://www.abstractivehealth.com

软件试用

目标使用者--临床医生

类别--护理协调, 数据可视化, 人口健康

应用程序类型--SMART ON FHIR应用程序

FHIR 版本--R4

支持的电子病历系统--Allscripts、Athena Health、Cerner、Epic等支持FHIR API的软件系统

安全和隐私政策: https://www.abstractivehealth.com/security-and-privacy

0
0 171
文章 Michael Lei · 七月 7, 2024 1m read

InterSystems 常见问题系列FAQ

如果要让超时功能失效, 在DSN设置查询超时为disabled:

Windows Control Panel > Administrative Tools > Data Sources (ODBC) > System DSN configuration

如果勾选了Disable query timeout , 超时就会失效.

如果想在应用侧修改,你可以在ODBC API 层设置:在连接数据源之前,调用ODBC SQLSetStmtAttr功能设置SQL_ATTR_QUERY_TIMEOUT 属性 

0
0 321
文章 Michael Lei · 七月 7, 2024 1m read

InterSystems 常见问题FAQ

如果您想在InterSystems 产品启动时执行一个操作系统可执行文件,命令或者程序,可以在SYSTEM^%ZSTART routine里面写明流程 ( %ZSTART routine在 %SYS 命名空间里面创建).

在 SYSTEM^%ZSTART 里面写代码之前, 请确保他可以在任何情况下能正常工作

如果 ^%ZSTART routine 写的不对,或者没有响应或者发生错误,InterSystems 产品可能会无法启动。

更多信息,请参考一下文档。

About writing %ZSTART and %ZSTOP routines [IRIS]
About writing %ZSTART and %ZSTOP routines

0
0 144
文章 Michael Lei · 七月 7, 2024 4m read

InterSystems  常见问题系列FAQ

InterSystems 产品里数据 (表、对象、实例数据) 是存在global 变量里的。
每个global 的数据大小可以从管理门户中中点击属性查看Management Portal > System > Configuration > Local Database > Globals page, 然后在global 属性页点击计算大小Calculate Size 按钮。
你可以在终端上调用^%GSIZE 来在命名空间里显示数据大小,方法如下.

USER>do ^%GSIZE
 
Directory name: c:\intersystems\ensemble\mgr\user\ =>
All Globals? No => Yes
^DeepSee.ActiveTasks contains no data
Include it anyway? No => Y
Include any other similar globals without asking again? Yes =>
^DeepSee.ActiveTasks contains no data
Include it anyway? No => Yes
Include any other similar globals without asking again?
0
0 250
文章 Michael Lei · 七月 7, 2024 2m read

InterSystems 常见问题系列FAQ

流程如下

1. 上传到 FTP server

 set tmpfile="c:\temp\test.jpg"
 set ftp=##class(%Net.FtpSession).%New() 
 // connect to FTP server
 do ftp.Connect("","<username>","<password>")
 // set transfer mode to BINARY
 do ftp.Binary()
 // Move to the directory to upload
 do ftp.SetDirectory("/temp/upload")
 // Prepare a stream of files to upload  
 set file=##class(%File).%New(tmpfile)
 do file.Open("UK\BIN\")
 // upload file
 // 1st argument: File name to create at upload destination
 // 2nd argument: File stream to upload
 do ftp.Store("test.jpg",file)
 // Logout from ftp server
 do ftp.
0
0 153
文章 Jeff Liu · 六月 30, 2024 7m read
Purpose of this article

有两篇很棒的有关删除消息关联的孤儿记录的内容以及如何处理孤儿的问题的WRC议最佳实践文章Ensemble Orphaned Messages | InterSystems Developer Community | Best DeleteHelper - A Class to Help with Deleting Referenced Persistent Classes (intersystems.com)
本文并不是要取代 Intersystems 专业人员撰写的这些文章,而是要在此基础上介绍我们如何利用这些信息和其他讨论(包括我们实际清理这些数据的方法)来帮助我们的数据库变得更加紧凑。

情况说明:

我们的备份越来越多。年初的时候,我们遇到过一台服务器被强制故障的情况,需要进行还原。由于数据库庞大,即使复制这个数据库也需要很长时间,更不用说还原重建shadow服务器了。因此,我们不得不决定最终解决这一增长问题。最初的原因已经确定 

  1. 开箱即用的任务或者在某些时候假定已运行,但没有勾选信息体。这是因为在查询其中一个消息体时,我们得到了来自 10 多年前的 ID 1。该任务是最佳实践中提到的默认 Ens.Util.Tasks.Purge。这就引出了流程中的提示 1 

理解你的数据

您在数据库中存储了哪些数据?您是否有必须保存在记录表中的数据?

0
0 268
公告 Claire Zheng · 六月 3, 2024
SUTA培训作为专业的InterSystems技术学习平台之一,汇聚了权威技术专家与值得探讨的技术主题,内容涵盖了InterSystems数据平台基础管理运维的技能和知识。通过SUTA培训,新客户能够系统学习管理运维工作的整体架构和基础概念,老客户可以更深入、全面地加强对管理运维工作的理解和提升。

InterSystems 2024 SUTA培训现已启动,欢迎参加!

  • 如果您是首次参加SUTA培训,请点击此处 或 扫描下图左侧的二维码注册报名。报名信息需经过审核,请您耐心等待。审核通过的用户,点击此处 或 扫描下图右侧的二维码,使用报名时填写的手机号码登录查看课程。
  • 如果您曾报名参加过2022年、2023年的SUTA培训,无需重复注册报名。点击此处 或 扫描下图右侧的二维码,使用报名时填写的手机号码登录查看课程。

建议通过电脑端参加培训,点击进入直播间






0
0 243
InterSystems 官方 Claire Zheng · 五月 30, 2024

从发布InterSystems IRIS®数据平台2022.3开始,InterSystems修改了许可证强制执行机制,以包括REST和SOAP请求。由于这种变化,在升级后,使用REST或SOAP的非处理器核数的许可证环境下,用户可能会遇到更高的许可证消耗。要确定此警报是否适用于您的InterSystems许可证,请按照下面链接的FAQ中的说明进行操作。

下表总结了强制执行变更情况:







产品

许可证强制执行中是否包含REST & SOAP 请求?

InterSystems Caché®

InterSystems Ensemble®

InterSystems IRIS, InterSystems IRIS® for Health, and Health Connect prior to 2022.3

InterSystems IRIS, InterSystems IRIS for Health, and Health Connect 2022.3 and later

客户要求在Caché和IRIS之间实现许可证强制执行的一致性。

1
0 189
公告 Claire Zheng · 五月 20, 2024

为推动《“十四五”全民健康信息化规划》全面实施,充分发挥国家医疗健康信息互联互通标准化成熟度评测工作对区域医疗信息交换促进作用,为医疗数据合规高效流通使用奠定坚实基础。《中国卫生信息管理杂志》社主办、深圳市卫生健康信息协会协办、InterSystems中国承办的区域信息互联互通新发展研讨会于5月11日在深圳举办。

国家卫生健康委统计信息中心胡建平副主任线上参会并致辞、广东省卫生健康委员会事务中心傅承主副主任、深圳市卫生健康信息协会林德南会长参加会议并致辞。胡建平副主任在视频致辞中强调了医疗健康信息互联互通标准化成熟度测评对区域全民健康信息化和智慧医院建设起到的重要作用,总结了互联互通标准化成熟度测评主要开展的四方面工作,指出下一步工作要从网络通、应用通、数据通等三个维度持续发力,通过叠加区块链等信息技术,实现互联互通从1.0阶段向2.0阶段跃迁,赋能卫生健康事业高质量发展。

查看精彩内容回放:欢迎扫描下图中的二维码或点击此处如果您已报名过此次会议,使用报名时的手机号码即可登录查看,如首次登录,需填写报名信息后查看

0
0 140
InterSystems 官方 Claire Zheng · 五月 15, 2024

InterSystems 很高兴地宣布现已推出:

  • InterSystems IRIS Data Platform 2024.1.0.267.2
  • InterSystems IRIS for Health 2024.1.0.267.2
  • HealthShare Health Connect 2024.1.0.267.2

该版本新增了对 Ubuntu 24.04 操作系统的支持。Ubuntu 24.04 包括 Linux 内核 6.8、安全性改进以及安装程序和用户界面改进。 InterSystems IRIS IntegratedML 在 Ubuntu 24.04 上尚不可用。

此外,该版本还解决了所有平台的两个缺陷:

  • 修复了某些使用 "NOT %INLIST "的 SQL 查询返回错误结果的问题。我们以前曾就此错误发出过警告
  • 修正了某些特定情况下堆栈跟踪不完整的问题。

如何获取软件

与往常一样,Extended Maintenance (EM) 版本附带适用于所有支持平台的经典安装包,以及 Docker 容器格式的容器镜像。有关完整列表,请参阅 "受支持的平台 "页面。

经典安装包

安装包可从 WRC 的 "Extended Maintenance Releases"页面获取。此外,还可在Evaluation Services上找到安装包。

0
0 153
文章 Qiao Peng · 五月 25, 2022 1m read

%SYS.Journal.Record 类有一个查询(query), List, 可以列出Journal文件中记录的数据修改历史。例如,要查询谁对global节点^QP(1,2)做过修改,可以使用如下代码。它查询Journal文件(输入参数pFilePath)中的global节点(输入参数pSearchGlobal)的操作:

ClassMethod SearchGlobal(pSearchGlobal = "^QP(1,2)", pFilePath = "C:\InterSystems\IRISHealth\mgr\journal\20220525.003")
{
	Set tRS = ##class(%ResultSet).%New("%SYS.Journal.Record:List")
	Set tSC = tRS.Execute(pFilePath)

	While (tRS.Next()) 
	{
		Set address = tRS.Data("Address")
		Set globalNode = tRS.Data("GlobalNode")
		Set newValue = tRS.Data("NewValue")
		Set type = tRS.Data("TypeName")
		Set processid = tRS.
1
2 433
问题 deng hang · 三月 26, 2024

大家好:我编写一个简单的连接rabbitmq的测试代码;代码如下:

/// w ##class(Quality.TestMQTT).TestRabbitmq()
ClassMethod TestRabbitmq() As %Status [ Language = objectscript ]
{
Set jgw=$system.external.getJavaGateway()
;write jgw.new("java.util.Date").toString() ,!
set settings = ##class(%External.Messaging.RabbitMQSettings).%New()
set settings.host = "10.32.25.141"
set settings.port = 5672
set settings.virtualHost = "/"
set settings.username = "1892"
set settings.keyPassword = "123456"
set settingString = settings.ToJSON()
#dim client As %External.Messaging.RabbitMQClient
set client = ##class(%External.Messaging.Client).

1
0 157
InterSystems 官方 Claire Zheng · 四月 24, 2024

InterSystems IRIS、IRIS for Health和HealthShare HealthConnect的维护版本2022.1.5 & 2023.1.4现已发布

InterSystems IRISInterSystems IRIS for Health 和 HealthShare Health Connect 的两个扩展维护版本现已发布。

2022.1.5

2022.1.5 版提供此前发布的任一 2022.1.x 版中的Bug修复。

您可以在以下页面找到详细的变更列表和升级清单:

2023.1.4

2023.1.4 版提供此前发布的任一2023.1.x 版中的Bug修复。

您可以在以下页面找到详细的变更列表和升级清单:

如何获得该软件

该软件以经典安装包和容器映像两种形式提供。有关可用安装程序和容器映像的完整列表,请参阅 Supported Platforms webpage.

0
0 165
文章 Louis Lu · 四月 23, 2024 2m read

当我们在设计一个需要重复使用的BP时候,往往需要开发一个可配置<call>的对象的组件,我们将call的target 设置为

@process.TargetConfigName

即可实现。

下面是完整代码:

Property TargetConfigName As Ens.DataType.ConfigName;Parameter
SETTINGS = "TargetConfigName:Basic";
/// BPL Definition
XData BPL [ XMLNamespace = "http://www.intersystems.com/bpl" ]
{
<process language='objectscript' request='Ens.Request' response='Ens.Response' height='2000' width='2000' >
<sequence xend='200' yend='450' >
<call name='Call configurable target' target='@process.TargetConfigName' async='1' xpos='200' ypos='250' >
<request type='Ens.
0
0 137
文章 Jeff Liu · 四月 1, 2024 1m read

此视频帮助大家了解InterSystems如何帮助CRO来加快临床数据采集和更快地推广市场。

演讲嘉宾:

Jim Coutcher, Senior Director/Principal, Global Head of Enriched Studies, Real World Solutions, IQVIA
Qi Li, Physician Executive, InterSystems
Matt Stannard, life Sciences Advisor, InterSystems

欢迎大家来我们的 Bilibili主页观看更多视频!

0
0 244