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关注FHIR的大侠们估计都注意到了,FHIR更新了它支持的互操作范式,除了消息、文档、服务、API这4种,增加了2个:资源仓库、订阅。前面4个好理解,为什么资源仓库和订阅会成为FHIR的新的互操作范式?互操作与应用集成是什么关系?
这里借FHIR的新互操作范式,聊聊应用集成,看看集成平台是什么?有什么样的集成方案?以及怎么评价不同的方案。
InterSystems IRIS for Health™ 是全球第一个也是唯一一个专门为医疗应用程序的快速开发而设计的数据平台,用于管理全世界最重要的数据。它包括强大的开箱即用的功能:事务处理和分析、可扩展的医疗保健数据模型、基于 FHIR 的解决方案开发、对医疗保健互操作性标准的支持等等。所有这些将使开发者能够快速实现价值并构建具有突破性的应用程序。了解更多信息。
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关注FHIR的大侠们估计都注意到了,FHIR更新了它支持的互操作范式,除了消息、文档、服务、API这4种,增加了2个:资源仓库、订阅。前面4个好理解,为什么资源仓库和订阅会成为FHIR的新的互操作范式?互操作与应用集成是什么关系?
这里借FHIR的新互操作范式,聊聊应用集成,看看集成平台是什么?有什么样的集成方案?以及怎么评价不同的方案。
在数字化转型成为国家战略和国内外科技大厂的成功经验、强大的宣传攻势和推广能力联合左右下,微服务架构(Microservices Architecture,MSA)毫无疑问已经成为当今基础架构的主流话题,短短几年间席卷全行业,仿佛成了每个行业数字化转型的必由之路。
在虚拟化环境中使用镜像,构成镜像的InterSystems IRIS实例被安装在虚拟主机上,创造了一个混合的高可用性解决方案,将镜像的优点与虚拟化的优点结合起来。镜像通过自动故障切换对计划内或计划外的故障提供即时响应,而虚拟化HA软件在计划外的机器或操作系统故障后自动重新启动承载镜像成员的虚拟机。这允许失败的成员迅速重新加入镜像,充当备份(或在必要时作为主机)。
当镜像被配置在虚拟化环境中时,请参考以下建议:
在创建虚拟机快照时,虚拟机需要短时间的冻结,这个短时间冻结通常指虚拟机静默,在静默过程中网络连接处于中断状态。由于数据库的不断增长,使用VMWare快照的方式对虚拟机进行备份的时长也会不断增加,当对虚拟机进行快照的时长长于InterSystems镜像服务质量 (QoS) 超时时间,即当主机网络中断超过QoS超时时间,仲裁机与备机观察并相互确认与主机的连接丢失后,将发起切换过程,使原备机成为主机并将虚拟IP从主机MAC地址解绑后重绑定到备机的MAC地址上。特别需要注意的是,在这种由于网络中断引起的切换中,仲裁与备机都无法得知主机的实际工作状态。因此,在主机网络连接恢复后,为了为了避免因切换期间主机还在处理数据导致主备机间数据不一致,备机主动发起请求让主机下线,关闭主机,此时主机状态显示为关闭(Down)。
此篇文章给大家介绍一个使用pyodbc连接到 InterSystems IRIS数据库的示例,详情如下:
InterSystems IRIS 安装在Redhat 操作系统中,使用pyodbc在Mac操作系统中连接到Redhat 操作系统中InterSystems IRIS数据库。
pip install pyodbc
brew update
brew install unixodbc
odbcinst -i -d -f pyodbc_wheel/mac/odbcinst.ini
pyodbc_wheel/mac/odbcinst.iniodbcinst -i -s -h -f odbc.ini_unixODBCtemplate
odbcinst -i -s -l -f pyodbc_wheel/mac/odbcinst.
步骤:
pip install intersystems_irispython-3.2.0-py3-none-any.whl
import iris
def main():
connection_string = "localhost:1972/USER"
username = "SQLAdmin"
password = "deployment-password"
connection = iris.connect(connection_string, username, password)
# when finished, use the line below to close the connection
# connection.
步骤:
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using System;
using InterSystems.Data.连接前准备:
步骤:
#ifdef WIN32
#include <windows.h>
#endif
#include <sqlext.h>
#ifdef UNICODE
#include <sqlucode.h>
#endif
#include <stdio.连接前准备:
步骤:
import com.intersystems.jdbc*;
import java.sql.Connection;
public class JDBCConnection{
public static void main (String[] args) throws Exception {
String dbUrl = "jdbc:IRIS://127.0.0.1:1972/User"; //replace
String user = "SQLAdmin";
String pass = "deployment-password";
IRISDataSource ds = new IRISDataSource();
ds.setURL(dbUrl);
ds.setUser(user);
ds.如果你读了我之前介绍QEWD微服务的文章,希望你会渴望了解如何使用它们。 所以在这篇文章中,我将解释你需要知道的东西,以便开始使用。
如果你在QEWD资源库中,你会发现目录:
https://github.com/robtweed/qewd/blob/master/example/jwt
在我之前关于JSON网络令牌(JWTs)和QEWD的文章中,我用这个示例应用程序来解释如何使用JWTs。 这个示例应用程序还演示了如何设置一个简单的微服务,在这种情况下是一个处理用户认证的服务。 所以,现在让我深入了解一下这个例子应用程序的这方面内容。
如果你想使用QEWD微服务,你也必须使用JWTs--它们提供了一种方法,用户的认证和会话可以被多个独立的QEWD服务器交叉通信和处理。 因此,请看一下启动文件:
https://github.com/robtweed/qewd/blob/master/example/jwt/startup_file/q….
这种情况先抽查这些消息所处的会话中是否有未完成操作周期的消息(状态为除“Completed”“Error”“Discarded”之外的状态)。如有,且定期清除任务配置了“KeepIntegrity”,且该环境并不需要保留这些消息,可通过关闭清除任务中的“KeepIntegrity”配置清除这些会话和包含的消息。如果有这类消息,但是定期清除任务未配置“KeepIntegrity”,可能是定期清除任务的逻辑或消息数据问题导致清楚任务查找的时候没有覆盖这些消息,请联系WRC帮助排查具体原因。
有关定期清除任务的更多信息请参见文档
Purging Production Data | Managing Productions | InterSystems IRIS for Health 2022.1
这种情况需要具体排查每个较大的global。可能有以下原因:
系统文件根据版本不同,大约会占用1GB左右的空间。这部分空间是不能省略的,随意删除文件会导致实例无法正常运行。
备份文件应及时转存到另外的磁盘或磁盘分区上,不应与.DAT数据库占用相同的磁盘分区。
Journal日志文件存储路径应设置为与.DAT数据库存储路径不同的磁盘或磁盘分区上,不应与.DAT数据库占用相同的磁盘分区。
因为HSHC集成平台设计上不支持过多的消息存储,用户应该为每个有消息流量的命名空间配置定期消息清除任务。
定义消息清除任务时 “BodiesToo”默认是没有选择的,需要手动选择。系联软件研发核心认为我们的软件不能在客户不知情的情况下自动删除客户自定义的数据,消息也属于客户自定义的数据,所以默认选项只会删除Message Header,不会删除消息本身。但是保留默认值运行清除消息任务就会导致孤立消息(指不存在配套Message Header的消息对象)的问题。BodiesToo=0也是孤立消息产生的主要原因之一。有关孤立消息的常见问题会在之后的文章做进一步讨论。
另一个消息清除任务选项“KeepIntegrity”默认是打开的。如果您需要保留“Queued”,“Suspended”,“Deferred”等未完成所有操作的消息,请保持打开。如果不需要可以关闭。
医疗科技市场正处于强劲的演变之中。Gartner的医疗科技的波浪图展示了这些技术是什么,非常好地反映了医疗行业的数字化趋势。
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其中很多技术都可以使用InterSystems的技术(ISC Health Tech)来实现:
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知情同意管理使用InterSystems Healthshare Stack来做患者主索引和知情同意管理。
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//迭代取值
IRISIterator subscriptIter = irisNative.getIRISIterator("^liubo.clazz.personD");
System.out.println("================迭代开始===================");
while (subscriptIter.hasNext()) {
String subscript = subscriptIter.next();
//此处怎么获取此节点的字符串进行解析呢,另外java可以直接访问ensemble的global么
System.out.println(node);
}任何技术总是有些自己独特的术语,尤其是一些英文术语,对于新的用户来说往往即陌生又迷惑。这里整理了一下常听到的InterSystems术语,帮助大家尽快进入InterSystems技术圈子。
| 名词 | 说明 |
|---|---|
| Arbiter | 仲裁器。用于在mirror高可用集群里辅助判断主备机成员状态,提高高可用集群的有效性 |
| Atelier | InterSystems开发的基于Eclipse的IDE,可以单独部署、也可以嵌入Eclipse |
| bitmap索引 | 位图索引。以位图方式保存的枚举类型数据的索引,用于高性能查询 |
| bitslice索引 | 位片索引。用位图方式对数值型数据建立的索引,用于高性能查询 |
| Buttons | Cache'数据库上的诊断报告工具。历史上,InterSystems曾经提供一个routine,名为^Buttons,用于收集系统数据用于诊断。虽然后来这个工具已经被放在%SYS.Task.DiagnosticReport类中,但大家还是习惯称之为buttons |
| cconsole log | Cache'数据库的控制台日志文件,记录通用信息、系统错误、特定操作系统错误、网络错误等。 |
在Windows中,InterSystems IRIS 会将Python引擎一起安装在安装目录中,可以将Python的代码在InterSystems IRIS内核中运行,允许Python代码与ObjectScript代码混合运行,以获得最佳开发性能。一般基于UNIX的操作系统会自带一个Python,所以不会随InterSystems IRIS安装包自动安装Python引擎。
在InterSystems IRIS 2021.2 以上的版本中才支持Embedded Python,其余版本不支持使用Embedded Python
2022年9月9日,我们将举办线上“InterSystems 2022全球峰会亮点解读”,点击此处参会。
我很高兴与大家分享我第一次使用docker容器版本的IRIS for Health的经验,以探索你对使用或试用的兴趣,利用docker容器的优势,它是轻量级的,易于部署。本文将通过使用Renan Lourenco编写的名为ENSDEMO的GitHub仓库的实施步骤。
设置IRIS for Health社区版docker容器环境的步骤:
docker pull containers.intersystems.com/intersystems/irishealth-community:2022.2.0.304.0
git clone https://github.com/OneLastTry/irishealth-ensdemo
docker-compose build
docker-compose up -d
在我最初的尝试中,我无法下载irishealth community:2022.2.0.304.0的确切版本,因为它在ENSDEMO的最初发布中已经发生了变化。修复方法是,当试图从InterSystems容器注册表拉出docker镜像时,在注册表中拉出最新的可用标签。
大多数网站都有一个 "Fav.ico "文件,用于设置网页的图标。大多数用户有多个环境,开发、测试和生产环境。通常情况下,你很难一眼就看出你在哪个环境中。如果能直观地通过图标看到你所处的版本和环境,可以提供更好的用户体验。在这个例子中,所有的实例都被命名为 "ENSEMBLE"。注意,这是在2022.1上使用的IRIS FOR HEALTH。
默认图标是 IR
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在这篇文章中,我们将把标识改为类似于以下的内容:
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图标文件安装在你的安装文件夹csp/broker/portal中
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5. 采取铅笔工具。清除任何旧的字母(提示:改变铅笔大小可以更容易操作)。
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6. Click test. Set colour. Play around with the font. DON'T FORGET TO PRESS APPLY
7. 保存图标.
8.
2022年8月22日,中国 北京 —— 致力于帮助客户解决最关键的可扩展性、互操作性和速度问题的创新数据技术提供商InterSystems今日宣布在中国推出InterSystems IRIS医疗版互联互通套件2.0版,更好地满足用户对数据利用的需求。
命名空间是虚拟工作空间中的数据和程序的集合。在命名空间中,可以定义各种组或人员需要的全局变量Global。例如,如果审计部门需要使用存在于不同系统或不同目录中的某些全局变量Global,可以设置一个单一的命名空间来引用网络上的所有会计全局变量和数据库。
IRIS 带有以下预定义的命名空间:
%SYS — 系统管理信息和实用程序。
-USER — 安装时为空。通常用于应用程序开发。可以在管理门户的命名空间页面上执行以下过程来配置命名空间,可以通过在主页上依次选择系统管理、配置、系统配置和命名空间来导航到该页面:
注意:上面列出的主题描述了使用管理门户手动配置命名空间的过程。 IRIS 还包含对自动化命名空间配置有用的编程工具。可以在新选项卡类中使用 Config.Namespaces 来创建和配置命名空间。
配置命名空间的另一种方法是将 CreateNamespace、ModifyNamespace 或 DeleteNamespace 操作与配置合并结合使用。配置合并允许通过应用声明性合并文件来自定义 IRIS 实例,该文件指定要应用于该实例的设置和操作。
单个 IRIS 实例中命名空间数量的绝对限制为 2048。命名空间表的大小是自动的且不可配置。
IRIS 将系统范围的配置信息存储在称为配置参数文件 (CPF) 的文件中。该文件是一个重要工具,因为它包含IRIS 实例的大部分可配置设置。每个实例都部署了一个默认 CPF,它位于安装目录中。可以直接在文本编辑器中修改 CPF,也可以从管理门户或终端间接修改。在 UNIX® 和 Linux 上,还可以通过指定配置合并文件在部署期间自定义 CPF IRIS 使用该文件在实例首次启动之前更新默认 CPF。
对于任何新安装的实例,必须更改几个启动设置,以及应该查看的其他设置。本节讨论最初要考虑的这些设置:
当第一次安装 IRIS 时,应该查看和调整内存分配以及其他配置设置。在确定 IRIS 实例使用内存的方式时,必须采取三个主要操作,如下所示:
使用内存和启动页面(系统管理 > 配置 > 系统配置 > 内存和启动)为数据库和例程缓存分配内存。
设置 IRIS 进程可以使用的最大内存
配置通用内存堆(也称为共享内存堆)的大小,这决定了 IRIS 可用于例程和数据库缓存之外的其他用途的内存;
重要提示:首次安装 IRIS 时,数据库和例程缓存内存分配设置为自动,在此情况下, IRIS 为数据库缓存(全局缓冲区)分配总物理内存的 25%。
此设置不适用于生产用途。
嗨社区,
这篇文章公开介绍我的 iris-fhir-client 客户端应用。
iris-fhir-client 可以可以借助嵌入式 python 连接到任何开放的 FHIR 服务器 fhirpy 图书馆.
通过终端和使用 CSP Web 应用程序获取资源信息。
Hi 社区,
本文将演示如何使用 iris-fhir-client 客户端应用程序创建患者和患者观察资源。
建议在开始阅读本文之前可以先读一下我的 第一篇 关于这个应用程序的文章和观看 Youtube 视频。
让我们开始吧:
Production是开发者基于InterSystems IRIS产品家族实现互操作功能的主要技术架构。而每个Production的运行依赖于三类主要的业务组件:
三类组件间以消息作为信息交换的主要媒介。因此,要保障互操作业务的稳定运行,除保障软件平台有充足的软硬件资源运行外,保障Production中消息的高效传输以及三类组件的平稳、高效运行则是运维团队面临的主要目标。下面列举的若干项任务则有助于运维团队实现这些目标:
Production中的业务组件都有运行池的概念,允许业务组件运行在多个进程上并发工作以提高整体性能。运行池又可以分为私有池和参与者池两类。
InterSystems 数据平台的互操作功能与久经考验的Ensemble和HealthConnect集成引擎产品一脉相承。事实上,使用IRIS的典型客户不但应用了IRIS提供的多模型数据存储、分布式存储等数据存储特性,也广泛地应用如可视化数据转换,可视化数据流程编辑和可视化规则引擎等一系列互操作能力构建异构系统间或组织机构间的数据流程。
那么,在生产环境上,如何监控与评估数据流程的运行状况,在发生问题时如何快速定位并解决故障,就是用户的运维团队需要考虑的问题。
本系列文章将围绕IRIS互操作功能中核心的互操作消息管理,Production管理与优化及互操作告警与通知三个方面介绍互操作功能的运维基础知识和常用技巧,希望能够帮助客户平稳、高效地运用数据平台。
注:本文提到的InterSystems数据平台,包括Caché数据库、Ensemble集成平台、HealthConnect医疗版集成平台和InterSystems IRIS数据平台。
消息是互操作功能中各组件间通信的基本方法,在互操作Production业务服务、业务流程和业务操作之间广泛使用。
除承担信息传递的基本功能外,由于常常需要在生产环境中查看消息内容或重发消息以解决问题,消息检索就是大家最常用到的功能,而IRIS特有的结构化消息存储也为开发和运维团队使用和管理消息创造了便利。
下面是一个ObjectScript片段,它允许为InterSystems IRIS创建数据库、命名空间和Web应用程序:
set currentNS = $namespace
zn "%SYS"
write "Create DB ...",!
set dbName="testDB"
set dbProperties("Directory") = "/InterSystems/IRIS/mgr/testDB"
set status=##Class(Config.Databases).Create(dbName,.dbProperties)
write:'status $system.Status.DisplayError(status)
write "DB """_dbName_""" was created!",!!
write "Create namespace ...",!
set nsName="testNS"
//DB for globals
set nsProperties("Globals") = dbName
//DB for routines
set nsProperties("Routines") = dbName
set status=##Class(Config.Namespaces).Create(nsName,.nsProperties)
write:'status $system.Status.DisplayError(status)
write "Namespace """_nsName_""" was created!",!!
write "Create web application ...",!
set webName = "/csp/testApplication"
set webProperties("NameSpace") = nsName
set webProperties("Enabled") = $$$YES
set webProperties("IsNameSpaceDefault") = $$$YES
set webProperties("CSPZENEnabled") = $$$YES
set webProperties("DeepSeeEnabled") = $$$YES
set webProperties("AutheEnabled") = $$$AutheCache
set status = ##class(Security.Applications).Create(webName, .webProperties)
write:'status $system.Status.DisplayError(status)
write "Web application """webName""" was created!",!
zn currentNS
医疗行业的互操作性在改善病人护理、降低医疗服务提供者的成本以及为提供者提供更准确的情况方面发挥着重要作用。然而,由于有这么多不同的系统,数据的格式也有很多不同的方式。有许多标准被创造出来以试图解决这个问题,包括HL7v2、HL7v3和CDA,但每一种都有其缺点。
FHIR,即快速医疗互操作性资源,是一种新的医疗数据格式,旨在解决这些问题。它是由国际卫生级七组织(HL7)开发的,该组织还开发了HL7v2、HL7v3和CDA。
今天我们将探讨如何在VS代码中借助IntelliSense和自动完成功能,通过使用FHIR Schema 创建和验证FHIR资源。
第 1 步 :从FHIR 官方网站 https://www.hl7.org/fhir/下载 JSON schema file 文件用来做资源校验
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第 2 步: 创建文件夹(在这个例子中,我使用病人文件夹和病人资源),并将提取的fhir.schema.json文件复制到同一文件夹,然后从VS Code中打开文件夹.png)
第 3 步: 通过修改setting.json文件,设置VS代码以识别FHIR模式。
按CTRL+SHIFT+P并输入工作区设置JSON文件.png)
第 4 步: 在同一文件夹中创建一个新文件patient.fhir.json。
根据日期范围查询的SQL性能让你失望? 我有一个比较特别的技巧,可能会帮助你解决这个问题! (SQL开发人员讨厌这个!)*
如果你有一个类,在添加数据时记录时间戳,那么这些数据将与你的IDKEY值保持顺序--也就是说,当且仅当ID1<ID2时,表内所有ID和时间戳值的TimeStamp1<TimeStamp2--那么你可以利用这一知识来提高对时间戳范围的查询性能。 考虑一下下面这个表:
Class User.TSOrder extends %Persistent
{
Property TS as %TimeStamp;
Property Data as %String (MAXLEN=100, MINLEN=200);
Index TSIdx on TS;
Index Extent [type=bitmap, extent];
}用过去30天内的30,000,000条随机行来填充,每天将得到1,000,000条行。 现在,如果我们想查询某一天的信息,你可以这样写:
SELECT ID, TS, Data
FROM TSOrder
WHERE
TS >= '2016-07-01 00:00:00.00000' AND
TS <= '2016-07-01 23:59:59.